208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4442 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4442  cytidyltransferase-related domain protein  100 
 
 
152 aa  313  6e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.437739 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4935  cytidyltransferase-related  60.9 
 
 
143 aa  177  4e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02680  cytidyltransferase-related enzyme  56.85 
 
 
148 aa  176  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0886  cytidyltransferase-related domain protein  56.52 
 
 
147 aa  169  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.626022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0992  cytidyltransferase-related protein domain protein  56.82 
 
 
153 aa  162  2e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1824  cytidyltransferase-related domain  60.16 
 
 
146 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0257139  decreased coverage  0.00475018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4918  cytidyltransferase-related  38.24 
 
 
177 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4994  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
158 aa  96.3  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.327738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0245  cytidyltransferase-like protein  34.53 
 
 
512 aa  92.8  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0301  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.76 
 
 
185 aa  84  7e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.675292  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2068  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
152 aa  83.6  8e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0255  cytidyltransferase-like protein  37.19 
 
 
131 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1075  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.5 
 
 
167 aa  79  2e-14  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00521191  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4205  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  38.02 
 
 
131 aa  78.2  4e-14  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.680646  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05830  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.23 
 
 
139 aa  77  8e-14  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.871653  hitchhiker  0.000166463 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3377  cytidyltransferase-like protein  36.36 
 
 
131 aa  77  9e-14  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1823  cytidyltransferase-related domain  36.51 
 
 
386 aa  76.3  1e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  unclonable  2.10752e-06  normal  0.03789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3211  cytidyltransferase-like protein  31.82 
 
 
132 aa  74.7  5e-13  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1304  cytidyltransferase-like protein  34.78 
 
 
156 aa  74.3  5e-13  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.494614  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1691  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  36.43 
 
 
132 aa  73.2  1e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0283743  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3930  cytidyltransferase-like protein  38.21 
 
 
130 aa  72.4  2e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3695  cytidyltransferase-like protein  36.59 
 
 
130 aa  71.6  3e-12  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2610  cytidyltransferase-related  40.43 
 
 
163 aa  67.4  7e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.248173  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2791  cytidyltransferase-related domain protein  40.43 
 
 
163 aa  67.4  7e-11  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2577  cytidyltransferase-like protein  39.36 
 
 
160 aa  67  8e-11  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.526786  normal  0.149536 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2696  cytidyltransferase-related domain protein  40.43 
 
 
163 aa  67  9e-11  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0199265  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0819  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  31.25 
 
 
187 aa  66.6  1e-10  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.609533 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0146  cytidyltransferase-related domain protein  31.85 
 
 
495 aa  65.9  2e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27890  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  34.62 
 
 
133 aa  65.9  2e-10  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.90735  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1685  cytidyltransferase-like protein  32.56 
 
 
169 aa  65.1  4e-10  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1712  cytidyltransferase-like protein  30.36 
 
 
150 aa  64.3  6e-10  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.432331  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33.09 
 
 
128 aa  63.5  9e-10  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14660  Glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  32.81 
 
 
127 aa  62.4  2e-09  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0290332  decreased coverage  2.46532e-07 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0246  cytidyltransferase-like protein  29.2 
 
 
151 aa  62.4  2e-09  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1736  cytidyltransferase-like protein  34.29 
 
 
216 aa  61.6  3e-09  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.355762  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0190  cytidyltransferase-like protein  28.06 
 
 
150 aa  61.6  4e-09  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.847612  normal  0.946455 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0750  cytidyltransferase-like protein  28.57 
 
 
150 aa  61.6  4e-09  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0295  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase, putative  36.26 
 
 
129 aa  61.2  5e-09  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2953  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30 
 
 
131 aa  59.3  2e-08  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1422  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  33.82 
 
 
151 aa  58.9  3e-08  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1747  cytidyltransferase-related domain protein  31.82 
 
 
451 aa  58.5  3e-08  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3971  cytidyltransferase-like protein  31.03 
 
 
175 aa  57.8  5e-08  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05910  cytidyltransferase-related enzyme  30.3 
 
 
464 aa  57.4  7e-08  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  7.37737e-06 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2003  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.1 
 
 
142 aa  57.4  8e-08  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.10524 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1432  bifunctional ADP-heptose synthase  31.85 
 
 
490 aa  56.6  1e-07  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.588052 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0711  bifunctional ADP-heptose synthase  34.35 
 
 
455 aa  56.6  1e-07  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0342906  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2588  cytidyltransferase-related domain protein  34.65 
 
 
447 aa  56.6  1e-07  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04100  choline-phosphate cytidylyltransferase, putative  45.95 
 
 
453 aa  56.2  1e-07  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00623495  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4553  rfaE bifunctional protein  30.21 
 
 
162 aa  55.8  2e-07  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1533  cytidylyltransferase  30.33 
 
 
116 aa  56.2  2e-07  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000327632  normal  0.335792 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5025  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  30.56 
 
 
144 aa  56.2  2e-07  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.310334  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0616  rfaE bifunctional protein  29.32 
 
 
163 aa  55.5  3e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.584874  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4946  rfaE bifunctional protein  30.53 
 
 
488 aa  54.7  4e-07  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.169495 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0354  rfaE bifunctional protein  27.37 
 
