230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4620 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4620  protein of unknown function DUF45  100 
 
 
242 aa  495  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.212345 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2675  hypothetical protein  46.67 
 
 
243 aa  232  4.0000000000000004e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.49786 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2198  hypothetical protein  46.35 
 
 
247 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.403347  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0947  hypothetical protein  43.98 
 
 
245 aa  227  1e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000214537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0860  hypothetical protein  42.49 
 
 
238 aa  217  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1774  zinc metalloprotease  44.92 
 
 
238 aa  204  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0431  protein of unknown function DUF45  41.28 
 
 
239 aa  204  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0244  hypothetical protein  40.17 
 
 
253 aa  193  2e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0365  hypothetical protein  35.81 
 
 
232 aa  192  4e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0669057  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0906  protein of unknown function DUF45  40.57 
 
 
244 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.876537  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0760  hypothetical protein  40.57 
 
 
244 aa  182  3e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0401  hypothetical protein  40.89 
 
 
233 aa  182  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0555  zinc metalloprotease  36.17 
 
 
239 aa  162  3e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0652798  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0435  hypothetical protein  32.29 
 
 
235 aa  155  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0459  hypothetical protein  30.87 
 
 
235 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0543  peptidase S26A, signal peptidase I  33.91 
 
 
236 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00150578  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1591  protein of unknown function DUF45  42.75 
 
 
153 aa  124  2e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.961397  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0617  hypothetical protein  29.55 
 
 
222 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.236846  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2550  hypothetical protein  25.33 
 
 
231 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.52441  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0949  hypothetical protein  27.03 
 
 
219 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0658473  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1858  protein of unknown function DUF45  27.36 
 
 
226 aa  109  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000912457  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0984  zinc metalloprotease  26.87 
 
 
221 aa  108  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0977  protein of unknown function DUF45  27.44 
 
 
259 aa  107  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1098  hypothetical protein  26.17 
 
 
222 aa  102  4e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1416  putative metal-dependent hydrolase  29.46 
 
 
268 aa  102  7e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04860  predicted metal-dependent hydrolase  29.55 
 
 
184 aa  101  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2668  protein of unknown function DUF45  32.88 
 
 
202 aa  101  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.255358  normal  0.761746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07420  predicted metal-dependent hydrolase  31.14 
 
 
198 aa  99  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.654381  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1819  hypothetical protein  25.23 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0083  hypothetical protein  25.11 
 
 
222 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.000843512  decreased coverage  0.0000753316 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4201  protein of unknown function DUF45  26.46 
 
 
245 aa  93.2  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2141  hypothetical protein  25.21 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0199813 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0542  hypothetical protein  28.3 
 
 
243 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2082  hypothetical protein  22.65 
 
 
222 aa  86.3  4e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1894  hypothetical protein  29.49 
 
 
242 aa  85.9  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.470997  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2889  hypothetical protein  28.88 
 
 
261 aa  84  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.653746  normal  0.363578 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0647  hypothetical protein  25 
 
 
215 aa  82  0.000000000000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.764633  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2910  hypothetical protein  28.64 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1843  protein of unknown function DUF45  25.42 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.224767 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1800  hypothetical protein  22.78 
 
 
222 aa  80.1  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.404735  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06805  hypothetical protein  29.17 
 
 
258 aa  79.7  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2343  hypothetical protein  28.57 
 
 
238 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.781257  normal  0.0217963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0015  hypothetical protein  26.74 
 
 
247 aa  79  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000114472  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1114  hypothetical protein  28.15 
 
 
254 aa  79  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0156  hypothetical protein  27.19 
 
 
270 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2595  hypothetical protein  23.66 
 
 
238 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.23171  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2542  protein of unknown function DUF45  26.15 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.65103  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0220  hypothetical protein  24.48 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0151  hypothetical protein  25.28 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1632  protein of unknown function DUF45  28.85 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0535  hypothetical protein  23.25 
 
 
206 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2484  hypothetical protein  26.87 
 
 
245 aa  73.9  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.186682  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0568  hypothetical protein  28.79 
 
 
235 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000566322 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1102  zinc metalloprotease  24.44 
 
 
243 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00846989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0056  protein of unknown function DUF45  25.59 
 
 
238 aa  72  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2307  protein of unknown function DUF45  25.13 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04470  predicted metal-dependent hydrolase  24.55 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_159  hypothetical protein  24.86 
 
 
240 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.363835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2393  hypothetical protein  25.13 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0794  conserved hypothetical protein (DUF45 domain protein)  24.06 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0843  hypothetical protein  28.71 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.335069  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0791  hypothetical protein  28.71 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.371001  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0373  protein of unknown function DUF45  24.64 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05618  hypothetical protein  28.27 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3548  hypothetical protein  29.41 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.405363  normal  0.224983 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1164  hypothetical protein  35.78 
 
 
141 aa  67.8  0.0000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0379  hypothetical protein  26.73 
 
 
237 aa  67  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1789  hypothetical protein  24.87 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0723  hypothetical protein  28.16 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.835761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0402  hypothetical protein  30.05 
 
 
245 aa  66.2  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.95027  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1661  protein of unknown function DUF45  28.23 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.843742  normal  0.112904 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0079  zinc metalloprotease  27.55 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0200194  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0071  protein of unknown function DUF45  23.98 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1049  hypothetical protein  25.96 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1707  hypothetical protein  25.48 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.182955  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0870  protein of unknown function DUF45  22.28 
 
 
224 aa  63.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0260023  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0646  hypothetical protein  25.49 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0649  hypothetical protein  27.18 
 
 
215 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2744  hypothetical protein  20.55 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0804  zinc metalloprotease, putative  29.41 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1951  hypothetical protein  27.61 
 
 
481 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1824  hypothetical protein  21.76 
 
 
224 aa  62.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0100  hypothetical protein  25.63 
 
 
231 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.58057  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0800  hypothetical protein  23.5 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0356506  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0561  protein of unknown function DUF45  31.46 
 
 
211 aa  62  0.000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0547  hypothetical protein  30 
 
 
218 aa  61.6  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.825313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3789  hypothetical protein  25.13 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1312  hypothetical protein  23.58 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4010  hypothetical protein  24.03 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.836815 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6032  hypothetical protein  26.12 
 
 
316 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2093  hypothetical protein  26.12 
 
 
295 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.786818  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2705  hypothetical protein  26.12 
 
 
295 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.319747  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2732  hypothetical protein  26.12 
 
 
295 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0322  hypothetical protein  22.62 
 
 
235 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000118894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0369  hypothetical protein  22.73 
 
 
235 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0337  hypothetical protein  22.62 
 
 
235 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000389941  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2757  hypothetical protein  26.12 
 
 
303 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328108  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0011  hypothetical protein  21.5 
 
 
236 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2959  protein of unknown function DUF45  24.62 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3143  protein of unknown function DUF45  24.62 
 
 
227 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0570436  normal  0.976092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>