75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4224 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4224  membrane-flanked domain protein  100 
 
 		 479 aa  943    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00512848  normal  0.19877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6388  membrane-flanked domain protein  33.33 
 
 		 170 aa  122  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00310241  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05910  predicted membrane protein  31.68 
 
 		 203 aa  105  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.697555 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1332  membrane-flanked domain-containing protein  33.54 
 
 		 172 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1296  membrane-flanked domain-containing protein  33.54 
 
 		 172 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.337275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1313  membrane-flanked domain-containing protein  33.54 
 
 		 172 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  0.136537 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13307  transmembrane protein  37.89 
 
 		 172 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1327  hypothetical protein  32.7 
 
 		 166 aa  90.9  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.266141 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4749  membrane-flanked domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1843  membrane-flanked domain protein  31.44 
 
 		 185 aa  87.4  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0163501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0795  membrane-flanked domain-containing protein  35.93 
 
 		 175 aa  84.7  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.311521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0703  hypothetical protein  33.33 
 
 		 167 aa  84  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1707  membrane-flanked domain-containing protein  31.68 
 
 		 172 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0818  membrane-flanked domain protein  30.06 
 
 		 180 aa  74.3  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.280126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4362  membrane-flanked domain protein  32.04 
 
 		 209 aa  72.8  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1045  membrane-flanked domain protein  32.26 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0381414  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0399  membrane-flanked domain-containing protein  34.09 
 
 		 174 aa  67  0.0000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0164295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02790  hypothetical protein  26.32 
 
 		 349 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.874218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00620  hypothetical protein  30.59 
 
 		 179 aa  61.6  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.970266  normal  0.067715 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0702  membrane-flanked domain-containing protein  27.61 
 
 		 169 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0858  membrane-flanked domain-containing protein  23.03 
 
 		 189 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.40567  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1471  hypothetical protein  24.5 
 
 		 155 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26060  hypothetical protein  27.94 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0819  membrane-flanked domain protein  28.79 
 
 		 186 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00223653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4935  membrane-flanked domain protein  37.1 
 
 		 174 aa  57.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0804  membrane-flanked domain-containing protein  21.93 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8563  hypothetical protein  26.71 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.33321  normal  0.010554 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9325  hypothetical protein  28.57 
 
 		 176 aa  57.4  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4835  membrane-flanked domain protein  37.1 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3389  membrane-flanked domain protein  35.29 
 
 		 172 aa  57  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0554186  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5912  membrane-flanked domain-containing protein  24.53 
 
 		 181 aa  57  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.824829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0078  hypothetical protein  28.86 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0745922 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0020  hypothetical protein  37.1 
 
 		 170 aa  56.2  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.715756  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2576  membrane-flanked domain-containing protein  25.16 
 
 		 146 aa  55.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.261166  normal  0.15355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0940  membrane-flanked domain-containing protein  26.8 
 
 		 541 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0763  membrane-flanked domain protein  28.78 
 
 		 229 aa  54.7  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.230772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0680  hypothetical protein  24.28 
 
 		 283 aa  55.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117221  normal  0.947006 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3541  hypothetical protein  34.78 
 
 		 176 aa  54.7  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.543439 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06580  hypothetical protein  26.87 
 
 		 186 aa  54.7  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.293947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0734  hypothetical protein  24.28 
 
 		 291 aa  54.3  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.331364 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0579  membrane-flanked domain-containing protein  24.84 
 
 		 153 aa  54.3  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0224616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0473  hypothetical protein  28.41 
 
 		 247 aa  53.5  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00981278  normal  0.0264995 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0847  hypothetical protein  24.49 
 
 		 371 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4260  membrane-flanked domain protein  25.38 
 
 		 243 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0600  membrane-flanked domain protein  29.63 
 
 		 232 aa  52  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2360  membrane-flanked domain protein  24.26 
 
 		 282 aa  51.6  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0717  membrane-flanked domain-containing protein  27.78 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  40.54 
 
 		 428 aa  50.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3493  membrane-flanked domain-containing protein  26.67 
 
 		 166 aa  50.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1284  membrane-flanked domain-containing protein  26.54 
 
 		 208 aa  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.935757  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1671  membrane-flanked domain protein  31.17 
 
 		 170 aa  49.7  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3703  membrane-flanked domain-containing protein  30.28 
 
 		 513 aa  49.7  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.41247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0369  protein serine/threonine phosphatase  32.92 
 
 		 511 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0013966  hitchhiker  0.00252542 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2068  hypothetical protein  22.99 
 
 		 175 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0154  membrane-flanked domain protein  21.88 
 
 		 178 aa  49.3  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2709  membrane-flanked domain-containing protein  29.03 
 
 		 227 aa  48.5  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00542291  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0096  hypothetical membrane associated protein  24.72 
 
 		 180 aa  48.1  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.129963  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1361  membrane-flanked domain  24.06 
 
 		 172 aa  48.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.30148  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  46.07 
 
 		 406 aa  47.8  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2094  hypothetical protein  29.11 
 
 		 178 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.859623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0034  Type IV secretory pathway VirB4 components-like  41.18 
 
 		 711 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.694512 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7601  hypothetical protein  28.66 
 
 		 155 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181543 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5071  membrane-flanked domain-containing protein  30.25 
 
 		 554 aa  45.8  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.324271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1279  hypothetical protein  26.45 
 
 		 179 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.960366 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0153  hypothetical protein  36 
 
 		 784 aa  45.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1300  membrane-flanked domain-containing protein  25.55 
 
 		 219 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2926  membrane-flanked domain protein  22.09 
 
 		 231 aa  44.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1328  membrane-flanked domain protein  24.73 
 
 		 198 aa  44.3  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000392278 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4946  putative transmembrane protein  56 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4857  putative transmembrane protein  56 
 
 		 398 aa  43.9  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.983726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5070  membrane-flanked domain-containing protein  29.55 
 
 		 169 aa  43.9  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.147494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6711  chromosome partitioning ATPase  35.37 
 
 		 495 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5225  putative transmembrane protein  56 
 
 		 398 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1669  hypothetical protein  26.52 
 
 		 574 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0708  membrane-flanked domain protein  25.89 
 
 		 575 aa  43.5  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.372887  normal  0.341849 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>