More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4543 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4543  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 245 aa  498  1e-140  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  67.62 
 
 		 245 aa  329  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  62.3 
 
 		 246 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  62.14 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  59.43 
 
 		 245 aa  276  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  61.07 
 
 		 247 aa  275  5e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4015  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  58.92 
 
 		 243 aa  269  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2603  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  59.34 
 
 		 243 aa  268  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.597561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0958  transcriptional regulator, GntR family  53.94 
 
 		 246 aa  256  2e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1723  transcriptional regulator, GntR family  54.17 
 
 		 246 aa  254  6e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2741  transcriptional regulator, GntR family  57.5 
 
 		 242 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.0041351  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1364  transcriptional regulator, GntR family  53.53 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0836  GntR family transcriptional regulator  52.28 
 
 		 246 aa  242  5e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.840865  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3590  UbiC transcription regulator-associated domain protein  53.69 
 
 		 247 aa  236  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.168054  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0724  transcriptional regulator, GntR family  51.26 
 
 		 259 aa  225  5.0000000000000005e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.981034 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00770  transcriptional regulator, GntR family  50.21 
 
 		 255 aa  224  9e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1730  GntR family transcriptional regulator  50.63 
 
 		 252 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.782156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4190  transcriptional regulator, GntR family  47.13 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.86 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  34.6 
 
 		 243 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 243 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  35.59 
 
 		 260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  38.33 
 
 		 243 aa  135  9e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 248 aa  122  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  31.51 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 266 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 246 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  34.76 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1304  UbiC transcription regulator-associated domain protein  32.76 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 268 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  36.24 
 
 		 269 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 249 aa  115  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  31.84 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6236  transcriptional regulator GntR family  36.68 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.83701  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.95 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3308  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2049  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 245 aa  112  5e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  30.53 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  36.12 
 
 		 244 aa  112  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1002  transcriptional regulator, GntR family  30.8 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 247 aa  112  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  30.71 
 
 		 244 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.53 
 
 		 240 aa  111  9e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  32.08 
 
 		 241 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  30.09 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  30.09 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.09 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.09 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  34.33 
 
 		 239 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  30.09 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3410  transcriptional regulator, GntR family  28.1 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000405117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1554  GntR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00139668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 246 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2509  GntR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 257 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.31596  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3995  putative GntR-family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4011  putative GntR-family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4066  putative GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.980684 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4116  putative GntR family transcriptional regulator  30.42 
 
 		 247 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  30.54 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  30.74 
 
 		 242 aa  105  5e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02029  predicted DNA-binding transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1556  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.868549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1546  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.599104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2237  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1138  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.252402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0964  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3079  transcriptional regulator, GntR family  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.104176 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01993  hypothetical protein  29.91 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2388  GntR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 248 aa  105  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0753  UbiC transcription regulator-associated domain protein  29.71 
 
 		 243 aa  105  8e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1472  GntR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000013898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2866  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 251 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3960  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.130566  normal  0.0173208 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3846  transcriptional regulator, GntR family  32.93 
 
 		 278 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00362277  normal  0.959313 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2420  transcriptional regulator, GntR family  29.29 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.333552 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2551  transcriptional regulator, GntR family  31.65 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.321871  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4822  transcriptional regulator, GntR family  30.04 
 
 		 248 aa  103  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2176  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2284  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2077  GntR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 265 aa  103  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.340396  hitchhiker  0.00560319 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  28.51 
 
 		 252 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>