More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4750 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4750  protein of unknown function DUF182  100 
 
 
385 aa  751    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4952  protein of unknown function DUF182  72.07 
 
 
373 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0477  hypothetical protein  74.6 
 
 
386 aa  524  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0499  hypothetical protein  74.6 
 
 
386 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0488  hypothetical protein  74.6 
 
 
386 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3973  hypothetical protein  71.21 
 
 
398 aa  502  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.700912  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5182  hypothetical protein  69.54 
 
 
373 aa  497  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.409064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13100  xanthine and CO dehydrogenases maturation factor, XdhC/CoxF family  68.83 
 
 
374 aa  490  1e-137  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2845  xanthine dehydrogenase accessory factor, putative  68.75 
 
 
368 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.0201878 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0451  protein of unknown function DUF182  70.73 
 
 
368 aa  475  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0375071  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10381  hypothetical protein  71.74 
 
 
380 aa  477  1e-133  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000724106  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1385  hypothetical protein  68.65 
 
 
366 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0830102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1574  hypothetical protein  70 
 
 
363 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.187445  normal  0.510338 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3212  hypothetical protein  66.58 
 
 
369 aa  454  1.0000000000000001e-126  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.420632  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2978  protein of unknown function DUF182  67.02 
 
 
385 aa  451  1.0000000000000001e-126  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478076  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2033  hypothetical protein  64.96 
 
 
390 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0106371  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0633  hypothetical protein  65.33 
 
 
397 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0864  protein of unknown function DUF182  63.88 
 
 
386 aa  440  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0137317  normal  0.0522719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6196  hypothetical protein  65.68 
 
 
389 aa  435  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0286136 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4312  protein of unknown function DUF182  60.43 
 
 
372 aa  404  1e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.252346  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2392  hypothetical protein  55.15 
 
 
425 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.097794  normal  0.0809801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1688  protein of unknown function DUF182  55.03 
 
 
372 aa  339  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.121365  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2544  hypothetical protein  52.93 
 
 
385 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0754434  normal  0.0393549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1631  hypothetical protein  51.91 
 
 
357 aa  318  7.999999999999999e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.494051  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2076  protein of unknown function DUF182  51.87 
 
 
381 aa  311  9e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.46378  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0381  protein of unknown function DUF182  43.7 
 
 
367 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1880  protein of unknown function DUF182  51.18 
 
 
370 aa  298  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4732  protein of unknown function DUF182  55.56 
 
 
483 aa  276  5e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0117  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  58.5 
 
 
266 aa  257  2e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.379471  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3868  protein of unknown function DUF182  45.14 
 
 
389 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4124  protein of unknown function DUF182  44.39 
 
 
375 aa  248  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3202  protein of unknown function DUF182  45.06 
 
 
421 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1565  protein of unknown function DUF182  45.39 
 
 
402 aa  238  1e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.39267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3422  hypothetical protein  41.97 
 
 
433 aa  238  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0200  hypothetical protein  43.5 
 
 
369 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0521133  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3033  protein of unknown function DUF182  44.72 
 
 
360 aa  224  3e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112795  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2236  protein of unknown function DUF182  41.69 
 
 
356 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000550671  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1768  hypothetical protein  39.47 
 
 
342 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.852102 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0586  hypothetical protein  38.9 
 
 
323 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4564  protein of unknown function DUF182  37.67 
 
 
376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3104  hypothetical protein  37.82 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.5493  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2793  protein of unknown function DUF182  38.86 
 
 
338 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000291153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2351  hypothetical protein  37.32 
 
 
329 aa  181  2e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.92954  normal  0.47129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3214  protein of unknown function DUF182  37.25 
 
 
306 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1078  protein of unknown function DUF182  35.85 
 
 
388 aa  177  3e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0236  protein of unknown function DUF182  36.02 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.52773 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1761  hypothetical protein  37.35 
 
