36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4598 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4598  protein of unknown function DUF1304  100 
 
 		 128 aa  239  1e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2576  hypothetical protein  62.7 
 
 		 128 aa  145  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3823  hypothetical protein  58.33 
 
 		 128 aa  135  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.314285 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1459  protein of unknown function DUF1304  60.63 
 
 		 127 aa  131  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2180  protein of unknown function DUF1304  52.76 
 
 		 127 aa  130  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.299642  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0374  hypothetical protein  58.97 
 
 		 129 aa  127  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.111718  normal  0.385258 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12650  predicted membrane protein  59.05 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.725167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1921  protein of unknown function DUF1304  64.35 
 
 		 128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.980411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0276  hypothetical protein  51.72 
 
 		 130 aa  106  9.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.75531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0073  protein of unknown function DUF1304  45.69 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0508  protein of unknown function DUF1304  54.05 
 
 		 134 aa  98.6  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4838  hypothetical protein  45.9 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1367  hypothetical protein  42.67 
 
 		 119 aa  62  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000537574 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0648  hypothetical protein  46.27 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1973  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01662  hypothetical protein  50.82 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.987782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1705  protein of unknown function DUF1304  53.57 
 
 		 117 aa  57  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.449523  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1051  hypothetical protein  45.76 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.555272  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7649  hypothetical protein  42.37 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3500  hypothetical protein  46.67 
 
 		 120 aa  52.8  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.395821  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2464  protein of unknown function DUF1304  44.62 
 
 		 116 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.283344  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1971  hypothetical protein  37.68 
 
 		 120 aa  48.9  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000233421  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3066  protein of unknown function DUF1304  48 
 
 		 116 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.269223 
 
 
-
 
NC_003296  RS05690  hypothetical protein  37.23 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04765  hypothetical protein  37.23 
 
 		 120 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4228  protein of unknown function DUF1304  36.17 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.728576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1370  protein of unknown function DUF1304  44.44 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0191403  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4116  protein of unknown function DUF1304  36.17 
 
 		 120 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.532223  normal  0.15572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2834  hypothetical protein  47.54 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.931347  hitchhiker  0.00331454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0037  hypothetical protein  44.23 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2133  hypothetical protein  37.68 
 
 		 118 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0699  protein of unknown function DUF1304  38.1 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0455556  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3957  protein of unknown function DUF1304  34.62 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1561  hypothetical protein  37.29 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.513127  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1349  protein of unknown function DUF1304  38.71 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>