More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4452 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4452  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 320 aa  638    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02840  predicted glycosyltransferase  41.88 
 
 		 642 aa  207  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0993  glycosyl transferase family 2  40.96 
 
 		 301 aa  206  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00285177 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0353  glycosyl transferase family 2  33.6 
 
 		 317 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3199  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0503  glycosyl transferase family protein  38.39 
 
 		 290 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0779995  normal  0.962073 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2884  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 298 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723047 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0185  glycosyl transferase family 2  28.35 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0197048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3852  glycosyl transferase family 2  28.48 
 
 		 321 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2016  glycosyl transferase family protein  27.71 
 
 		 322 aa  87.8  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.12313  normal  0.993196 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4373  glycosyl transferase family 2  36.65 
 
 		 327 aa  87  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.438048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4004  glycosyl transferase family protein  36.65 
 
 		 327 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.978778 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5292  glycosyl transferase family 2  25.37 
 
 		 327 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3990  glycosyl transferase family protein  30.68 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.965976 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2356  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.934543  normal  0.35695 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1579  glycosyl transferase family protein  31.18 
 
 		 318 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.35814 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2934  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.607022  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2104  glycosyl transferase family protein  29.78 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0459  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4485  glycosyl transferase family 2  35.87 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0538155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4230  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.01308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3706  glycosyl transferase family 2  30.91 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  hitchhiker  0.00000472149 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0189  glycosyl transferase family protein  30.38 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0628  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 306 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.154474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0798  glycosyl transferase family 2  27.76 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2305  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.064621 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2102  glycosyl transferase family protein  29.5 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3720  putative glycosyl transferase  31.25 
 
 		 302 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2683  glycosyl transferase family 2  28.73 
 
 		 361 aa  79.7  0.00000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.624324  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1341  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000344524  normal  0.888688 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0018  glycosyl transferase  26.44 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3501  glycosyl transferase family 2  30.53 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.222757  normal  0.064344 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4212  glycosyl transferase family 2  28.22 
 
 		 303 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.979842 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4788  glycosyl transferase family protein  27.07 
 
 		 315 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2678  glycosyl transferase family protein  27.83 
 
 		 841 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3344  glycosyl transferase family protein  31.78 
 
 		 274 aa  78.2  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27907 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  29.84 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3624  glycosyl transferase family 2  31.29 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.519026 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4203  glycosyl transferase family 2  30.83 
 
 		 841 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.138699 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06120  predicted glycosyltransferase  31.91 
 
 		 838 aa  76.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.345441  normal  0.721654 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2348  glycosyl transferase  33.83 
 
 		 1837 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08990  predicted glycosyltransferase  29.78 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127501  normal  0.472159 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07585  glycosyl transferase, group 2 family protein  22.78 
 
 		 379 aa  75.9  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.547919  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0169  glycosyl transferase  30.43 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.571999 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0837  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 330 aa  75.1  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0820  glycosyl transferase family protein  26.58 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.516631  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1273  glycosyl transferase family protein  27.92 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2281  glycosyl transferase family 2  30.39 
 
 		 282 aa  75.1  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.733627  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4318  glycosyl transferase family 2  29.91 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.592459  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1063  glycosyl transferase family 2  29.37 
 
 		 305 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.862808  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2648  glycosyl transferase family protein  24.61 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.747467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0462  glycosyl transferase family 2  24.81 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1694  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.128471  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3190  glycosyl transferase family 2  29.25 
 
 		 314 aa  73.2  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.035048  hitchhiker  0.000201325 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2729  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2401  glycosyl transferase family protein  30.93 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4485  glycosyl transferase family 2  27.23 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.874808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  26.56 
 
 		 907 aa  72.8  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6727  glycosyl transferase family protein  27.08 
 
 		 319 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5349  glycosyl transferase family protein  31.93 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2365  glycosyl transferase family 2  30.35 
 
 		 836 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674972 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3358  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.499645 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2074  glycosyl transferase family 2  28.3 
 
 		 286 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2138  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2447  glycosyl transferase family protein  27.86 
 
 		 343 aa  72  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.83328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1728  glycosyl transferase family protein  29.18 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.711206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3947  glycosyltransferases-like  26.67 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4314  glycosyl transferase family protein  28.29 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1068  glycosyl transferase group 1  32.07 
 
 		 658 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.114697  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0313  rhamnosyl transferase related protein  29.84 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0691397 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3119  glycosyl transferase family protein  30 
 
 		 282 aa  70.9  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2441  glycosyl transferase family protein  27.05 
 
 		 290 aa  70.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1310  glycosyl transferase family protein  26.13 
 
 		 342 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.31 
 
 		 722 aa  69.7  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0786  glycosyl transferase family protein  26.05 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0460061  normal  0.237559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0801  glycosyl transferase family 2  27.67 
 
 		 313 aa  69.3  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1320  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1337  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.945092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1356  glycosyl transferase family protein  29.09 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00877043  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3033  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.244321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0619  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.84 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773869  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5481  glycosyl transferase family protein  31.13 
 
 		 310 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.495581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3301  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  0.657687 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2362  glycosyl transferase family 2  29.79 
 
 		 335 aa  68.9  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00826975 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2933  family 2 glycosyl transferase  28.74 
 
 		 284 aa  68.9  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.593138  normal  0.360179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2593  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 		 691 aa  67.8  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2355  glycosyltransferase  27.17 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4607  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.71448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2757  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3709  glycosyl transferase family 2  25.09 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0910127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0759  glycosyl transferase family protein  29.3 
 
 		 340 aa  68.2  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0160185 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  28.57 
 
 		 691 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3185  glycosyl transferase family protein  23.62 
 
 		 297 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1753  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.625707 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4703  glycosyl transferase family 2  26.77 
 
 		 334 aa  67.4  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.261222  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0736  putative dTDP-rhamnosyl transferase  30.92 
 
 		 281 aa  67  0.0000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.574558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 691 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1044  b-glycosyltransferase  24.09 
 
 		 652 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00623044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0288  glycosyl transferase family protein  26.94 
 
 		 329 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>