208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4360 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4360  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.11563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0188  hypothetical protein  49.67 
 
 		 287 aa  142  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4393  NUDIX hydrolase  54 
 
 		 160 aa  137  4.999999999999999e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10418  mutator protein mutT3  50.65 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0449167  normal  0.708231 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0099  NUDIX hydrolase  48.34 
 
 		 291 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.474769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0543  NUDIX hydrolase  50.32 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.643343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0555  NUDIX hydrolase  50.32 
 
 		 174 aa  130  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.51062  normal  0.852901 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0533  NUDIX hydrolase  50.32 
 
 		 174 aa  130  7.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3752  NUDIX hydrolase  48.99 
 
 		 156 aa  126  9.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1229  septum formation protein Maf  43.62 
 
 		 475 aa  121  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000255715 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1609  Nucleotide-binding protein  43.84 
 
 		 484 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1033  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.997989 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0706  NUDIX hydrolase  50.99 
 
 		 179 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0747129 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1136  NUDIX hydrolase  48.3 
 
 		 335 aa  116  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.472078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0199  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 180 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1010  NUDIX hydrolase  44.44 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24850  ADP-ribose pyrophosphatase  47.3 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.203973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25510  ADP-ribose pyrophosphatase  44.9 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0162353  normal  0.120334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0837  NUDIX hydrolase  41.56 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.172365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5298  NUDIX hydrolase  41.94 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0097  hypothetical protein  40.41 
 
 		 299 aa  107  5e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3604  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 292 aa  97.1  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.763493  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2308  NUDIX hydrolase  42.07 
 
 		 167 aa  94.7  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.000433057  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2056  NUDIX hydrolase  43.45 
 
 		 165 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000128394 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2026  NUDIX hydrolase  40.5 
 
 		 152 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0458229  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3121  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  35.14 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.508496 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5595  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5996  NUDIX hydrolase  37 
 
 		 155 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000245318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8967  NUDIX hydrolase  31.71 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.035368  normal  0.614637 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0774  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5333  NUDIX hydrolase  32.76 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66797  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0815  NUDIX hydrolase  34.86 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5262  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 240 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5351  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 239 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0575  NUDIX hydrolase  31.63 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0922  NUDIX hydrolase  36.29 
 
 		 136 aa  49.7  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0356  mutator MutT protein  29 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0223709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0312  mutator MutT protein  29 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.672809  normal  0.370797 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1420  Mutator protein MutT  26.73 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1564  Mutator protein MutT  26.73 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0388  mutator MutT protein  29 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.616604 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13765  hypothetical protein  30 
 
 		 166 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.983203 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1135  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0641209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0508  NUDIX hydrolase  30.11 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0799439  hitchhiker  0.00145151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3170  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3232  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.402794  normal  0.822465 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3182  NUDIX hydrolase  35.14 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0933  hypothetical protein  41.1 
 
 		 209 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.825014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3536  mutator MutT protein  30 
 
 		 142 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1350  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 		 146 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39620  NUDIX hydrolase  44.59 
 
 		 200 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3827  mutator MutT protein  30 
 
 		 137 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.9578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1022  NUDIX hydrolase  36.84 
 
 		 204 aa  47.4  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1686  NUDIX hydrolase  33.71 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.873349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4857  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 		 158 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4940  NUDIX hydrolase  30.61 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000317059 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2519  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4287  hydrolase, NUDIX family  31.25 
 
 		 152 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000426319  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0937  mutator MutT protein  29 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.655368 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4229  mutT/nudix family protein  31.25 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000345145  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09090  NTP pyrophosphohydrolase  33.65 
 
 		 305 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.197751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5341  NUDIX hydrolase  36.08 
 
 		 242 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0110  NUDIX hydrolase  27.88 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2202  NUDIX hydrolase  33.65 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000103843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2514  NUDIX hydrolase  30.69 
 
 		 135 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1690  NUDIX hydrolase  29.03 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000764223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1523  NUDIX hydrolase  32.11 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8698  ADP-ribose pyrophosphatase-like protein  33.03 
 
 		 159 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2670  mutT/nudix family protein  31.82 
 
 		 187 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148269  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2921  NUDIX hydrolase  37.25 
 
 		 193 aa  45.1  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0185259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3010  mutator MutT protein  29 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3031  NUDIX hydrolase  33 
 
 		 155 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1453  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.237622 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0833  NUDIX hydrolase  29.79 
 
 		 155 aa  44.7  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0297624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1712  NUDIX hydrolase  27.03 
 
 		 138 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148507  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2973  putative mutT-like protein  29.41 
 
 		 158 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0635  NUDIX/MutT family protein  28.7 
 
 		 170 aa  44.3  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.318355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1058  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 199 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0614  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 		 135 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0852421  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1025  mutator MutT protein  27 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1507  NUDIX hydrolase  32.95 
 
 		 360 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2275  NUDIX hydrolase  34.02 
 
 		 149 aa  44.3  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.961182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1483  NUDIX hydrolase  29.66 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.163061 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2126  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000453697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15860  hypothetical protein  41.67 
 
 		 203 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0480396 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2304  NUDIX hydrolase  32.69 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000460151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4268  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1364  hypothetical protein  41.67 
 
 		 203 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.980357  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003180  MutT/nudix family protein  34.72 
 
 		 96 aa  44.3  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1010  NUDIX hydrolase  42.47 
 
 		 199 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79985  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4313  NUDIX hydrolase  31.03 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  41.77 
 
 		 221 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3237  NUDIX hydrolase  27.7 
 
 		 187 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.653435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  33.01 
 
 		 252 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4166  NUDIX hydrolase  43.84 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.383593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1764  A/G-specific adenine glycosylase  31.4 
 
 		 360 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4811  NUDIX hydrolase  28.95 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.304627  decreased coverage  0.0000674364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7592  putative mutator protein mutT  29.13 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0886771 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4431  NUDIX hydrolase  31.25 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>