More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4066 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4066  ABC transporter related  100 
 
 		 293 aa  579  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.376431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  62.4 
 
 		 264 aa  287  2e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  58.44 
 
 		 255 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  62.5 
 
 		 258 aa  276  4e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0673  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  56.79 
 
 		 263 aa  275  6e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.263791  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7899  ABC transporter related  60.34 
 
 		 277 aa  275  7e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  61.37 
 
 		 266 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  58.63 
 
 		 262 aa  274  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  60 
 
 		 280 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  60.76 
 
 		 277 aa  273  3e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  58.02 
 
 		 258 aa  271  1e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  58.12 
 
 		 256 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  60.09 
 
 		 255 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  59.66 
 
 		 253 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  57.44 
 
 		 247 aa  268  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  55.92 
 
 		 250 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.37 
 
 		 274 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  60.42 
 
 		 258 aa  265  5e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  53.53 
 
 		 291 aa  265  8e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  58.26 
 
 		 256 aa  263  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  57.52 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  59.03 
 
 		 255 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  59.91 
 
 		 252 aa  259  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  58.59 
 
 		 255 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  52.85 
 
 		 279 aa  258  1e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  56.6 
 
 		 259 aa  257  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  59.73 
 
 		 455 aa  257  2e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  59.41 
 
 		 257 aa  256  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  56.22 
 
 		 247 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  56.96 
 
 		 264 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2824  ABC transporter related  55.33 
 
 		 268 aa  253  2.0000000000000002e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.266622  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  58.9 
 
 		 312 aa  253  3e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  57.26 
 
 		 271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8137  ABC transporter related  55.6 
 
 		 258 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  59.66 
 
 		 255 aa  251  7e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  56.65 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  49.1 
 
 		 227 aa  247  2e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  56.64 
 
 		 445 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4858  ABC transporter related protein  57.48 
 
 		 261 aa  241  9e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  47.79 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0646  ABC transporter related protein  48.69 
 
 		 279 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.904243  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 243 aa  239  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  56.65 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3006  ABC transporter related  58.44 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.829082  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  55.56 
 
 		 245 aa  238  9e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  54.66 
 
 		 288 aa  237  2e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  54.78 
 
 		 256 aa  235  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  46.4 
 
 		 227 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4049  ABC transporter related  55.96 
 
 		 250 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0191001  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  49.6 
 
 		 269 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  52.59 
 
 		 244 aa  233  3e-60  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  52.08 
 
 		 266 aa  232  4.0000000000000004e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  51.25 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  53.85 
 
 		 245 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  55.88 
 
 		 258 aa  229  3e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  50.92 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  49.32 
 
 		 229 aa  226  5.0000000000000005e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2178  ABC transporter-related protein  46.52 
 
 		 248 aa  225  6e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  54.01 
 
 		 255 aa  223  3e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  51.72 
 
 		 253 aa  223  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  53.39 
 
 		 272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  49.79 
 
 		 244 aa  222  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  50.86 
 
 		 239 aa  222  6e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  48.64 
 
 		 225 aa  221  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3337  ABC transporter, ATP-binding protein  48.43 
 
 		 246 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0440126  decreased coverage  0.00217746 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  57.51 
 
 		 249 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  52.48 
 
 		 249 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  45.5 
 
 		 237 aa  219  5e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  44.89 
 
 		 226 aa  218  7.999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1963  ABC transporter related  55.66 
 
 		 248 aa  218  1e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  49.31 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  50.92 
 
 		 240 aa  217  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  47.25 
 
 		 230 aa  217  2e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  50.23 
 
 		 241 aa  217  2e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0064  ABC transporter-related protein  49.1 
 
 		 222 aa  216  4e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.283331  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  48.15 
 
 		 241 aa  214  9.999999999999999e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3510  ABC transporter related protein  51.03 
 
 		 255 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  47 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  50.62 
 
 		 277 aa  212  4.9999999999999996e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  47.93 
 
 		 241 aa  212  7e-54  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3270  ABC transporter-like protein  48.46 
 
 		 248 aa  211  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.407136  normal  0.180128 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  46.4 
 
 		 230 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  49 
 
 		 271 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  51.74 
 
 		 243 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0493  ABC transporter related  48.13 
 
 		 259 aa  210  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  54.19 
 
 		 241 aa  210  3e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  45.61 
 
 		 235 aa  209  4e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  44.94 
 
 		 247 aa  209  5e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2324  ABC transporter related  44.35 
 
 		 256 aa  209  5e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.232947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8875  ABC transporter-related protein  50.22 
 
 		 243 aa  208  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0534003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2247  ABC transporter related protein  51.67 
 
 		 247 aa  207  1e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.687068  normal  0.0553292 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0633  ABC transporter, ATPase subunit  45.22 
 
 		 252 aa  207  1e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0652413  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0194  hypothetical protein  46.67 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000219285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  50 
 
 		 644 aa  207  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  50.44 
 
 		 248 aa  207  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  43.48 
 
 		 234 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  43.46 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2931  ABC transporter related  47.79 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000152083  normal  0.599943 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.58 
 
 		 241 aa  206  4e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0802  ABC transporter related protein  51.36 
 
 		 233 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.61127  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>