More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4577 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4577  homocysteine methyltransferase  100 
 
 
320 aa  626  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12483  homocysteine methyltransferase  55.7 
 
 
302 aa  296  4e-79  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37350  homocysteine methyltransferase  54.83 
 
 
295 aa  290  2e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.493269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0866  homocysteine methyltransferase  49.67 
 
 
316 aa  242  5e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.142005  normal  0.135969 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3061  homocysteine S-methyltransferase  56.67 
 
 
314 aa  242  6e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01795  homocysteine methyltransferase  48.81 
 
 
325 aa  241  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.443349  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3471  homocysteine methyltransferase  42.95 
 
 
312 aa  229  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3344  homocysteine S-methyltransferase  45.63 
 
 
310 aa  228  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5466  homocysteine methyltransferase  40.82 
 
 
325 aa  227  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0696243  hitchhiker  0.00895387 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1535  homocysteine methyltransferase  44.97 
 
 
315 aa  227  2e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.521433  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2926  homocysteine methyltransferase  44.97 
 
 
313 aa  223  3e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0828  homocysteine methyltransferase  45.03 
 
 
311 aa  223  3e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1305  homocysteine methyltransferase  40.26 
 
 
314 aa  220  3e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.343801  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1146  homocysteine methyltransferase  45.58 
 
 
319 aa  219  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000617566 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0891  homocysteine S-methyltransferase  50.49 
 
 
303 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.784239 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1315  homocysteine S-methyltransferase  47.6 
 
 
288 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0420975  normal  0.31637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2740  homocysteine methyltransferase  48.64 
 
 
287 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1230  homocysteine S-methyltransferase  39.32 
 
 
311 aa  210  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.829907  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0628  homocysteine methyltransferase  39.48 
 
 
316 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1042  homocysteine methyltransferase  35.2 
 
 
310 aa  182  5.0000000000000004e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000341653  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03378  homocysteine S-methyltransferase (Eurofung)  29.8 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_30270  AdoMet-homocysteine methyltransferase  26.49 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39914  predicted protein  27.78 
 
 
418 aa  95.9  8e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0674804  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1598  homocysteine S-methyltransferase  29.26 
 
 
297 aa  90.9  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.296852 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2433  methionine synthase  27.99 
 
 
1236 aa  90.9  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2093  B12-dependent methionine synthase  27.27 
 
 
1227 aa  89.7  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.883808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1508  homocysteine S-methyltransferase  27.43 
 
 
334 aa  89.4  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19590  homocysteine S-methyltransferase  27.78 
 
 
819 aa  88.2  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.399567  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02520  homocysteine S-methyltransferase, putative  27.7 
 
 
381 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.115114  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2062  B12-dependent methionine synthase  27.66 
 
 
1228 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.458303  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2974  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.35 
 
 
605 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0613  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.37 
 
 
610 aa  86.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2144  methionine synthase  29.13 
 
 
1243 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.212238  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02860  B12-dependent methionine synthase  27.09 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2160  homocysteine S-methyltransferase  28.89 
 
 
310 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1187  homocysteine S-methyltransferase  28.72 
 
 
629 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0238  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.07 
 
 
609 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0627  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  32.13 
 
 
610 aa  83.6  0.000000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.07944e-34 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0325  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  24.91 
 
 
605 aa  82.8  0.000000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2722  methionine synthase I (cobalamin-dependent) methyltransferase subunit  28.98 
 
 
801 aa  82.4  0.000000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2102  B12-dependent methionine synthase  26.44 
 
 
1249 aa  82.4  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.876734  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4224  B12-dependent methionine synthase  28.66 
 
 
1293 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.572954  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1336  B12-dependent methionine synthase  29.97 
 
 
1226 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.262937  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2492  methionine synthase (B12-dependent)  27.62 
 
 
1224 aa  81.6  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.494606  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1861  homocysteine S-methyltransferase  25.32 
 
 
434 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0658  homocysteine S-methyltransferase family protein  31.55 
 
 
311 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.778946  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1211  homocysteine S-methyltransferase  26.11 
 
 
807 aa  80.1  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0179968  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00664  homocysteine S-methyltransferase family protein  28.16 
 
 
305 aa  80.1  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2631  B12-dependent methionine synthase  29.17 
 
 
1244 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0960245  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0315  B12-dependent methionine synthase  26.52 
 
 
1225 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000170465 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0112  B12-dependent methionine synthase  30.58 
 
