163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4469 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4469  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 624 aa  1220    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  55.2 
 
 		 1222 aa  262  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3493  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  50 
 
 		 921 aa  221  3e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00348376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0373  alpha-tubulin suppressor and related RCC1domain-containing protein  50.25 
 
 		 307 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000297826  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0956  regulator of chromosome condensation RCC1  41.35 
 
 		 743 aa  173  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.454345  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  41.55 
 
 		 2816 aa  164  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0161  alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing proteins-like protein  36.28 
 
 		 726 aa  152  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2977  regulator of chromosome condensation RCC1  34.77 
 
 		 579 aa  152  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.483456  hitchhiker  0.0000496688 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2569  regulator of chromosome condensation RCC1  34.6 
 
 		 363 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00852612  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2565  regulator of chromosome condensation RCC1  34.6 
 
 		 363 aa  150  6e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0283551  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1863  regulator of chromosome condensation RCC1  36.02 
 
 		 593 aa  149  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.59713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1701  beta-lactamase inhibitory protein II  40.7 
 
 		 298 aa  149  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1846  beta-lactamase inhibitory protein II  39.53 
 
 		 295 aa  148  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  37.36 
 
 		 1848 aa  147  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3497  beta-lactamase inhibitory protein II  39.15 
 
 		 295 aa  144  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  38.4 
 
 		 1178 aa  144  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1475  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.78 
 
 		 1919 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4652  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.04 
 
 		 555 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.197342  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2978  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.21 
 
 		 561 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.310394  hitchhiker  0.0000443731 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1979  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.51 
 
 		 554 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158856  normal  0.33934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4382  regulator of chromosome condensation, RCC1  35.84 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000505558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1928  hypothetical protein  41.48 
 
 		 260 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0196407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1729  regulator of chromosome condensation RCC1  38.3 
 
 		 681 aa  135  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.378302 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2687  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.16 
 
 		 821 aa  134  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0258  cellulosome enzyme, dockerin type I  34.69 
 
 		 469 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000567445  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4383  regulator of chromosome condensation RCC1  34.74 
 
 		 546 aa  134  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.843021  hitchhiker  0.000224903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1179  cell wall anchor domain-containing protein  32.08 
 
 		 558 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1539  regulator of chromosome condensation RCC1  36.8 
 
 		 569 aa  131  3e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781451  hitchhiker  0.00406058 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19690  hypothetical protein  41.7 
 
 		 285 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0713543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2688  regulator of chromosome condensation, RCC1  33.23 
 
 		 818 aa  128  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.274478  normal  0.0258848 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05390  hypothetical protein  38.65 
 
 		 297 aa  128  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1585  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.05 
 
 		 570 aa  126  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.179205  normal  0.90186 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4565  hypothetical protein  33.33 
 
 		 477 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0421  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.43 
 
 		 837 aa  125  2e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0560026 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  36.25 
 
 		 1129 aa  124  5e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 2082 aa  124  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3298  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.64 
 
 		 706 aa  122  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1792  regulator of chromosome condensation, RCC1  34.39 
 
 		 417 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2567  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.57 
 
 		 555 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116375 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1538  regulator of chromosome condensation RCC1  33.25 
 
 		 560 aa  120  6e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16110  hypothetical protein  39.84 
 
 		 280 aa  119  9.999999999999999e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359187  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1715  regulator of chromosome condensation, RCC1  32.6 
 
 		 563 aa  118  3e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000999119 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2349  cell wall anchor domain-containing protein  36.22 
 
 		 551 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.846562  normal  0.0247307 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1072  regulator of chromosome condensation RCC1  31.82 
 
 		 553 aa  117  7.999999999999999e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0600576  decreased coverage  0.000288682 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1055  regulator of chromosome condensation RCC1  33.79 
 
 		 717 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1176  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.53 
 
 		 567 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.308067  normal  0.550522 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1193  cell wall anchor domain-containing protein  32.26 
 
 		 577 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.770644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0670  regulator of chromosome condensation RCC1  32.82 
 
 		 778 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.0000346041 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1007  regulator of chromosome condensation RCC1  37.21 
 
 		 443 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4499  regulator of chromosome condensation, RCC1  36.36 
 
