More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4703 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  76.35 
 
 		 437 aa  699    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  75.47 
 
 		 437 aa  685    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  73.22 
 
 		 427 aa  669    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  100 
 
 		 463 aa  950    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  74.02 
 
 		 434 aa  679    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  73.29 
 
 		 434 aa  662    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  72.99 
 
 		 427 aa  663    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  77.01 
 
 		 438 aa  704    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  74.88 
 
 		 432 aa  667    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  73.18 
 
 		 431 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  74.02 
 
 		 434 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  75.35 
 
 		 440 aa  679    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  73.51 
 
 		 427 aa  650    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  75.18 
 
 		 441 aa  671    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  73.52 
 
 		 428 aa  652    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  74.02 
 
 		 434 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  72.51 
 
 		 427 aa  652    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  74 
 
 		 434 aa  670    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  67.59 
 
 		 436 aa  620  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  65.41 
 
 		 450 aa  598  1e-170  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  65.65 
 
 		 432 aa  597  1e-169  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  65.67 
 
 		 431 aa  594  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  67.63 
 
 		 428 aa  584  1.0000000000000001e-165  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  64.78 
 
 		 440 aa  580  1e-164  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  62.67 
 
 		 436 aa  570  1e-161  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  63.36 
 
 		 428 aa  555  1e-157  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  60.72 
 
 		 425 aa  548  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  58.59 
 
 		 428 aa  541  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  59.09 
 
 		 425 aa  538  9.999999999999999e-153  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  59.19 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  57.75 
 
 		 434 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  58.35 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  56.81 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  55.94 
 
 		 434 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  56.7 
 
 		 425 aa  512  1e-144  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  56.81 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  55.02 
 
 		 431 aa  513  1e-144  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  57.04 
 
 		 434 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  56.64 
 
 		 436 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1524  citrate synthase I  56.84 
 
 		 430 aa  509  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.802094  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  57.31 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  56.34 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  55.92 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  56.6 
 
 		 430 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_004310  BR1148  type II citrate synthase  55.87 
 
 		 430 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1409  citrate synthase I  56 
 
 		 429 aa  505  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.423182 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1731  citrate synthase I  56.24 
 
 		 439 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1596  type II citrate synthase  55.94 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218131  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  57.01 
 
 		 428 aa  506  9.999999999999999e-143  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0829  citrate synthase I  56.71 
 
 		 427 aa  505  9.999999999999999e-143  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.292623  hitchhiker  0.00485559 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1646  type II citrate synthase  55.94 
 
 		 429 aa  507  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0982845  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  56.54 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  56.7 
 
 		 428 aa  505  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  56.1 
 
 		 430 aa  507  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1106  type II citrate synthase  55.87 
 
 		 435 aa  505  9.999999999999999e-143  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  56.09 
 
 		 429 aa  503  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1789  type II citrate synthase  55.63 
 
 		 429 aa  502  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.069091  hitchhiker  0.00547545 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  55.63 
 
 		 429 aa  501  1e-141  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  56.32 
 
 		 429 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  54.93 
 
 		 433 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  54.57 
 
 		 446 aa  501  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  55.21 
 
 		 434 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  55.71 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  56.34 
 
 		 431 aa  498  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  56.81 
 
 		 430 aa  501  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  55.06 
 
 		 427 aa  497  1e-139  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1144  type II citrate synthase  54.69 
 
 		 429 aa  496  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.300068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  56.1 
 
 		 428 aa  496  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4350  type II citrate synthase  55.24 
 
 		 436 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1600  citrate synthase  56.09 
 
 		 433 aa  495  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  55.97 
 
 		 432 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  55.35 
 
 		 433 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  55.58 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  55.58 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  55.58 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  55.58 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  55.32 
 
 		 433 aa  491  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  55.48 
 
 		 436 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  55.58 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  55.58 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1994  citrate synthase  55.63 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.189666  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  54.63 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  54.86 
 
 		 437 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  55.35 
 
 		 433 aa  492  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  55.24 
 
 		 436 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  55.48 
 
 		 436 aa  491  9.999999999999999e-139  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  55.58 
 
 		 433 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2752  citrate synthase  57.28 
 
 		 432 aa  492  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.816634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  55.04 
 
 		 432 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  54.69 
 
 		 429 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  55.06 
 
 		 429 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  56.22 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  54.78 
 
 		 438 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  54.65 
 
 		 433 aa  490  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  55.63 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  55.12 
 
 		 433 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  55.35 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  54.46 
 
 		 433 aa  489  1e-137  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  55.09 
 
 		 437 aa  491  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  55.01 
 
 		 436 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>