More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4005 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4005  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 442 aa  863    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0701044 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0823  major facilitator superfamily MFS_1  57.49 
 
 		 418 aa  377  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0490  major facilitator superfamily MFS_1  49.17 
 
 		 461 aa  363  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4354  major facilitator superfamily MFS_1  49.75 
 
 		 431 aa  361  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.95952  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0768  major facilitator superfamily MFS_1  48.72 
 
 		 456 aa  360  3e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8887  hypothetical protein  51.55 
 
 		 413 aa  356  3.9999999999999996e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.889317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0242  putative integral membrane efflux protein  50.49 
 
 		 424 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.305732  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0875  major facilitator superfamily MFS_1  47.09 
 
 		 441 aa  352  5.9999999999999994e-96  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00780765  normal  0.0882707 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1991  major facilitator superfamily MFS_1  50.54 
 
 		 450 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.762129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3926  major facilitator transporter  48.76 
 
 		 457 aa  347  2e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33950  arabinose efflux permease family protein  50.52 
 
 		 414 aa  342  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.466548  normal  0.73086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4177  major facilitator superfamily MFS_1  48.9 
 
 		 476 aa  339  5e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8792  major facilitator superfamily MFS_1  47.3 
 
 		 420 aa  339  5e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.462854  normal  0.589111 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0844  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 		 403 aa  338  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30800  arabinose efflux permease family protein  47.17 
 
 		 452 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0491  major facilitator superfamily MFS_1  47.57 
 
 		 424 aa  337  2.9999999999999997e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2475  major facilitator superfamily MFS_1  47.78 
 
 		 494 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.495662  normal  0.811847 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2027  major facilitator superfamily MFS_1  48.97 
 
 		 436 aa  332  1e-89  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2022  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  45.48 
 
 		 446 aa  330  2e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.384962  normal  0.0286256 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2952  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 405 aa  330  3e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5813  major facilitator superfamily MFS_1  48.53 
 
 		 446 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.243583  normal  0.354769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1325  major facilitator superfamily MFS_1  50 
 
 		 419 aa  327  2.0000000000000001e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.327447 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2814  major facilitator superfamily MFS_1  49.34 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3881  major facilitator transporter  47.75 
 
 		 509 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3588  major facilitator superfamily MFS_1  47.23 
 
 		 428 aa  314  1.9999999999999998e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.273478 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0786  major facilitator transporter  47.66 
 
 		 418 aa  313  4.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3727  major facilitator transporter  48.53 
 
 		 416 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.274242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4326  major facilitator superfamily MFS_1  46.4 
 
 		 404 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6343  major facilitator superfamily MFS_1  44.22 
 
 		 435 aa  310  4e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.510834  hitchhiker  0.000175269 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0110  major facilitator transporter  47.51 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4055  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4311  major facilitator transporter  46.93 
 
 		 413 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.481156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3206  major facilitator transporter  47.03 
 
 		 413 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.130501  normal  0.812744 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1700  hypothetical protein  48.38 
 
 		 412 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.761256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3288  major facilitator superfamily protein  49.17 
 
 		 405 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.234831 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1030  major facilitator superfamily MFS_1  45.5 
 
 		 419 aa  307  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2847  major facilitator superfamily MFS_1  44.84 
 
 		 432 aa  307  3e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4296  major facilitator transporter  48.27 
 
 		 416 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.970953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4715  major facilitator transporter  49.33 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3486  major facilitator transporter  48.66 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.719238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0792  major facilitator transporter  47.53 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3670  major facilitator superfamily MFS_1  45.1 
 
 		 475 aa  301  2e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2848  major facilitator superfamily MFS_1  47.51 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5433  major facilitator superfamily MFS_1  46.11 
 
 		 417 aa  296  5e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.317246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0819  major facilitator superfamily MFS_1  49.6 
 
 		 452 aa  295  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05410  arabinose efflux permease family protein  42.72 
 
 		 429 aa  293  3e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0915887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7222  major facilitator transporter  45.04 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5002  MFS family membrane efflux protein  47.33 
 
 		 441 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1284  major facilitator superfamily MFS_1  44.5 
 