 
318 aa  173  5e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0865292  normal  0.275704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3138  protein of unknown function DUF182  31.9 
 
 
398 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.238524  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4357  hypothetical protein  34.97 
 
 
340 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.636145  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0359  sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  36.01 
 
 
345 aa  170  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0364  protein of unknown function DUF182  33.51 
 
 
340 aa  167  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2701  Xanthine dehydrogenase  33.51 
 
 
372 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6406  hypothetical protein  36.86 
 
 
342 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.488818 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2254  hypothetical protein  36.71 
 
 
356 aa  162  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.053952 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0207  putative lipoprotein  36.11 
 
 
453 aa  160  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3076  hypothetical protein  35.64 
 
 
341 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0419  sulfurylase small subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis / sulfurylase large subunit, molybdopterin cytosine dinucleotide biosynthesis  34.08 
 
 
340 aa  159  6e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.039658  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0423  putative lipoprotein  35.08 
 
 
338 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101145  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2443  hypothetical protein  35.64 
 
 
341 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3057  hypothetical protein  35.64 
 
 
341 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0241  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.08 
 
 
341 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0229  putative xanthine dehydrogenase accessory factor  35.28 
 
 
341 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0740256  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3102  hypothetical protein  35.66 
 
 
341 aa  159  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2968  hypothetical protein  35.66 
 
 
341 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.594237  normal  0.0976397 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0501  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.64 
 
 
244 aa  159  9e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3393  putative lipoprotein  35.56 
 
 
343 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2135  putative lipoprotein  35.56 
 
 
343 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3054  hypothetical protein  35.11 
 
 
341 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1256  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  40.24 
 
 
248 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2953  putative lipoprotein  35.36 
 
 
339 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.421056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61120  hypothetical protein  34.46 
 
 
323 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446183  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2839  xanthine and Co dehydrogenase maturation factor  43.78 
 
 
240 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0089  hypothetical protein  34.6 
 
 
342 aa  155  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1412  protein of unknown function DUF182  35.41 
 
 
343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.070466  normal  0.227253 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1348  protein of unknown function DUF182  35.41 
 
 
343 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.385014  normal  0.0761003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0385  hypothetical protein  36.94 
 
 
370 aa  151  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1893  hypothetical protein  35.64 
 
 
331 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4137  Xanthine dehydrogenase  30.81 
 
 
372 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00996475 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5263  hypothetical protein  34.18 
 
 
323 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5428  Xanthine dehydrogenase  33.33 
 
 
389 aa  149  7e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.8362 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3288  putative lipoprotein  35.57 
 
 
315 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0628  hypothetical protein  35.46 
 
 
312 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0125  hypothetical protein  30.1 
 
 
386 aa  145  1e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.1278  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3412  hypothetical protein  34.45 
 
 
334 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.261341 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4205  alanine dehydrogenase  28.61 
 
 
379 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.289956  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1378  hypothetical protein  32.96 
 
 
329 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.597595  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25830  hypothetical protein  35.2 
 
 
329 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501446  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2956  hypothetical protein  45.25 
 
 
225 aa  142  7e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00897371 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6439  hypothetical protein  34.44 
 
 
357 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0202  protein of unknown function DUF182  33.24 
 
 
333 aa  142  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1186  xanthine dehydrogenase accessory factor  41.2 
 
 
242 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0761609  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1463  hypothetical protein  36.59 
 
 
343 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.307347 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2697  hypothetical protein  36.57 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1558  hypothetical protein  32.03 
 
 
337 aa  140  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1581  hypothetical protein  31.54 
 
 
376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2200  hypothetical protein  32.42 
 
 
382 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707411 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0122  hypothetical protein  35.33 
 
 
313 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.143026  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3555  hypothetical protein  32.58 
 
 
323 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0902  hypothetical protein  30.45 
 
 
319 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.88424  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0572  hypothetical protein  32.88 
 
 
364 aa  138  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>