More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4139 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B3529  malate dehydrogenase  58.44 
 
 
570 aa  644    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1873  malate dehydrogenase  58.98 
 
 
577 aa  644    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1922  malate dehydrogenase  58.62 
 
 
570 aa  643    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1668  malate dehydrogenase  58.62 
 
 
570 aa  644    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1650  malate dehydrogenase  58.62 
 
 
577 aa  642    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1615  malate dehydrogenase  58.26 
 
 
577 aa  638    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1812  malate dehydrogenase  58.98 
 
 
570 aa  647    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1848  malate dehydrogenase  58.62 
 
 
570 aa  644    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000107878 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1801  malate dehydrogenase  58.62 
 
 
577 aa  644    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4139  malate dehydrogenase  100 
 
 
571 aa  1157    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000025754  hitchhiker  0.000138599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1666  malate dehydrogenase  58.8 
 
 
570 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2964  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating)  64.67 
 
 
572 aa  701    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.10034  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1302  malate dehydrogenase  99.65 
 
 
571 aa  1154    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0218032  normal  0.203099 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4404  malate dehydrogenase  58.65 
 
 
570 aa  607  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00620  malate dehydrogenase  56.99 
 
 
609 aa  595  1e-168  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0486  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  56.06 
 
 
596 aa  569  1e-161  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12356  malate dehydrogenase  50.84 
 
 
548 aa  536  1e-151  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2546  malate dehydrogenase  48.25 
 
 
565 aa  509  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1243  malate dehydrogenase  45.32 
 
 
571 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1243  malate dehydrogenase  45.32 
 
 
571 aa  509  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1005  malate dehydrogenase  46.68 
 
 
542 aa  511  1e-143  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2971  malate dehydrogenase  47.51 
 
 
565 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.419193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1494  malate dehydrogenase  47.7 
 
 
565 aa  501  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1786  Malate dehydrogenase (oxaloacetate- decarboxylating) (NADP(+))  48.35 
 
 
552 aa  495  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1564  malate dehydrogenase  46.01 
 
 
541 aa  494  9.999999999999999e-139  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01437  malate dehydrogenase, (decarboxylating, NAD-requiring) (malic enzyme)  46.51 
 
 
565 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00511494  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2168  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)  46.51 
 
 
565 aa  490  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.399362  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1695  malate dehydrogenase  46.69 
 
 
565 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.488975  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2178  malate dehydrogenase  46.51 
 
 
565 aa  489  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2451  malate dehydrogenase  46.22 
 
 
565 aa  488  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1661  malate dehydrogenase  46.69 
 
 
565 aa  491  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1564  malate dehydrogenase  46.51 
 
 
565 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1742  malate dehydrogenase  46.69 
 
 
565 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.375647  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01449  hypothetical protein  46.51 
 
 
565 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0044137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1567  malate dehydrogenase  46.22 
 
 
565 aa  486  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2901  malate dehydrogenase  44.44 
 
 
556 aa  488  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2562  malate dehydrogenase  47.07 
 
 
565 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2463  malate dehydrogenase  47.07 
 
 
565 aa  488  1e-136  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1532  malate dehydrogenase  44.57 
 
 
542 aa  485  1e-136  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1191  malate dehydrogenase  44.77 
 
 
544 aa  485  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.16614  normal  0.0761619 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2047  malate dehydrogenase  46.88 
 
 
565 aa  483  1e-135  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.418524 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2091  malate dehydrogenase  46.51 
 
 
565 aa  484  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3043  malate dehydrogenase  43.78 
 
 
556 aa  481  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2621  malate dehydrogenase  45.7 
 
 
562 aa  481  1e-134  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.898165 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0750  malate dehydrogenase  45.52 
 
 
562 aa  478  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.036774 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3855  malate dehydrogenase  45.34 
 
 
562 aa  476  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3924  malate dehydrogenase  47.05 
 
 
573 aa  476  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.694196  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1599  malate dehydrogenase  46.14 
 
 
565 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1743  malate dehydrogenase  46.14 
 
 
565 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.260406  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1682  malate dehydrogenase  46.14 
 
