93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4012 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4012  protein of unknown function DUF881  100 
 
 		 255 aa  490  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033042  normal  0.20128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11855  hypothetical protein  53.95 
 
 		 292 aa  206  2e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2846  hypothetical protein  51.12 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2877  hypothetical protein  51.12 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2890  hypothetical protein  51.12 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2728  protein of unknown function DUF881  49.77 
 
 		 309 aa  195  5.000000000000001e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.428607  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3137  hypothetical protein  51.18 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.428458  normal  0.0440298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3404  hypothetical protein  49.06 
 
 		 254 aa  186  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227023  normal  0.997243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1737  protein of unknown function DUF881  43.75 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.588526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1887  protein of unknown function DUF881  46.79 
 
 		 388 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.201634 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2103  protein of unknown function DUF881  43.85 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1228  hypothetical protein  39.67 
 
 		 271 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.861927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18250  hypothetical protein  40.18 
 
 		 436 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1303  protein of unknown function DUF881  44.1 
 
 		 333 aa  146  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.412447  normal  0.898355 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4999  hypothetical protein  42.52 
 
 		 283 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2384  hypothetical protein  42.26 
 
 		 305 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2522  hypothetical protein  44.86 
 
 		 309 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3098  protein of unknown function DUF881  42.92 
 
 		 258 aa  135  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0118387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3126  protein of unknown function DUF881  43.56 
 
 		 571 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1466  hypothetical protein  39.44 
 
 		 296 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.082287 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15510  hypothetical protein  39.58 
 
 		 250 aa  123  3e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0474  hypothetical protein  30.5 
 
 		 273 aa  122  4e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.166474  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0799  hypothetical protein  29.89 
 
 		 278 aa  113  3e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14990  hypothetical protein  38.73 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal  0.621189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0214  hypothetical protein  28.63 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2715  hypothetical protein  36.54 
 
 		 245 aa  96.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0632611  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2006  hypothetical protein  27.51 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.124974  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1024  protein of unknown function DUF881  26.52 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000489323  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0830  hypothetical protein  26.61 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0105495  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0781  protein of unknown function DUF881  26.48 
 
 		 247 aa  89  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000128964  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1557  protein of unknown function DUF881  30.49 
 
 		 234 aa  84.7  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000499262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0681  hypothetical protein  29.6 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0718153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1284  protein of unknown function DUF881  28.29 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.954105  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1558  protein of unknown function DUF881  30.34 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0909499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1430  hypothetical protein  31.38 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0373579  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1894  protein of unknown function DUF881  25.45 
 
 		 234 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1061  protein of unknown function DUF881  25.97 
 
 		 234 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2250  hypothetical protein  31.95 
 
 		 242 aa  73.2  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1431  hypothetical protein  30.26 
 
 		 238 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2282  hypothetical protein  30.8 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0713183  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0570  protein of unknown function DUF881  30.89 
 
 		 236 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2249  hypothetical protein  28.65 
 
 		 244 aa  69.7  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1060  protein of unknown function DUF881  29.49 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1823  hypothetical protein  21.43 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00133406  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0680  hypothetical protein  29.07 
 
 		 233 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.196339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2109  hypothetical protein  21.01 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0163543  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0014  protein of unknown function DUF881  29.71 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1075  hypothetical protein  27.49 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2717  hypothetical protein  32.45 
 
 		 286 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.270572  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2111  hypothetical protein  20.64 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1889  protein of unknown function DUF881  35.92 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1230  hypothetical protein  35.37 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1305  protein of unknown function DUF881  32.47 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.498875  normal  0.86691 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0476  hypothetical protein  23.79 
 
 		 325 aa  57  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.75906  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1825  hypothetical protein  19.72 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0612463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0147  protein of unknown function DUF881  26.56 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2105  protein of unknown function DUF881  34.29 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.489208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00160  hypothetical protein  27.45 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0015  hypothetical protein  28.72 
 
 		 263 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11853  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0814  hypothetical protein  28.07 
 
 		 253 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244335  normal  0.77774 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10012  hypothetical protein  31.08 
 
 		 262 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0026  protein of unknown function DUF881  28.21 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.131728  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1386  hypothetical protein  29.41 
 
 		 266 aa  53.1  0.000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00318701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2283  hypothetical protein  28.77 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0076216  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1735  protein of unknown function DUF881  29.53 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.980276  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0021  hypothetical protein  30.52 
 
 		 273 aa  52.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3123  protein of unknown function DUF881  29.38 
 
 		 292 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0148  protein of unknown function DUF881  32.04 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3139  hypothetical protein  30.56 
 
 		 297 aa  52  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.739735  normal  0.0458483 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0021  hypothetical protein  28.24 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0210861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0013  hypothetical protein  28.57 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.447564 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0013  hypothetical protein  28.24 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0042  protein of unknown function DUF881  27.31 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12540  hypothetical protein  28.15 
 
 		 331 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0569  protein of unknown function DUF881  23.94 
 
 		 243 aa  50.1  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.787113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0167  protein of unknown function DUF881  27.11 
 
 		 253 aa  50.1  0.00004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.942049  normal  0.647694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2892  hypothetical protein  31.96 
 
 		 304 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.619599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2848  hypothetical protein  31.96 
 
 		 304 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2879  hypothetical protein  31.96 
 
 		 304 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3406  hypothetical protein  32.99 
 
 		 296 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.529097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1076  hypothetical protein  26.47 
 
 		 237 aa  48.9  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0072  protein of unknown function DUF881  33.08 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0052  hypothetical protein  32.05 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.274482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0021  protein of unknown function DUF881  31.03 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0020  hypothetical protein  26.99 
 
 		 272 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.987463 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4014  protein of unknown function DUF881  29.68 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.328568  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15490  hypothetical protein  30.16 
 
 		 315 aa  46.2  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18230  hypothetical protein  31.43 
 
 		 288 aa  45.4  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509539  normal  0.646857 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1025  protein of unknown function DUF881  22.73 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000540335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0022  protein of unknown function DUF881  28.3 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3100  protein of unknown function DUF881  34.29 
 
 		 290 aa  43.5  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15010  hypothetical protein  26.11 
 
 		 276 aa  42.7  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.290964  normal  0.849672 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>