59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4322 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4322  mannosyltransferase  100 
 
 
417 aa  812    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0743  mannosyltransferase  46.56 
 
 
398 aa  273  6e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.186012  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4274  mannosyltransferase  39.95 
 
 
443 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4120  mannosyltransferase  39.7 
 
 
443 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.703888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4045  mannosyltransferase  39.7 
 
 
443 aa  212  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.265907  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11183  mannosyltransferase  39.83 
 
 
431 aa  208  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000655823  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0468  mannosyltransferase  41.29 
 
 
422 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0479  mannosyltransferase  41.29 
 
 
422 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0455  mannosyltransferase  41.29 
 
 
422 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2153  mannosyltransferase  37.43 
 
 
369 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0955915  normal  0.0100871 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0477  mannosyltransferase  36.96 
 
 
438 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0466  mannosyltransferase  36.96 
 
 
438 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0453  mannosyltransferase  36.96 
 
 
438 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.355546  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4550  mannosyltransferase  38.44 
 
 
406 aa  200  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.637141  normal  0.185586 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3039  Protein of unknown function DUF2029  37.73 
 
 
570 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3057  Protein of unknown function DUF2029  41.44 
 
 
455 aa  192  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0888832  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0467  mannosyltransferase  38.64 
 
 
428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0478  mannosyltransferase  38.64 
 
 
428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0454  mannosyltransferase  38.64 
 
 
428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5433  hypothetical protein  35.69 
 
 
420 aa  173  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2502  Protein of unknown function DUF2029  35.19 
 
 
414 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.567821  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2198  hypothetical protein  36.41 
 
 
408 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2282  Protein of unknown function DUF2029  34.56 
 
 
469 aa  144  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.291881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12209  integral membrane protein  35.48 
 
 
427 aa  143  4e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5506  hypothetical protein  34.02 
 
 
395 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.344164  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0243  putative integral membrane protein  34.5 
 
 
417 aa  138  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4020  Protein of unknown function DUF2029  36.46 
 
 
426 aa  137  4e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.643753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5329  hypothetical protein  33.23 
 
 
478 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3338  putative integral membrane protein  32.11 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.153127 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3276  putative integral membrane protein  32.11 
 
 
418 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1126  Protein of unknown function DUF2029  36.14 
 
 
425 aa  133  6e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06020  Protein of unknown function (DUF2029)  39.13 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.179625 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3287  putative integral membrane protein  31.75 
 
 
418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505534  normal  0.641522 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4089  hypothetical protein  36.48 
 
 
408 aa  126  9e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0942983  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4234  sugar transporter superfamily protein  36.18 
 
 
402 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.350034  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0993  hypothetical protein  37.81 
 
 
411 aa  125  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3057  hypothetical protein  32.92 
 
 
494 aa  123  7e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6115  hypothetical protein  30.64 
 
 
479 aa  123  7e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.112096  normal  0.027736 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1385  hypothetical protein  34.93 
 
 
412 aa  120  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488241  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2968  putative integral membrane protein  28.57 
 
 
430 aa  120  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3224  hypothetical protein  35.64 
 
 
378 aa  119  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21610  Protein of unknown function (DUF2029)  32.63 
 
 
421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0338543  normal  0.0110628 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4545  hypothetical protein  31.4 
 
 
477 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.186558 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3543  putative integral membrane protein  31.44 
 
 
428 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2916  hypothetical protein  36.72 
 
 
470 aa  113  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.189824  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3685  hypothetical protein  34.08 
 
 
420 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.822994  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5055  hypothetical protein  32.32 
 
 
477 aa  107  6e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.020472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0139  hypothetical protein  31.58 
 
 
437 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21600  Protein of unknown function (DUF2029)  31.48 
 
 
467 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0988113  hitchhiker  0.00696231 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3060  hypothetical protein  31.95 
 
 
434 aa  100  7e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.647331  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1016  hypothetical protein  34.71 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0425  hypothetical protein  31.87 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1343  hypothetical protein  33.68 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000546373 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0435  hypothetical protein  31.87 
 
 
417 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.199454  normal  0.0441383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2285  Protein of unknown function DUF2029  34.92 
 
 
463 aa  95.9  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.467092  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0119  hypothetical protein  33.56 
 
 
429 aa  90.9  4e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0070  hypothetical protein  28.12 
 
 
455 aa  88.6  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1125  hypothetical protein  32.91 
 
 
408 aa  82  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.51418  normal  0.62159 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3880  putative conserved membrane protein  32.41 
 
 
375 aa  69.7  0.00000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00561968 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>