 
565 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.638669 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0902  malate dehydrogenase  44.51 
 
 
562 aa  476  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1680  malate dehydrogenase  46.14 
 
 
565 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.13099  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1777  malate dehydrogenase  46.14 
 
 
565 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3188  malate dehydrogenase  45.16 
 
 
562 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000330281 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0778  malate dehydrogenase  45.16 
 
 
562 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0299274 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3704  malate dehydrogenase  48.46 
 
 
574 aa  473  1e-132  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0303465 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1836  malate dehydrogenase  49.09 
 
 
570 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1561  malate dehydrogenase  46.06 
 
 
563 aa  474  1e-132  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.501858  hitchhiker  0.00674056 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1274  malate dehydrogenase  43.25 
 
 
562 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.145162  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0736  malate dehydrogenase  44.44 
 
 
562 aa  472  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0724  malate dehydrogenase  45.59 
 
 
564 aa  475  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0833  malate dehydrogenase  44.77 
 
 
562 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3518  malate dehydrogenase  44.59 
 
 
562 aa  473  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3186  malate dehydrogenase  44.3 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0809  malate dehydrogenase  43.88 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3757  malate dehydrogenase  44.69 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0784  malate dehydrogenase  44.69 
 
 
562 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.228066  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02034  malate dehydrogenase  43.88 
 
 
562 aa  469  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3566  malate dehydrogenase  44.32 
 
 
562 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3634  malate dehydrogenase  44.32 
 
 
562 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.532529  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003737  NAD-dependent malic enzyme  43.22 
 
 
562 aa  466  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0866358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2962  malate dehydrogenase  44.51 
 
 
562 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0676  malate dehydrogenase  44.51 
 
 
562 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0979  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  46.31 
 
 
577 aa  459  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1127  malate dehydrogenase  43.91 
 
 
565 aa  458  9.999999999999999e-129  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0888  malate dehydrogenase  43.73 
 
 
565 aa  457  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.950644  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89732  mitochondrial malate dehydrogenase  41.22 
 
 
638 aa  457  1e-127  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06933  conserved hypothetical protein similar to yeast mitochondrial NAD-dependent malic enzyme (Eurofung)  42.91 
 
 
581 aa  450  1e-125  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF03780  malate dehydrogenase, putative  46.68 
 
 
629 aa  451  1e-125  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.807689  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1242  malate dehydrogenase  46.51 
 
 
569 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4262  malate dehydrogenase  42.28 
 
 
562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2079  Malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating) (NADP(+))  47.01 
 
 
579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.128788  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3529  malate dehydrogenase  50.28 
 
 
568 aa  448  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00517  malate dehydrogenase  44.12 
 
 
563 aa  446  1.0000000000000001e-124  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0537  malate dehydrogenase  42.46 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0982  malate dehydrogenase  41.91 
 
 
560 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.871776  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2155  malate dehydrogenase  44.28 
 
 
582 aa  439  9.999999999999999e-123  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19190  malate dehydrogenase  45.22 
 
 
564 aa  442  9.999999999999999e-123  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.408174 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2154  malate dehydrogenase  46.57 
 
 
578 aa  433  1e-120  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1387  malate dehydrogenase  40.99 
 
 
560 aa  432  1e-119  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2963  malate dehydrogenase  45.22 
 
 
561 aa  429  1e-119  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1656  malate dehydrogenase  45.04 
 
 
564 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.843142  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3293  malate dehydrogenase  43.67 
 
 
555 aa  417  9.999999999999999e-116  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0767  malate dehydrogenase  41.71 
 
 
556 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI02230  nad-dependent malic enzyme, putative  41.59 
 
 
584 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5810  malate dehydrogenase  40.62 
 
 
543 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.414547  normal  0.345135 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1744  malate dehydrogenase  39.68 
 
 
571 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.945317  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26919  predicted protein  40.57 
 
 
565 aa  405  1e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0661  malate dehydrogenase  40.3 
 
 
535 aa  397  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.245423 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_56501  predicted protein  39.25 
 
 
638 aa  384  1e-105  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.511026  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>