More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4113 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4113  beta-lactamase domain protein  100 
 
 		 355 aa  719    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.011437  normal  0.053603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  31.45 
 
 		 327 aa  133  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 368 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  30.7 
 
 		 341 aa  128  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  31 
 
 		 348 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.56 
 
 		 321 aa  125  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0253  metallo-beta-lactamase family protein  29.74 
 
 		 365 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.921693 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1079  beta-lactamase domain protein  29.35 
 
 		 332 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0383209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  30.63 
 
 		 331 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 321 aa  119  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  31.06 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 		 334 aa  115  7.999999999999999e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  29.77 
 
 		 363 aa  112  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  28.28 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  29.91 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.95 
 
 		 331 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  27.94 
 
 		 383 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  28.86 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 329 aa  109  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  28.99 
 
 		 334 aa  109  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  27.44 
 
 		 310 aa  108  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  28.27 
 
 		 354 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  26.5 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  28.19 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  30.03 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  28.19 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  28.19 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  27.89 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  28.19 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  29.45 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  27.99 
 
 		 334 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3086  metallo-beta-lactamase family protein  29.08 
 
 		 349 aa  107  4e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.825394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  28.61 
 
 		 328 aa  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5264  beta-lactamase-like  27.93 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 342 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  29.46 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 359 aa  106  8e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4562  Beta-lactamase-like  28.78 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.809352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  29.46 
 
 		 359 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  26.45 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  29.63 
 
 		 400 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  27.96 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  27.53 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.84 
 
 		 346 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  28.36 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  29.17 
 
 		 359 aa  103  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  23.51 
 
 		 324 aa  102  9e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  25.84 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  29.17 
 
 		 358 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  29.12 
 
 		 384 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  27.94 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.93 
 
 		 335 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  26.55 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2600  beta-lactamase domain-containing protein  25.46 
 
 		 345 aa  100  5e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  27.62 
 
 		 359 aa  100  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  26.48 
 
 		 324 aa  100  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0062  beta-lactamase domain-containing protein  30.91 
 
 		 336 aa  100  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  26.63 
 
 		 366 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  27.89 
 
 		 359 aa  99.8  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 		 361 aa  99.8  7e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  28.66 
 
 		 332 aa  98.6  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 		 349 aa  99  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0741  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.14 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.844995  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  26.87 
 
 		 359 aa  98.2  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2397  beta-lactamase domain-containing protein  27.84 
 
 		 344 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.21584  normal  0.814785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 322 aa  97.8  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  27.95 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  28.05 
 
 		 339 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  25.6 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.09 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  24.85 
 
 		 343 aa  96.3  6e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  29.31 
 
 		 352 aa  95.9  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0465  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 357 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  27.79 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  25.47 
 
 		 358 aa  94.4  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  25.54 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0337  beta-lactamase domain-containing protein  29.48 
 
 		 336 aa  94.4  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4251  putative metallo-beta-lactamase superfamily protein  28.2 
 
 		 357 aa  93.6  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.342604  normal  0.241726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  27.94 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 		 329 aa  92.8  7e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3893  beta-lactamase-like  26.69 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.042904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  23.37 
 
 		 325 aa  92.4  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3058  beta-lactamase-like  25.98 
 
 		 329 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  25.71 
 
 		 320 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  26.81 
 
 		 351 aa  91.3  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  26.14 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3168  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 337 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00770543  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  24.23 
 
 		 324 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2461  beta-lactamase domain-containing protein  28.61 
 
 		 344 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.889355 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4193  beta-lactamase-like  23.88 
 
 		 394 aa  90.5  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  28.52 
 
 		 354 aa  90.1  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  27.34 
 
 		 374 aa  90.1  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  24.15 
 
 		 323 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  25.51 
 
 		 359 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  25.83 
 
 		 352 aa  89  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  25.52 
 
 		 359 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  25.89 
 
 		 328 aa  88.2  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>