More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4035 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
679 aa  1330    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.14 
 
 
706 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.05 
 
 
706 aa  601  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.7 
 
 
713 aa  576  1.0000000000000001e-163  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  51.94 
 
 
734 aa  578  1.0000000000000001e-163  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.48 
 
 
689 aa  568  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.72 
 
 
723 aa  554  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.2 
 
 
718 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.93 
 
 
691 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.93 
 
 
691 aa  545  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.85 
 
 
706 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.99 
 
 
724 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.86 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.12 
 
 
712 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.22 
 
 
691 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.29 
 
 
704 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.71 
 
 
754 aa  537  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.68 
 
 
745 aa  526  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.71 
 
 
979 aa  522  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.28 
 
 
749 aa  522  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.97 
 
 
788 aa  520  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.63 
 
 
729 aa  521  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  47.38 
 
 
691 aa  517  1.0000000000000001e-145  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.78 
 
 
712 aa  508  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.06 
 
 
708 aa  505  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.59 
 
 
762 aa  504  1e-141  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.89 
 
 
708 aa  502  1e-140  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.37 
 
 
741 aa  496  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  48.41 
 
 
714 aa  498  1e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.79 
 
 
697 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.18 
 
 
693 aa  490  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.81 
 
 
766 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.59 
 
 
756 aa  485  1e-136  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.33 
 
 
698 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.62 
 
 
756 aa  480  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.77 
 
 
733 aa  480  1e-134  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.62 
 
 
697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.3 
 
 
693 aa  468  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.62 
 
 
698 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.76 
 
 
695 aa  450  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.08 
 
 
699 aa  452  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.29 
 
 
698 aa  451  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.66 
 
 
698 aa  447  1.0000000000000001e-124  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.94 
 
 
691 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 
691 aa  424  1e-117  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.8 
 
 
448 aa  211  4e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.63 
 
 
543 aa  208  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.84 
 
 
602 aa  207  5e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.72 
 
 
545 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.41 
 
 
543 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.41 
 
 
543 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.92 
 
 
1376 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.24 
 
 
600 aa  196  8.000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.61 
 
 
646 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.37 
 
 
717 aa  188  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.19 
 
 
616 aa  189  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  36.76 
 
 
597 aa  187  4e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.62 
 
 
731 aa  187  5e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.85 
 
 
562 aa  187  7e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.54 
 
 
624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  33.71 
 
 
669 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
714 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  37.84 
 
 
608 aa  186  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.26 
 
 
535 aa  185  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.1 
 
 
552 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  34.49 
 
 
679 aa  185  3e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.94 
 
 
707 aa  184  4.0000000000000006e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.62 
 
 
662 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.08 
 
 
705 aa  184  6e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0930  hypothetical protein  37.54 
 
 
608 aa  184  6e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.67 
 
 
451 aa  184  6e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.08 
 
 
705 aa  184  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
620 aa  184  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.69 
 
 
606 aa  183  8.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  30.63 
 
 
705 aa  183  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.62 
 
 
662 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  30.63 
 
 
705 aa  182  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.63 
 
 
705 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.46 
 
 
557 aa  182  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.62 
 
 
662 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.62 
 
 
662 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.98 
 
 
617 aa  182  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.53 
 
 
556 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.84 
 
 
708 aa  181  2.9999999999999997e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.18 
 
 
705 aa  181  4.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.35 
 
 
716 aa  181  4.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  33.83 
 
 
1715 aa  181  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.51 
 
 
546 aa  180  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.49 
 
 
588 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.07 
 
 
630 aa  179  1e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.83 
 
 
588 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  38.83 
 
 
618 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.69 
 
 
634 aa  178  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.18 
 
 
705 aa  178  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41 
 
 
636 aa  178  3e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.17 
 
 
563 aa  178  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.71 
 
 
681 aa  178  3e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.18 
 
 
615 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.3 
 
 
607 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.77 
 
 
625 aa  177  4e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>