178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4394 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4394  dihydroxyacetone kinase, L subunit  100 
 
 
211 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0080  dihydroxyacetone kinase, L subunit  64.88 
 
 
218 aa  236  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3125  dihydroxyacetone kinase, L subunit  59.71 
 
 
214 aa  215  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0235  dihydroxyacetone kinase family protein  38.24 
 
 
208 aa  150  1e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.229043  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1026  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.78 
 
 
212 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0152559  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001637  PTS-dependent dihydroxyacetone kinase ADP-binding subunit DhaL  35.35 
 
 
211 aa  138  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4780  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.82 
 
 
209 aa  135  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.512432 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03260  Glycerone kinase  36.98 
 
 
216 aa  134  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000533446  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1345  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  39.89 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1767  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.84 
 
 
211 aa  132  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.259249 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0907  dihydroxyacetone kinase  39.41 
 
 
583 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1179  DAK2 domain-containing protein  37.86 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0965  dihydroxyacetone kinase  39.41 
 
 
583 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.733781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0875  dihydroxyacetone kinase  39.41 
 
 
583 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1049  dihydroxyacetone kinase  39.41 
 
 
583 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49309e-19 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4294  dihydroxyacetone kinase  39.41 
 
 
583 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0787  dihydroxyacetone kinase  37.5 
 
 
583 aa  129  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2045  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.54 
 
 
210 aa  129  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1343  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.81 
 
 
204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000571378  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2583  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.14 
 
 
210 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1054  dihydroxyacetone kinase  38.92 
 
 
583 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00074668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0889  dihydroxyacetone kinase  39.41 
 
 
583 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.178711  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1008  dihydroxyacetone kinase  38.92 
 
 
583 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.64374  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1942  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  38.83 
 
 
210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0284068 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1134  dihydroxyacetone kinase  38.92 
 
 
583 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0870  dihydroxyacetone kinase  38.92 
 
 
583 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2008  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.67 
 
 
210 aa  126  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0073  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.32 
 
 
214 aa  126  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.706959  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0095  dihydroxyacetone kinase  34.98 
 
 
582 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2057  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.07 
 
 
212 aa  125  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0299195  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4271  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.78 
 
 
210 aa  124  8.000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.207338 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01174  dihydroxyacetone kinase, C-terminal domain protein  39.89 
 
 
210 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2449  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.89 
 
 
210 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1358  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  39.89 
 
 
210 aa  123  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01184  hypothetical protein  39.89 
 
 
210 aa  123  2e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1303  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  39.89 
 
 
210 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2427  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  39.89 
 
 
210 aa  123  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.52079  normal  0.545105 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4857  dihydroxyacetone kinase subunit DhaL  33.84 
 
 
210 aa  123  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2004  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.66 
 
 
215 aa  123  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.419483  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1402  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.11 
 
 
216 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0698763  normal  0.808162 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1907  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.81 
 
 
215 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1638  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36 
 
 
212 aa  119  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.275344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2221  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.64 
 
 
204 aa  119  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3298  dihydroxyacetone kinase, L subunit  37.69 
 
 
221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29370  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  36.02 
 
 
207 aa  118  7.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2073  dihydroxyacetone kinase subunit L  32.18 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1081  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.84 
 
 
199 aa  115  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1555  dihydroxyacetone kinase, L subunit  33.16 
 
 
206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3824  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.9 
 
 
213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234592  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0961  dihydroxyacetone kinase, subunit L  33.16 
 
 
211 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000657721  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1105  dihydroxyacetone kinase, subunit L  33.16 
 
 
211 aa  112  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1571  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.79 
 
 
201 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0215436  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4110  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.18 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0295747 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4070  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.71 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0650  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.16 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0141931  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1458  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.86 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.031951  normal  0.416542 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2200  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.25 
 
 
204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000530295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23890  dihydroxyacetone kinase, phosphoprotein-dependent, L subunit  39.2 
 
 
271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0484883  normal  0.421775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0039  dihydroxyacetone phosphatase family protein  31.84 
 
 
212 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0973  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.98 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.19322  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1155  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.83 
 
 
211 aa  107  1e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.359439  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0705  dihydroxyacetone kinase, subunit L  34.86 
 
 
212 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547762  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6113  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.42 
 
 
208 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0336  dihydroxyacetone kinase, L subunit  38.5 
 
 
210 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22050  dihydroxyacetone kinase, L subunit  31.98 
 
 
215 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1102  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.65 
 
 
207 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2565  Dak phosphatase  30.96 
 
 
220 aa  104  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0674  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.46 
 
 
194 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.13581  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2563  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.8 
 
 
221 aa  103  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.389058  normal  0.0624856 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0689  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.46 
 
 
194 aa  104  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0402893  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2344  DAK2 domain-containing protein  33.86 
 
 
191 aa  103  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0173  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.9 
 
 
210 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0878  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.52 
 
 
209 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3210  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.16 
 
 
213 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2329  dihydroxyacetone kinase, L subunit  40.86 
 
 
211 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2433  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30 
 
 
204 aa  99  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.107331  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2329  dihydroxyacetone kinase  34.15 
 
 
567 aa  99  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3285  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.41 
 
 
224 aa  98.2  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1263  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.76 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1660  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.23 
 
 
218 aa  97.8  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015384  normal  0.0335955 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7717  dihydroxyacetone kinase  33.85 
 
 
566 aa  97.8  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.817415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2617  dihydroxyacetone kinase, L subunit  39.38 
 
 
205 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0276564  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0948  hypothetical protein  30.41 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.168342  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3418  dihydroxyacetone kinase, L subunit  30.41 
 
 
224 aa  97.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.102926  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6567  dihydroxyacetone kinase  32.34 
 
 
567 aa  97.1  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.264785  hitchhiker  0.00376377 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2559  dihydroxyacetone kinase  32.34 
 
 
567 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1067  dihydroxyacetone kinase, subunit L  40.61 
 
 
208 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3047  dihydroxyacetone kinase, L subunit  34.02 
 
 
213 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1459  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.71 
 
 
252 aa  96.3  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0355  dihydroxyacetone kinase, subunit L  30.1 
 
 
217 aa  95.1  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1341  Dak phosphatase  34.54 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2346  dihydroxyacetone kinase, L subunit  36.46 
 
 
210 aa  94.7  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.516826  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3826  dihydroxyacetone kinase, L subunit  35.36 
 
 
212 aa  93.2  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4585  dihydroxyacetone kinase  28.85 
 
 
598 aa  92.8  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28690  dihydroxyacetone kinase  34.86 
 
 
581 aa  92.8  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0302263 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5632  dihydroxyacetone kinase, L subunit  32.24 
 
 
210 aa  92.4  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.431104  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1651  dihydroxyacetone kinase family protein  29.5 
 
 
192 aa  92  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6365  dihydroxyacetone kinase, L subunit  29.41 
 
 
205 aa  91.7  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0987267  normal  0.592385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2047  dihydroxyacetone kinase  30.05 
 
 
612 aa  91.3  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2053  dihydroxyacetone kinase  32.85 
 
 
570 aa  91.3  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>