 
1259 aa  79.7  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.937971  normal  0.535785 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2115  methionine synthase (B12-dependent)  29.28 
 
 
841 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.356238  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2779  homocysteine S-methyltransferase  33.76 
 
 
308 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3407  homocysteine S-methyltransferase  25.79 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174744  normal  0.0184405 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0234  B12-dependent methionine synthase  26.45 
 
 
1237 aa  78.6  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.545849  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0442  B12-dependent methionine synthase  26.13 
 
 
1226 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0222  B12-dependent methionine synthase  25.97 
 
 
1227 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.145544 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2463  B12-dependent methionine synthase  24.77 
 
 
1240 aa  78.2  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0892  homocysteine S-methyltransferase  24.25 
 
 
339 aa  77.8  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0708  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  30.36 
 
 
604 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.537957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0141  homocysteine S-methyltransferase  31.77 
 
 
816 aa  77.8  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000403798  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0118  methionine synthase (B12-dependent)  26.78 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0692  homocysteine S-methyltransferase  30.91 
 
 
311 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0245772 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0392  homocysteine S-methyltransferase  29.37 
 
 
305 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.108543  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1123  B12-dependent methionine synthase  28.53 
 
 
1246 aa  76.6  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.833597 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2808  B12-dependent methionine synthase  26.35 
 
 
1226 aa  76.3  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0324  homocysteine S-methyltransferase  26.35 
 
 
413 aa  76.6  0.0000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0087  methionine synthase (B12-dependent)  26.75 
 
 
355 aa  76.3  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.398145  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2815  homocysteine S-methyltransferase  26.67 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0476  homocysteine S-methyltransferase  30.72 
 
 
818 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0411261 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1692  B12-dependent methionine synthase  27.03 
 
 
1224 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0182  methionine synthase  26.59 
 
 
1263 aa  75.9  0.0000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2832  B12-dependent methionine synthase  28.02 
 
 
1271 aa  75.9  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.192266 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1889  B12-dependent methionine synthase  26.95 
 
 
1245 aa  75.5  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2611  homocysteine S-methyltransferase  26.11 
 
 
363 aa  75.1  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.186281 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1497  homocysteine S-methyltransferase  30.23 
 
 
310 aa  75.5  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.191799  normal  0.658864 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1413  homocysteine S-methyltransferase  27.69 
 
 
806 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0607109  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4435  B12-dependent methionine synthase  26.22 
 
 
1227 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1617  homocysteine S-methyltransferase  28.62 
 
 
1189 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0504  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  31.56 
 
 
605 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0120544  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3211  B12-dependent methionine synthase  28.23 
 
 
1264 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.509178 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1894  B12-dependent methionine synthase  27.36 
 
 
1229 aa  73.9  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4401  B12-dependent methionine synthase  26.22 
 
 
1227 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.90979  normal  0.334358 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1643  B12-dependent methionine synthase  30 
 
 
1262 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0494405 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3161  B12-dependent methionine synthase  28.23 
 
 
1264 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.95608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5489  B12-dependent methionine synthase  26.19 
 
 
1227 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01233  methionine synthase  26.52 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0459633  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0295  5-methyltetrahydrofolate--homocysteine methyltransferase  27.14 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0298  B12-dependent methionine synthase  25.07 
 
 
1230 aa  73.6  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.183205  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1277  homocysteine S-methyltransferase  30.57 
 
 
300 aa  73.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0441893 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1526  B12-dependent methionine synthase  25.29 
 
 
1232 aa  73.6  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0454  B12-dependent methionine synthase  26.95 
 
 
1228 aa  73.2  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0341811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3747  homocysteine S-methyltransferase  32.92 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0657  methionine synthase  26.95 
 
 
1238 aa  73.2  0.000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29240  B12-dependent methionine synthase  26.33 
 
 
1278 aa  73.2  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1524  bifunctional homocysteine S-methyltransferase/5,10-methylenetetrahydrofolate reductase protein  28.18 
 
 
615 aa  72.8  0.000000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4599  B12-dependent methionine synthase  26.05 
 
 
1227 aa  72.8  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972582  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4523  B12-dependent methionine synthase  26.09 
 
 
1227 aa  72.4  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.413038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1101  B12-dependent methionine synthase  26.09 
 
 
1230 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.875071  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3923  B12-dependent methionine synthase  24.78 
 
 
1230 aa  72.4  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>