More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4709 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4709  phosphoserine aminotransferase  100 
 
 		 375 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0832  phosphoserine aminotransferase  71.43 
 
 		 370 aa  557  1e-158  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.588102  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0514  phosphoserine aminotransferase  72.19 
 
 		 377 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0238654  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33860  phosphoserine aminotransferase  70.13 
 
 		 376 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0847  phosphoserine aminotransferase  70.54 
 
 		 374 aa  554  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1258  phosphoserine aminotransferase  69.9 
 
 		 381 aa  552  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8790  phosphoserine aminotransferase  71.47 
 
 		 373 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5033  phosphoserine aminotransferase  72.31 
 
 		 371 aa  550  1e-155  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.621605  normal  0.399504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1718  phosphoserine aminotransferase  70.43 
 
 		 395 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.017199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1004  Phosphoserine aminotransferase-like protein  69.07 
 
 		 369 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0246  phosphoserine aminotransferase  69.54 
 
 		 373 aa  541  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.132433  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10901  phosphoserine aminotransferase  70.29 
 
 		 376 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7228  phosphoserine aminotransferase  70.93 
 
 		 374 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0829  phosphoserine aminotransferase  70.54 
 
 		 370 aa  531  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.726132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0082  phosphoserine aminotransferase  70.4 
 
 		 374 aa  533  1e-150  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0519  phosphoserine aminotransferase  69.33 
 
 		 370 aa  529  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.300823  normal  0.0573772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4464  phosphoserine aminotransferase  71.27 
 
 		 370 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4847  phosphoserine aminotransferase  71.27 
 
 		 370 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.599568  normal  0.0428667 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4551  phosphoserine aminotransferase  71.27 
 
 		 370 aa  521  1e-147  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.413402  normal  0.39579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4171  phosphoserine aminotransferase  66.67 
 
 		 376 aa  511  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0325  phosphoserine aminotransferase  68.8 
 
 		 372 aa  510  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349645  normal  0.0459701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0114  phosphoserine aminotransferase  65.58 
 
 		 377 aa  510  1e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04180  phosphoserine aminotransferase  65.87 
 
 		 375 aa  503  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0305971  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0510  phosphoserine aminotransferase  65.07 
 
 		 375 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00655495  hitchhiker  0.00256557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30790  phosphoserine aminotransferase  64.42 
 
 		 378 aa  487  1e-136  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.514499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0422  phosphoserine aminotransferase  62.67 
 
 		 417 aa  483  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0793  phosphoserine aminotransferase  62.93 
 
 		 376 aa  482  1e-135  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371607  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0910  phosphoserine aminotransferase  61.46 
 
 		 376 aa  474  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.412993 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13530  phosphoserine aminotransferase  61.68 
 
 		 387 aa  466  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.39837  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1990  phosphoserine aminotransferase  59.41 
 
 		 372 aa  464  1e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0730  phosphoserine aminotransferase  64.59 
 
 		 374 aa  464  1e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.835116  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3591  phosphoserine aminotransferase  64.88 
 
 		 385 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.465609  normal  0.244351 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0771  phosphoserine aminotransferase  61.35 
 
 		 393 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0880  phosphoserine aminotransferase  62.67 
 
 		 378 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00411134  normal  0.22946 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2846  phosphoserine aminotransferase  61.33 
 
 		 379 aa  441  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1783  phosphoserine aminotransferase  58.36 
 
 		 380 aa  429  1e-119  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0557  phosphoserine aminotransferase  60.8 
 
 		 369 aa  428  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.6132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1532  phosphoserine aminotransferase  54.93 
 
 		 382 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0020  aminotransferase class V  44.72 
 
 		 373 aa  293  4e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0711  phosphoserine transaminase  27.72 
 
 		 383 aa  128  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000109089 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1073  aminotransferase class V  26.85 
 
 		 363 aa  104  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.662635  normal  0.844475 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1381  phosphoserine aminotransferase  28.05 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.705513 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0555  phosphoserine aminotransferase  29.35 
 
 		 410 aa  98.6  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1332  phosphoserine aminotransferase  26.34 
 
 		 371 aa  96.7  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2626  Alanine--glyoxylate transaminase  27.62 
 
