217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4719 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 156 aa  312  9.999999999999999e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 145 aa  93.6  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  49.07 
 
 		 175 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  47.75 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 233 aa  90.5  8e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  46 
 
 		 170 aa  89.7  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  44.55 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  47.06 
 
 		 162 aa  87.4  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  49.04 
 
 		 161 aa  86.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  50.98 
 
 		 128 aa  85.9  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  46.79 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  49.5 
 
 		 128 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 176 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 277 aa  83.6  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  39.66 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 182 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  46.08 
 
 		 140 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 191 aa  81.3  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  44 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 191 aa  79  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  46.6 
 
 		 141 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  45.54 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 229 aa  54.3  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 223 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7081  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 245 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.642165 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1195  transcriptional regulator SinR  36.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00148794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1174  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1176  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000910939  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1292  transcriptional regulator SinR  36.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00598951  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1333  transcriptional regulator SinR  36.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248023  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1224  transcriptional regulator, XRE family  36.27 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000350167  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1371  transcriptional regulator SinR  36.71 
 
 		 107 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000100854 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1148  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 99 aa  50.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.406355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 107 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1435  transcriptional regulator SinR  35.05 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000395729  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1393  transcriptional regulator SinR  35.05 
 
 		 107 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.111718  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0868  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 263 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.471001  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2735  helix-turn-helix domain-containing protein  38.33 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 191 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0075  transcriptional regulator, XRE family  37.14 
 
 		 73 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 228 aa  48.9  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4361  transcriptional regulator, XRE family  48.08 
 
 		 265 aa  48.5  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.10188 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  40.98 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.277192 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 207 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 181 aa  47.8  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 189 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0986  transcriptional regulator, XRE family  43.64 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  36.07 
 
 		 139 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 191 aa  47.4  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 181 aa  47  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  39.71 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  36.23 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3025  XRE family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  39.34 
 
 		 236 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 250 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3537  XRE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.202101 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4011  transcriptional regulator SinR  34.18 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0025622  hitchhiker  0.000000000000530943 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0772  putative transcriptional regulator, XRE family  38.18 
 
 		 199 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  42.86 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0679  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0072  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0378  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 120 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.309443  hitchhiker  0.00198984 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  39.71 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1912  putative prophage repressor  45 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1357  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 150 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.181997  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2483  transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2793  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 108 aa  45.8  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000236555  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  39.68 
 
 		 181 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1154  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  36.92 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28980  predicted transcriptional regulator  37.63 
 
 		 382 aa  45.8  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.645932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0893  XRE family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00171565  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 193 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 202 aa  45.4  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>