 		 431 aa  289  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5851  major facilitator superfamily MFS_1  41.77 
 
 		 425 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.917844  normal  0.985013 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7122  MFS permease  40.05 
 
 		 426 aa  281  2e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2754  major facilitator superfamily MFS_1  40.56 
 
 		 453 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0684  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 412 aa  273  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00476606  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1000  hypothetical protein  43.13 
 
 		 418 aa  273  6e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00447157 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1259  major facilitator transporter  46.09 
 
 		 491 aa  272  8.000000000000001e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0884652  normal  0.0333983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0506  major facilitator transporter  41.56 
 
 		 426 aa  264  2e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.204304  hitchhiker  0.00963798 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1272  major facilitator transporter  37.82 
 
 		 418 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0418  major facilitator transporter  40.94 
 
 		 426 aa  256  5e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1484  major facilitator transporter  37.85 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.178978  normal  0.0348378 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2413  major facilitator transporter  42.67 
 
 		 412 aa  254  3e-66  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00423271  normal  0.219014 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0476  major facilitator transporter  41.6 
 
 		 474 aa  253  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0395  permease  37.14 
 
 		 430 aa  253  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0177527  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0732  major facilitator superfamily MFS_1  41.67 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000169813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3952  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 413 aa  246  6e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3037  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 421 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2326  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 410 aa  240  2.9999999999999997e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0331  major facilitator transporter  37.16 
 
 		 412 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1613  major facilitator superfamily MFS_1  36.13 
 
 		 418 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000260989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3120  major facilitator superfamily MFS_1  43.6 
 
 		 428 aa  232  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2380  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 474 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0389897  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2206  major facilitator transporter  37.69 
 
 		 447 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5814  major facilitator superfamily MFS_1  33.33 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.915234  hitchhiker  0.00491963 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0091  major facilitator superfamily MFS_1  38.37 
 
 		 442 aa  225  1e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3320  major facilitator transporter  42.93 
 
 		 425 aa  224  2e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.104451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0056  major facilitator superfamily MFS_1  35.84 
 
 		 433 aa  224  3e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1813  major facilitator superfamily permease  33.68 
 
 		 410 aa  221  9.999999999999999e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3626  major facilitator transporter  40.41 
 
 		 413 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.348332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0087  major facilitator transporter  36.17 
 
 		 436 aa  218  2e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0062  major facilitator superfamily MFS_1  35.63 
 
 		 440 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1250  major facilitator superfamily MFS_1  37.78 
 
 		 378 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0053  transporter, putative  37.41 
 
 		 431 aa  211  2e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0176  major facilitator transporter  38.15 
 
 		 426 aa  209  9e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.379469  normal  0.234316 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0752  transporter, putative  35.94 
 
 		 446 aa  208  2e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4779  major facilitator transporter  35.03 
 
 		 428 aa  206  5e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000206756  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2384  major facilitator transporter  36.39 
 
 		 441 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.930234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0651  major facilitator superfamily MFS_1  34.1 
 
 		 413 aa  204  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1508  major facilitator superfamily permease  32.72 
 
 		 403 aa  199  7e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1224  major facilitator superfamily MFS_1  37.03 
 
 		 440 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2024  major facilitator superfamily MFS_1  33.42 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1974  hypothetical protein  32.81 
 
 		 424 aa  197  3e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00936884  normal  0.989231 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1049  major facilitator superfamily MFS_1  35.92 
 
 		 421 aa  196  7e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0990  major facilitator transporter  36.71 
 
 		 414 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.00457828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0181  major facilitator superfamily MFS_1  34.53 
 
 		 401 aa  191  2e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0968  major facilitator superfamily MFS_1  34 
 
 		 432 aa  190  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.896564  normal  0.510346 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2392  major facilitator superfamily MFS_1  35.64 
 
 		 415 aa  188  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000384037  normal  0.689164 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0950  hypothetical protein  37.47 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2519  major facilitator superfamily MFS_1  37.54 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23190  arabinose efflux permease family protein  33.78 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.108135  normal  0.595786 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3756  major facilitator superfamily MFS_1  29.9 
 
 		 409 aa  183  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4358  major facilitator transporter  38.03 
 
 		 426 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.569485  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>