More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4187 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4187  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
386 aa  758    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3172  family 2 glycosyl transferase  54.42 
 
 
412 aa  412  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0976  glycosyl transferase family 2  55.5 
 
 
430 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8623  dolichol-p-glucose synthetase  54.69 
 
 
406 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0660  glycosyl transferase family 2  42.82 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5487  glycosyl transferase family 2  40.48 
 
 
394 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1913  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  34.49 
 
 
382 aa  233  5e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1856  glycosyl transferase family protein  42.86 
 
 
559 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0355886  decreased coverage  0.0028209 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3061  glycosyl transferase family protein  42.67 
 
 
480 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0151807  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0214  glycosyl transferase family protein  37.14 
 
 
378 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.840225  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0527  glycosyl transferase family protein  34.22 
 
 
374 aa  219  7e-56  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.347971  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  31.82 
 
 
394 aa  207  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5602  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 
412 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.922712  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5467  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
418 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.66803  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0520  glycosyl transferase family 2  33.93 
 
 
221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.07 
 
 
298 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0596  dolichol-phosphate mannosyltransferase  31.82 
 
 
305 aa  113  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1292  hypothetical protein  30.66 
 
 
309 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.833177 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6391  glycosyl transferase family 2  34.23 
 
 
273 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  0.2042 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3586  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 
272 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
304 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  33.18 
 
 
303 aa  105  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0043  glycosyl transferase family protein  26.96 
 
 
231 aa  103  6e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.803192  hitchhiker  0.000270685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2674  family 2 glycosyl transferase  35.37 
 
 
285 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.49432  normal  0.387912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0818  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
411 aa  101  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1495  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
308 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.025805  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0217  glycosyl transferase family protein  34.21 
 
 
283 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.860122  normal  0.275888 
 
 
-
 
NC_002936  DET0202  histidinol-phosphate phosphatase family protein/glycosyl transferase, group 2 family protein  32.43 
 
 
410 aa  97.8  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.631531  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.55 
 
 
448 aa  97.4  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0696  glycosyl transferase family 2  32.44 
 
 
310 aa  96.7  7e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.646152  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7655  putative glycosyltransferase  32.88 
 
 
276 aa  96.3  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0532  glycosyl transferase family 2  30.93 
 
 
315 aa  96.3  9e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356755  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2780  glycosyl transferase family 2  28.26 
 
 
319 aa  95.5  1e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0451  glycosyl transferase family protein  31.84 
 
 
414 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.252184  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0151  histidinol-phosphate phosphatase family protein  30.9 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4222  glycosyl transferase family protein  26.9 
 
 
420 aa  95.1  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_190  histidinol-phosphate phosphatase protein/glycosyl transferase  31.17 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00438992  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  28.4 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6738  glycosyl transferase family 2  32.13 
 
 
257 aa  92.8  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0240271  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  29.76 
 
 
285 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  24.92 
 
 
310 aa  91.7  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0138  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
389 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.15479  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0916  glycosyl transferase family 2  29.67 
 
 
336 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1866  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
250 aa  90.9  4e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1057  glycosyl transferase family 2  32.89 
 
 
259 aa  90.9  4e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0164  glycosyl transferase family 2  32.64 
 
 
262 aa  90.9  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.858664  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0478  glycosyl transferase family protein  31.1 
 
 
371 aa  90.1  5e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2299  glycosyl transferase family protein  28.63 
 
 
332 aa  89.7  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.705135  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  26.59 
 
 
307 aa  89.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1428  glycosyl transferase family protein  29 
 
 
244 aa  89.4  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2272  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
236 aa  89.4  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.632375  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6872  glycosyl transferase family 2  33.33 
 
 
266 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1802  glycosyl transferase family protein  27.5 
 
 
307 aa  87.4  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.319238  normal  0.13058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  27.63 
 
 
312 aa  87  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0430  glycosyl transferase family 2  32.19 
 
 
301 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2755  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
224 aa  86.3  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0370264  hitchhiker  0.00782478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3624  glycosyl transferase family protein  31.5 
 
 
245 aa  85.9  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1414  glycosyl transferase family protein  27.73 
 
 
276 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00402537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4546  glycosyl transferase family 2  30.16 
 
 
335 aa  85.5  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.947898  normal  0.992745 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1579  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.21948  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1592  glycosyl transferase family protein  30.95 
 
 
346 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  27.16 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3686  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 
234 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.204283  hitchhiker  0.00350774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2922  glycosyl transferase family 2  34.56 
 
 
217 aa  85.1  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.895357  hitchhiker  0.00151129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1537  glycosyl transferase family 2  29.63 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0148  succinoglycan biosynthesis protein  30.08 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1701  glycosyl transferase family protein  26.56 
 
 
276 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0805319 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0447  glycosyl transferase family 2  31.36 
 
 
284 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.397578  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4238  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.440412  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0128  glycosyl transferase family protein  29.65 
 
 
393 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.388343  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  29.44 
 
 
291 aa  84  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0866  glycosyl transferase family protein  28.23 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0462  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
388 aa  83.6  0.000000000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.215189  hitchhiker  0.000000773119 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1566  cell wall membrane glycosyltransferase  28.88 
 
 
314 aa  84  0.000000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.901523  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2490  glycosyl transferase family 2  28.52 
 
 
344 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1767  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
331 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3114  glycosyl transferase family protein  28.09 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.482779  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  30.35 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  27.14 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1456  glycosyl transferase family protein  30.65 
 
 
241 aa  82.8  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000411499  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8285  glycosyl transferase family 2  33.67 
 
 
694 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.493669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3959  glycosyl transferase family 2  27.95 
 
 
236 aa  81.6  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.568122  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
344 aa  82  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2259  putative glycosyl transferase  28.02 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3320  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.15 
 
 
301 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0979  glycosyl transferase family protein  36.8 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0825  glycosyl transferase family 2  27.2 
 
 
251 aa  80.9  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2716  glycosyl transferase family 2  32.2 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  30.36 
 
 
355 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  28.23 
 
 
295 aa  80.9  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1703  glycosyl transferase family 2  27.7 
 
 
331 aa  80.9  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4281  glycosyl transferase family 2  31.94 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4956  glycosyl transferase family 2  32.23 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0193051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2408  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.09 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3395  undecaprenyl phosphate 4-deoxy-4-formamido-L-arabinose transferase  24.09 
 
 
322 aa  80.1  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 
229 aa  79.7  0.00000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1038  glycosyl transferase family protein  28.75 
 
 
685 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.152383  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3029  glycosyl transferase family 2  28.92 
 
 
613 aa  79.7  0.00000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.586376  normal  0.0326144 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  32.16 
 
 
313 aa  79.3  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>