 		 553 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.243819  hitchhiker  0.00250831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1086  cell wall anchor domain-containing protein  35.4 
 
 		 566 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.628609  normal  0.014892 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1051  regulator of chromosome condensation RCC1  34.67 
 
 		 714 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0668  regulator of chromosome condensation RCC1  34.47 
 
 		 784 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000606887  hitchhiker  0.00000503803 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1189  regulator of chromosome condensation, RCC1  30.51 
 
 		 1679 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0264  regulator of chromosome condensation RCC1  35.54 
 
 		 792 aa  108  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0100345  normal  0.0222912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4380  regulator of chromosome condensation RCC1  34.08 
 
 		 554 aa  107  5e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261598 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0669  regulator of chromosome condensation RCC1  31.69 
 
 		 776 aa  105  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000957147  hitchhiker  0.000042388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  38.01 
 
 		 14609 aa  102  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2892  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain-containing protein-like protein  33.03 
 
 		 835 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_89498  predicted protein  28.57 
 
 		 376 aa  101  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.034274  normal  0.0389123 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1101  alpha-tubulin suppressor  27.33 
 
 		 911 aa  96.7  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06510  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  37.25 
 
 		 900 aa  96.3  2e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10191  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2272  putative lipoprotein  33.12 
 
 		 403 aa  94.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1593  regulator of chromosome condensation RCC1  35.29 
 
 		 558 aa  94.4  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0107683  decreased coverage  0.00113997 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0742  copper amine oxidase domain-containing protein  29.87 
 
 		 547 aa  94.4  6e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2564  PKD domain-containing protein  30.31 
 
 		 1107 aa  94  7e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.543991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1556  hypothetical protein  31.66 
 
 		 826 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.253387  normal  0.486048 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2304  alpha-tubulin suppressor  31.11 
 
 		 461 aa  91.3  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.876578  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0799  alpha-tubulin suppressor  27.16 
 
 		 461 aa  90.5  8e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.16068  decreased coverage  0.00221798 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  32.96 
 
 		 1408 aa  88.2  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0960  BNR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 449 aa  87.4  7e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0736661  normal  0.223675 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1010  immunoglobulin-like  28.75 
 
 		 597 aa  87  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1101  regulator of chromosome condensation RCC1  30.16 
 
 		 1187 aa  86.3  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0813  hypothetical protein  29.64 
 
 		 480 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5337  regulator of chromosome condensation RCC1  29.34 
 
 		 618 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3304  hypothetical protein  28.47 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0169  regulator of chromosome condensation RCC1  26.73 
 
 		 1207 aa  85.1  0.000000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.26578 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0649  hypothetical protein  28.83 
 
 		 478 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3474  hypothetical protein  28.83 
 
 		 478 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1102  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.76 
 
 		 787 aa  84  0.000000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1574  hypothetical protein  28.95 
 
 		 501 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.800091 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2802  regulator of chromosome condensation RCC1  37.24 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0430  alpha-tubulin suppressor  27.48 
 
 		 807 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5721  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  28.52 
 
 		 810 aa  77.8  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0661  hypothetical protein  28.51 
 
 		 480 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3578  hypothetical protein  26.15 
 
 		 480 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1923  regulator of chromosome condensation, RCC1  30 
 
 		 692 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.611736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2795  hypothetical protein  29.07 
 
 		 576 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3769  hypothetical protein  27.78 
 
 		 480 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2974  hypothetical protein  31.68 
 
 		 576 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3646  hypothetical protein  28.51 
 
 		 480 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0151062  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2878  hypothetical protein  28.68 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1395  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  27.24 
 
 		 941 aa  73.9  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49595  predicted protein  31.2 
 
 		 643 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.107678  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6709  Alpha-tubulin suppressor and related RCC1 domain- containing protein-like protein  25 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.93763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3078  cysteine-rich repeat protein  27.54 
 
 		 602 aa  72.8  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.636545  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06370  RCC1 domain-containing protein, alpha-tubulin suppressor  29.48 
 
 		 737 aa  71.6  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688875  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  32.95 
 
 		 1410 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  32.95 
 
 		 1410 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.79 
 
 		 1126 aa  71.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>