61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4480 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4480  transposase IS4 family protein  100 
 
 
473 aa  940    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3048  transposase, IS4 family protein  65.13 
 
 
468 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114746  normal  0.506929 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2324  transposase, IS4 family protein  65.13 
 
 
468 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.145613 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2323  transposase, IS4 family protein  65.13 
 
 
468 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.245416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2265  transposase, IS4 family protein  65.13 
 
 
468 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0634179  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2263  transposase, IS4 family protein  65.13 
 
 
468 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.109708  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0966  transposase, IS4 family protein  65.13 
 
 
468 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.932604  normal  0.823189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0598  transposase, IS4 family protein  65.13 
 
 
468 aa  556  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5282  transposase, IS4 family protein  64.29 
 
 
468 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.278664 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5509  transposase, IS4 family protein  64.29 
 
 
468 aa  546  1e-154  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.188131  normal  0.094668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3501  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
465 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0292609  normal  0.24695 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5331  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
465 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5337  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
465 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2518  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
465 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131039  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2075  transposase IS4 family protein  45.34 
 
 
465 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.311971  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1611  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
465 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.512949  normal  0.166225 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0121  transposase IS4 family protein  44.69 
 
 
465 aa  299  7e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2061  transposase IS4 family protein  45.34 
 
 
465 aa  299  8e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000689755  hitchhiker  0.00689759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0570  hypothetical protein  46.25 
 
 
385 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0898  transposase IS4 family protein  43.38 
 
 
464 aa  298  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4698  transposase IS4 family protein  43.17 
 
 
464 aa  297  4e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2922  transposase IS4 family protein  43.17 
 
 
464 aa  295  1e-78  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2409  transposase IS4 family protein  41.59 
 
 
462 aa  280  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5526  transposase IS4 family protein  42.04 
 
 
462 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3437  transposase IS4 family protein  42.04 
 
 
462 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2076  transposase IS4 family protein  44.25 
 
 
464 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.181591  normal  0.0238985 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0710  transposase IS4 family protein  42.04 
 
 
462 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.315541  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2869  transposase IS4 family protein  42.04 
 
 
462 aa  279  1e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.338684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3186  transposase, IS4 family protein  39.51 
 
 
433 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0112396  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1862  transposase, IS4 family protein  39.51 
 
 
433 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.15552 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3605  transposase, IS4 family protein  39.51 
 
 
433 aa  258  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4493  hypothetical protein  82.61 
 
 
162 aa  230  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0438  transposase IS4 family protein  28.15 
 
 
456 aa  103  7e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1755  transposase IS4 family protein  28.12 
 
 
457 aa  101  3e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000443727  normal  0.223234 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5550  transposase, IS4 family protein  31.71 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3553  transposase, IS4 family protein  31.71 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.400805  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3030  transposase, IS4 family protein  31.71 
 
 
482 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.813515  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4786  IS4 family transposase  25.8 
 
 
442 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0321655  normal  0.753556 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_6006  TnpC protein  26.5 
 
 
467 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000150471 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5428  TnpC protein  26.5 
 
 
482 aa  64.3  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2717  hypothetical protein  27 
 
 
307 aa  61.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.940493  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4699  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.984217  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0815  transposase IS4 family protein  25.29 
 
 
458 aa  57.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0739  hypothetical protein  38.54 
 
 
189 aa  50.1  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4092  transposase, IS4 family protein  25.19 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819916  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0163  transposase, IS4 family protein  25.19 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0435  transposase, IS4 family protein  25.19 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.967999  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0632  transposase, IS4 family protein  25.19 
 
 
433 aa  49.7  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0983  transposase, IS4 family protein  24.14 
 
 
433 aa  47  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3087  hypothetical protein  32.61 
 
 
127 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0760419  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0372  hypothetical protein  21.53 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.355535  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0704  hypothetical protein  21.53 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0652216  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2416  hypothetical protein  21.53 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2187  hypothetical protein  21.53 
 
 
465 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.278618  normal  0.416717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4618  TnpC protein  31.67 
 
 
191 aa  44.3  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.297229  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0649  hypothetical protein  21.53 
 
 
465 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.567577  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0146  hypothetical protein  21.22 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.341189  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0770  hypothetical protein  21.22 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1156  hypothetical protein  21.22 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.247709  normal  0.0223767 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1926  hypothetical protein  21.22 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.43731  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1521  hypothetical protein  21.22 
 
 
465 aa  43.9  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00409895  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>