More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4209 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4209  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
346 aa  695    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.220629 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  56.68 
 
 
327 aa  349  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  54.52 
 
 
332 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  53.57 
 
 
313 aa  335  5e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  53.33 
 
 
332 aa  332  6e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16010  Glycosyl transferase, family 2  51.86 
 
 
322 aa  327  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000000647727  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  54.28 
 
 
346 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0021  glycosyl transferase family 2  51.31 
 
 
330 aa  319  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0585  glycosyl transferase family protein  54.79 
 
 
310 aa  305  6e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0256  glycosyl transferase family protein  52.92 
 
 
317 aa  302  5.000000000000001e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.0678648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2940  glycosyl transferase family protein  51.29 
 
 
318 aa  298  1e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  47.35 
 
 
335 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0549  glycosyl transferase family protein  51.94 
 
 
321 aa  290  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  unclonable  0.00000233931  normal  0.956589 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3000  glycosyl transferase family 2  57.19 
 
 
330 aa  290  2e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4442  glycosyl transferase family 2  52.48 
 
 
314 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.302046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4380  glycosyl transferase family 2  52.48 
 
 
314 aa  289  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0173  glycosyl transferase family 2  50.33 
 
 
325 aa  288  9e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  47.7 
 
 
335 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  44.69 
 
 
334 aa  271  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  45.18 
 
 
307 aa  270  2e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  48.66 
 
 
314 aa  263  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  43.59 
 
 
324 aa  260  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  43.73 
 
 
310 aa  258  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  46.26 
 
 
314 aa  250  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  44.19 
 
 
312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1400  glycosyltransferase-like protein  39.67 
 
 
317 aa  225  1e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  37.83 
 
 
318 aa  216  5e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  32.43 
 
 
308 aa  152  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  33.22 
 
 
315 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 
303 aa  144  2e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.86 
 
 
305 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  31.05 
 
 
307 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1662  glycosyl transferase family protein  32.35 
 
 
308 aa  138  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  31.19 
 
 
309 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  30.9 
 
 
344 aa  125  1e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  33.11 
 
 
336 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  32.99 
 
 
308 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  29.53 
 
 
319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0778  glycosyl transferase family protein  29.53 
 
 
305 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.703306  normal  0.211437 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  30.14 
 
 
221 aa  108  2e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 
287 aa  101  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  27.49 
 
 
448 aa  98.6  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.77 
 
 
355 aa  99  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  26.74 
 
 
394 aa  98.2  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  27.96 
 
 
345 aa  93.6  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  28.87 
 
 
313 aa  93.6  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  26.69 
 
 
378 aa  92.8  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.46 
 
 
382 aa  92  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
414 aa  92  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1727  glycosyl transferase family protein  30.45 
 
 
329 aa  92.4  1e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.350304  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  25.08 
 
 
328 aa  92.4  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  25.89 
 
 
344 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  26.76 
 
 
304 aa  90.9  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0341  glycosyl transferase family protein  30.86 
 
 
302 aa  90.9  3e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  24.65 
 
 
299 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  31.2 
 
 
272 aa  89.7  7e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  27.3 
 
 
298 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30 
 
 
410 aa  89.4  1e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3136  glycosyl transferase family protein  28.17 
 
 
305 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  25.66 
 
 
336 aa  88.6  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  26.99 
 
 
229 aa  86.3  7e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.24 
 
 
394 aa  84.3  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  30.57 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  30.91 
 
 
410 aa  83.6  0.000000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  29.74 
 
 
385 aa  84  0.000000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  26.48 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4593  glycosyl transferase family protein  25.65 
 
 
230 aa  83.6  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  29.83 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  26.28 
 
 
295 aa  82.8  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  30.04 
 
 
276 aa  82  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  27.94 
 
 
357 aa  82.4  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  24.9 
 
 
291 aa  81.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  29.2 
 
 
410 aa  81.3  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  27.55 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  28.03 
 
 
293 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  24.08 
 
 
340 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  26.43 
 
 
346 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  26.16 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 
327 aa  79.3  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  26.87 
 
 
412 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0488  glycosyl transferase family protein  30.49 
 
 
362 aa  78.2  0.0000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.814661  hitchhiker  0.0000013139 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
259 aa  77.8  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  24.51 
 
 
393 aa  77.4  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  23.15 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0162  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
314 aa  77.4  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00320055 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  27.06 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2676  glycosyl transferase family protein  32.21 
 
 
282 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  28.17 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  29.33 
 
 
285 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3168  glycosyl transferase family 2  25.75 
 
 
299 aa  75.5  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.912354  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 
480 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  30.59 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  24.44 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  23.47 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
354 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1970  glycosyl transferase family protein  27.6 
 
 
305 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.804516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  27.88 
 
 
238 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6395  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  29.55 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0941641 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>