 
486 aa  54.7  5e-07  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0505  bifunctional heptose 7-phosphate kinase/heptose 1-phosphate adenyltransferase  34.34 
 
 
480 aa  54.3  5e-07  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1579  rfaE bifunctional protein  29.59 
 
 
158 aa  54.3  6e-07  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0688  cytidyltransferase-like protein  34.34 
 
 
225 aa  53.9  7e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33520  predicted protein  34.78 
 
 
337 aa  53.9  7e-07  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0371958  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2321  cytidyltransferase-like protein  29.93 
 
 
143 aa  53.9  7e-07  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0368  rfaE bifunctional protein  32.65 
 
 
162 aa  53.9  7e-07  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11230  cytidyltransferase-related enzyme  35.88 
 
 
484 aa  53.9  8e-07  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.448325  normal  0.110426 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0664  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.78 
 
 
132 aa  53.9  8e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0679  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.78 
 
 
132 aa  53.9  8e-07  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0596  rfaE bifunctional protein  30.3 
 
 
151 aa  53.9  8e-07  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01357  cholinephosphate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G09290)  45.45 
 
 
451 aa  53.9  8e-07  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.48081  normal  0.256362 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40163  predicted protein  35.48 
 
 
371 aa  53.5  9e-07  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.258243  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0300  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  29.13 
 
 
132 aa  53.5  9e-07  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.582622  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1930  cytidyltransferase-related domain protein  33.7 
 
 
226 aa  53.1  1e-06  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.791436  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2084  glycerol-3-phosphate cytidyltransferase  33.05 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0657652  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0113  cytidyltransferase-like protein  31.82 
 
 
139 aa  53.1  1e-06  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1245  cytidyltransferase-like protein  26.28 
 
 
241 aa  53.1  1e-06  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0187562  hitchhiker  0.00542026 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2337  cytidyltransferase-like protein  31.48 
 
 
238 aa  52.4  2e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.022864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1486  cytidyltransferase-related domain protein  33.08 
 
 
170 aa  52.8  2e-06  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.895055  normal  0.966364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1692  glycerol-3-phosphate cytidylyltransferase  28.68 
 
 
133 aa  52.4  2e-06  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2639  rfaE bifunctional protein  32.8 
 
 
461 aa  52.4  2e-06  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2196  cytidyltransferase-related  34.94 
 
 
167 aa  52  3e-06  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1603  bifunctional D-beta-D-heptose 7-phosphate kinase/D-beta-D-heptose 1-phosphate adenosyltransferase  34.69 
 
 
490 aa  51.6  4e-06  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1071  cytidyltransferase-related, RfaE bifunctional protein  33.33 
 
 
488 aa  51.2  5e-06  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0136639  normal  0.217444 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3466  rfaE bifunctional protein  28.12 
 
 
159 aa  50.8  6e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0691  D-glycero-D-manno-heptose-1-phosphate adenylyltransferase  31.25 
 
 
526 aa  50.8  7e-06  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0427  cytidyltransferase-related protein  33.71 
 
 
143 aa  50.8  7e-06  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1750  cytidyltransferase-like protein  30.95 
 
 
502 aa  50.8  7e-06  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0122824 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0796  putative ADP-heptose synthase  31.01 
 
 
526 aa  50.8  7e-06  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0123  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  28.87 
 
 
496 aa  50.4  8e-06  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.187793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1895  rfaE bifunctional protein  28.87 
 
 
488 aa  50.4  9e-06  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.200594 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1031  rfaE bifunctional protein  28.87 
 
 
501 aa  50.1  1e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0864  rfaE bifunctional protein  29.59 
 
 
487 aa  50.4  1e-05  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.848286  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3395  rfaE bifunctional protein  26.04 
 
 
487 aa  50.1  1e-05  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1413  bifunctional protein HldE  28.72 
 
 
458 aa  49.7  1e-05  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3669  cytidyltransferase-related domain protein  30.43 
 
 
488 aa  50.1  1e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.088026  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0922  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  27.08 
 
 
490 aa  50.1  1e-05  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.053941  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1615  bifunctional ADP-heptose synthase  33.67 
 
 
490 aa  50.1  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4507  rfaE bifunctional protein  33.67 
 
 
490 aa  49.3  2e-05  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0571  rfaE bifunctional protein  35.07 
 
 
486 aa  48.9  2e-05  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.861357 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1704  rfaE bifunctional protein  28.87 
 
 
479 aa  48.9  2e-05  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0577  udp-N-acetylglucosamine--n-acetylmuramyl- (pentapeptide)pyrophosphoryl -undecaprenol n-acetylglucosamine transferase (undecaprenyl-PP-MurNAc-pentapeptide-udpglcnac glcnactransferase)  30.69 
 
 
472 aa  49.3  2e-05  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.347278  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1884  bifunctional ADP-heptose synthase  29.47 
 
 
173 aa  49.7  2e-05  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0401  rfaE bifunctional protein  33.71 
 
 
158 aa  48.9  2e-05  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5668  D-beta-D-heptose 1-phosphate adenylyltransferase / D-alpha,beta-D-heptose 7-phosphate 1-kinase  34.33 
 
 
490 aa  49.7  2e-05  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.381321 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1764  cytidyltransferase-like protein  30.16 
 
 
501 aa  48.9  2e-05  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>