More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4688 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4688  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3695  response regulator receiver  75.32 
 
 		 236 aa  357  7e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.795948  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3036  two component transcriptional regulator, winged helix family  74.58 
 
 		 273 aa  355  2.9999999999999997e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  69.92 
 
 		 252 aa  350  2e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  69.39 
 
 		 248 aa  345  3e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1724  two component transcriptional regulator, winged helix family  77.25 
 
 		 243 aa  345  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0321  two component transcriptional regulator  74.35 
 
 		 406 aa  344  8.999999999999999e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32700  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  67.73 
 
 		 271 aa  333  1e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.485424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4429  two component transcriptional regulator  72.06 
 
 		 250 aa  333  2e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.133228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2266  two component transcriptional regulator  72.36 
 
 		 249 aa  330  2e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00896474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3926  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4000  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3941  two component transcriptional regulator  70.61 
 
 		 254 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0990172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6496  two component transcriptional regulator  75.11 
 
 		 231 aa  323  1e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00132974  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13797  two component transcriptional regulatory protein  70.42 
 
 		 286 aa  320  9.999999999999999e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.173423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5255  two component transcriptional regulator, winged helix family  70.09 
 
 		 242 aa  317  9e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0804  two component transcriptional regulator, winged helix family  65.57 
 
 		 246 aa  316  3e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0655  two component transcriptional regulator  63.93 
 
 		 246 aa  309  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11051  two component system transcriptional regulator trcR  64.19 
 
 		 257 aa  288  7e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  62.01 
 
 		 255 aa  287  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22060  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  57.09 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0729677  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0379  two component transcriptional regulator, winged helix family  60 
 
 		 233 aa  275  7e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.605912  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0569  two component transcriptional regulator, winged helix family  61.86 
 
 		 248 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3620  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.92 
 
 		 239 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0253056  normal  0.477246 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.44 
 
 		 236 aa  267  8.999999999999999e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.32 
 
 		 244 aa  267  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0717  two component transcriptional regulator, winged helix family  59.83 
 
 		 242 aa  266  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000387016 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  61.88 
 
 		 239 aa  266  2.9999999999999995e-70  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.66 
 
 		 231 aa  262  3e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  58.52 
 
 		 239 aa  261  6.999999999999999e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.26 
 
 		 243 aa  260  2e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.08 
 
 		 236 aa  260  2e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1449  two component transcriptional regulator  58.11 
 
 		 246 aa  259  3e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.566781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  58.87 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0558  two component transcriptional regulator, winged helix family  57.69 
 
 		 237 aa  255  6e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  56.95 
 
 		 238 aa  253  3e-66  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0822  response regulator receiver  52.86 
 
 		 241 aa  251  6e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0530683  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4657  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.05 
 
 		 240 aa  251  9.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0219  two component transcriptional regulator  59.38 
 
 		 237 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.127265  hitchhiker  0.00333518 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  57.33 
 
 		 233 aa  249  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0578  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.76 
 
 		 244 aa  249  3e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4590  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4678  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4973  two component transcriptional regulator  56.05 
 
 		 239 aa  248  5e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  56.89 
 
 		 233 aa  248  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3631  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.05 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4916  response regulator receiver protein  58.15 
 
 		 233 aa  245  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0234  two component transcriptional regulator  54.22 
 
 		 242 aa  244  8e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.925989 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  55.28 
 
 		 241 aa  243  1.9999999999999999e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5175  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 		 236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1581  two component transcriptional regulator  54.26 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0899  two component transcriptional regulator, winged helix family  58.87 
 
 		 236 aa  243  3e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.383063 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10772  two component system response transcriptional positive regulator phoP  53.81 
 
 		 247 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.864575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6588  two component transcriptional regulator  52.89 
 
 		 229 aa  238  6.999999999999999e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.13217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2242  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.22 
 
 		 224 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.415885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8879  response regulator receiver protein  53.81 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.103439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3340  two component transcriptional regulator, winged helix family  54.22 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0454745 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0005  response regulator  52.52 
 
 		 243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.201532  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  51.33 
 
 		 239 aa  229  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  53.6 
 
 		 234 aa  228  7e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8872  response regulator receiver protein  54.95 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.347509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0720  response regulator receiver domain protein  50.86 
 
 		 246 aa  228  1e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.351492 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  50.44 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5144  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.49 
 
 		 236 aa  225  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204078  normal  0.858106 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2056  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.413172  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2212  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1478  two component transcriptional regulator  50.43 
 
 		 240 aa  223  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000111909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2240  DNA-binding response regulator  47.98 
 
 		 227 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.85177e-28 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3267  winged helix family two component transcriptional regulator  55.16 
 
 		 229 aa  223  2e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0891778  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4301  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681825  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4387  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0316317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4681  two component transcriptional regulator  50.67 
 
 		 230 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.354926 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  50.66 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0615  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 228 aa  222  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0841359  normal  0.719107 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3411  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 224 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.591115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4408  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.7 
 
 		 230 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2194  DNA-binding response regulator  46.64 
 
 		 227 aa  219  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00702475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3286  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 228 aa  218  5e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167791  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0389  winged helix family two component transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  219  5e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.667669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5311  two component transcriptional regulator  46.44 
 
 		 246 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.554395  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1887  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  217  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.882564  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4844  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 231 aa  216  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.312171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10999  two component response transcriptional regulatory protein MprA  49.11 
 
 		 230 aa  215  5.9999999999999996e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000188235  normal  0.671639 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2632  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.44 
 
 		 229 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  48.88 
 
 		 236 aa  214  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1595  two component transcriptional regulator  50.89 
 
 		 227 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.526383  normal  0.570373 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2487  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 224 aa  211  7.999999999999999e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.431556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1351  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 225 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00188361  unclonable  0.0000000206018 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2290  two component transcriptional regulator  48.43 
 
 		 224 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1435  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.55 
 
 		 233 aa  208  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3017  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0208  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.37 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1384  two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00801111  normal  0.0620226 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1418  response regulator receiver  47.75 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0582944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6397  response regulator receiver protein  48.29 
 
 		 237 aa  205  6e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.680662  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1098  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0759  two component transcriptional regulator  45.05 
 
 		 223 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2033  DNA-binding response regulator  45.33 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.725953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.98 
 
 		 225 aa  201  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1823  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.02 
 
 		 241 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506413  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>