More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4696 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4696  GtrA family protein  100 
 
 
435 aa  865    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0318  glycosyl transferase family protein  61.56 
 
 
460 aa  498  1e-140  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.163788  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6500  glycosyl transferase family protein  59.14 
 
 
496 aa  489  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.346473  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5252  glycosyl transferase family 2  62.5 
 
 
416 aa  482  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3923  glycosyl transferase family protein  66.84 
 
 
421 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.496701  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3997  glycosyl transferase family protein  66.84 
 
 
421 aa  479  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.254168  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4426  glycosyl transferase family protein  65.19 
 
 
437 aa  475  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739527  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1721  glycosyl transferase family 2  65.98 
 
 
424 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3938  glycosyl transferase family protein  66.58 
 
 
421 aa  478  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.24037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2133  glycosyl transferase family protein  66.32 
 
 
410 aa  468  9.999999999999999e-131  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00135556  hitchhiker  0.0086677 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0828  glycosyl transferase family 2  62.34 
 
 
422 aa  460  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0194792  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1939  glycosyl transferase family 2  62.94 
 
 
415 aa  456  1e-127  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314426  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2268  glycosyl transferase family protein  59.47 
 
 
411 aa  448  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.371965  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2280  glycosyl transferase family protein  64.77 
 
 
409 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.851942  decreased coverage  0.00376489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  60.99 
 
 
402 aa  438  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2627  glycosyl transferase family 2  57.62 
 
 
412 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.97683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0439  GtrA family protein  57.97 
 
 
425 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0902  GtrA family protein  59.47 
 
 
428 aa  395  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258028  normal  0.0796887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4506  glycosyl transferase family 2  56.7 
 
 
378 aa  329  7e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1923  glycosyl transferase family 2  66.53 
 
 
266 aa  314  1.9999999999999998e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0651  glycosyl transferase family protein  60.77 
 
 
333 aa  302  9e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2367  family 2 glycosyl transferase  41.96 
 
 
389 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00481537 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4090  glycosyl transferase family 2  50.94 
 
 
441 aa  260  4e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.157958  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3989  glycosyl transferase family protein  51.95 
 
 
238 aa  234  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.246532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3686  glycosyl transferase family 2  54.71 
 
 
326 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.82646  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1598  glycosyl transferase family protein  41.48 
 
 
237 aa  164  3e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1493  hypothetical protein  37.39 
 
 
238 aa  161  2e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.055606 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 
606 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  40.37 
 
 
613 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0505  dolichol-P-glucose synthetase  37.29 
 
 
574 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0724  glycosyl transferase family protein  37.07 
 
 
239 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0205855  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0520  glycosyl transferase family 2  37.71 
 
 
238 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0104  glycosyl transferase family 2  32.68 
 
 
255 aa  137  4e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0693  glycosyl transferase family protein  34.5 
 
 
238 aa  126  6e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0904184  normal  0.159851 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  35.58 
 
 
276 aa  126  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5302  glycosyl transferase family protein  35.48 
 
 
380 aa  124  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157801  normal  0.641383 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2693  glycosyl transferase family protein  33.61 
 
 
273 aa  120  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.756814  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  34.87 
 
 
276 aa  118  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0505  glycosyl transferase family protein  30.09 
 
 
262 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0229  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 
243 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3213  glycosyl transferase family 2  32.62 
 
 
256 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.595641 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57548  UDP-glucose:dolichyl-phosphate glucosyltransferase  29.28 
 
 
325 aa  114  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.547807  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1164  glycosyl transferase family protein  33.75 
 
 
320 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.164128  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0242  hypothetical protein  31.44 
 
 
253 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000022045  hitchhiker  0.00000000126838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1758  glycosyltransferase  33.33 
 
 
259 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2595  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
256 aa  109  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00230887  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0963  glycosyl transferase family protein  26.45 
 
 
238 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3994  glycosyl transferase family 2  32.54 
 
 
267 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.117924  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1049  glycosyl transferase family 2  31.31 
 
 
256 aa  105  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3137  glycosyl transferase family 2  31.09 
 
 
261 aa  103  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2199  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
289 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0107343 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.53 
 
 
264 aa  99  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
245 aa  98.2  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  36.06 
 
 
247 aa  99  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0761  glycosyl transferase family protein  26.38 
 
 
272 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.63 
 
 
248 aa  97.8  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  33.82 
 
 
246 aa  97.4  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2184  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
273 aa  96.3  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2556  GtrA family protein  42.86 
 
 
168 aa  95.9  1e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0257163  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1870  glycosyl transferase family protein  33.47 
 
 
237 aa  95.1  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.28 
 
 
809 aa  93.2  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2145  glycosyl transferase family protein  31.36 
 
 
236 aa  93.2  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2293  GtrA family protein  40.62 
 
 
163 aa  92.4  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000202396 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4174  apolipoprotein N-acyltransferase  32.78 
 
 
883 aa  92  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0124093  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1908  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  29.46 
 
 
780 aa  92.4  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.69 
 
 
258 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19705  dolichyl-phosphate mannosyltransferase  28.64 
 
 
236 aa  91.3  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.872705  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1759  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.19 
 
 
255 aa  90.9  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.746361  normal  0.491982 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2389  glycosyl transferase family protein  34.69 
 
 
262 aa  89.7  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0758603  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.48 
 
 
252 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  26.75 
 
 
318 aa  88.6  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0517  glycosyl transferase family 2  28.76 
 
 
243 aa  89  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  35.47 
 
 
246 aa  89  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  28.51 
 
 
314 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  36.06 
 
 
263 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.58 
 
 
257 aa  87.8  3e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1745  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.22 
 
 
255 aa  88.2  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.828435  normal  0.0311982 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2237  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
267 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2350  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.78 
 
 
248 aa  87  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000669631  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0073  glycosyl transferase family 2  31.92 
 
 
232 aa  87  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1769  glycosyl transferase family protein  31.48 
 
 
586 aa  86.7  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.162316  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2667  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.56 
 
 
257 aa  87  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2270  glycosyl transferase family protein  37.2 
 
 
262 aa  86.3  9e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0541256  normal  0.0615323 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.78 
 
 
305 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4403  glycosyl transferase family 2  28.99 
 
 
255 aa  85.9  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.486118  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3761  glycosyl transferase family protein  32.77 
 
 
251 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000031938  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1123  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 
251 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.795222 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.6 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0076  glycosyl transferase family 2  31.33 
 
 
271 aa  84.3  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.737127 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.99 
 
 
246 aa  84.3  0.000000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  32.69 
 
 
261 aa  83.6  0.000000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 
340 aa  82.8  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2530  glycosyl transferase family protein  29.73 
 
 
231 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18470  glycosyl transferase  35.55 
 
 
257 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  30.54 
 
 
241 aa  82  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0429  glycosyl transferase  30.95 
 
 
328 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.541189  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2588  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.2 
 
 
245 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0786175 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2486  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  33.81 
 
 
272 aa  80.9  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 
307 aa  80.9  0.00000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1789  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.77 
 
 
239 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>