 		 375 aa  95.9  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.506979  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2704  phosphoserine aminotransferase  25.84 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0866  alanine--glyoxylate transaminase  27.07 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177068  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4691  aminotransferase class V  26 
 
 		 357 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3173  aminotransferase, class V  27.73 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000995852  normal  0.606873 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0260  phosphoserine aminotransferase  27.76 
 
 		 389 aa  93.2  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2651  phosphoserine aminotransferase  28.61 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.311061  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0995  phosphoserine aminotransferase  24.79 
 
 		 361 aa  93.2  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3345  Alanine--glyoxylate transaminase  26.54 
 
 		 355 aa  92.4  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000754514  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5113  aminotransferase class V  24.18 
 
 		 352 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.232116 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2619  phosphoserine aminotransferase  26.51 
 
 		 392 aa  92  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.790284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2434  aminotransferase class V  27.27 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1351  phosphoserine aminotransferase  27.85 
 
 		 385 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3260  phosphoserine aminotransferase, putative  26.8 
 
 		 357 aa  89.7  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0451268  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1687  phosphoserine aminotransferase  28.68 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1631  phosphoserine aminotransferase  28.68 
 
 		 391 aa  89.7  8e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.840539  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0019  phosphoserine aminotransferase  27.85 
 
 		 385 aa  89.4  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.625481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0508  phosphoserine aminotransferase  25.9 
 
 		 374 aa  89.7  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.957618  normal  0.349025 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3596  phosphoserine aminotransferase  26.91 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1759  phosphoserine aminotransferase  27.06 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4468  phosphoserine aminotransferase  28.61 
 
 		 395 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0805419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3193  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1118  phosphoserine aminotransferase  27.6 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.837238  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3162  phosphoserine aminotransferase  26.02 
 
 		 390 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4686  phosphoserine aminotransferase  27.03 
 
 		 385 aa  85.1  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0966475  normal  0.103743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1270  phosphoserine aminotransferase  26.75 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.722575  normal  0.0220026 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4579  phosphoserine aminotransferase  23.68 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000160592  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1088  Alanine--glyoxylate transaminase  26.1 
 
 		 370 aa  84  0.000000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42458  phosphoserine transaminase  26.2 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.809086  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2679  phosphoserine aminotransferase  25.94 
 
 		 379 aa  83.2  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1228  phosphoserine aminotransferase  28.35 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.858979  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3487  phosphoserine aminotransferase  24.61 
 
 		 392 aa  81.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.146301 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1413  phosphoserine aminotransferase  25.33 
 
 		 381 aa  81.3  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2692  aminotransferase class V  25.68 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.221383  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1876  aminotransferase class V  26.37 
 
 		 373 aa  81.3  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.544025  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0009  phosphoserine aminotransferase  27.06 
 
 		 385 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00470966 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1420  aminotransferase class V  24.86 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0813  phosphoserine aminotransferase  28.23 
 
 		 384 aa  80.9  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1825  phosphoserine aminotransferase  27.59 
 
 		 390 aa  80.5  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0751  aminotransferase class V  26.1 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000622725 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1314  phosphoserine aminotransferase  27.08 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.334205 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4790  phosphoserine aminotransferase  28.06 
 
 		 390 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2969  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0059  aminotransferase class V  24.73 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3317  phosphoserine aminotransferase  27.66 
 
 		 384 aa  78.6  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.904643 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3020  phosphoserine aminotransferase  27.25 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.285129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2137  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 390 aa  77.4  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1278  phosphoserine aminotransferase  24.54 
 
 		 360 aa  77.4  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3906  phosphoserine aminotransferase  26.56 
 
 		 389 aa  77.4  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1203  phosphoserine aminotransferase  26.05 
 
 		 391 aa  77  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.509685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0638  phosphoserine aminotransferase  25.13 
 
 		 391 aa  76.6  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.612941  normal  0.204061 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0060  aminotransferase, class V  23.27 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.138135  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1171  phosphoserine aminotransferase  24.35 
 
 		 392 aa  76.3  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0861672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0736  aminotransferase class V  25.14 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1687  phosphoserine aminotransferase  24.04 
 
 		 360 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0949  phosphoserine aminotransferase  25 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>