More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3940 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3940  Methyltransferase type 11  100 
 
 
262 aa  489  1e-137  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.524617  normal  0.24387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5788  Methyltransferase type 12  51.63 
 
 
243 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4926  Methyltransferase type 11  49.27 
 
 
252 aa  154  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.16451  normal  0.0585071 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3464  methyltransferase type 11  49.77 
 
 
249 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0475337  hitchhiker  0.00905238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2941  Methyltransferase type 11  47.91 
 
 
257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000129742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1647  Methyltransferase type 12  47.66 
 
 
263 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.505504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0881  Methyltransferase type 11  46.52 
 
 
256 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25080  methyltransferase family protein  44.23 
 
 
250 aa  140  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.779034  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3077  methyltransferase type 11  44.64 
 
 
252 aa  139  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.531691  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1392  type 11 methyltransferase  41.67 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.206555  normal  0.0445772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1401  methyltransferase type 11  42.17 
 
 
270 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.30255  hitchhiker  0.000533063 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3238  methyltransferase type 11  51.17 
 
 
256 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0679284  normal  0.0358471 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3214  Methyltransferase type 12  40.7 
 
 
265 aa  122  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.35564  hitchhiker  0.00217509 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3283  Methyltransferase type 11  45.74 
 
 
252 aa  122  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.48669  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2855  putative metallothionein SmtA  44.24 
 
 
252 aa  120  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0516683  normal  0.149663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1095  putative methyltransferase  44.44 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2568  putative metallothionein SmtA  27.52 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2658  putative metallothionein SmtA  27.52 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.492256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1968  putative metallothionein SmtA  27.52 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.768696 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  26.46 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1082  putative metallothionein SmtA  27.65 
 
 
261 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00106092  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00925  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00177111  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2722  Methyltransferase type 11  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000229495  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2675  putative metallothionein SmtA  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000353459  normal  0.415461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2199  putative metallothionein SmtA  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000201966  normal  0.110054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1028  putative metallothionein SmtA  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00000016657  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2403  putative metallothionein SmtA  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000691412  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1020  putative metallothionein SmtA  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000000367391  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00932  hypothetical protein  27.65 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00185326  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1776  putative metallothionein SmtA  27.43 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.529612  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1056  putative metallothionein SmtA  29.82 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0602785 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0997  putative metallothionein SmtA  29.82 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.266496  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1105  putative metallothionein SmtA  29.82 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.113863  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1089  putative metallothionein SmtA  29.82 
 
 
267 aa  73.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0480774  normal  0.198133 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2048  putative metallothionein SmtA  27.6 
 
 
261 aa  72  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.261011  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1440  putative metallothionein SmtA  28.07 
 
 
258 aa  72  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.119507  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5512  hypothetical protein  28.81 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1024  putative metallothionein SmtA  29.65 
 
 
267 aa  70.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.144274  normal  0.551504 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.82 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2302  putative metallothionein SmtA  28.05 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.710265  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  29.54 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  26.09 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0730  putative metallothionein SmtA  23.87 
 
 
259 aa  68.6  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0631637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0633  methyltransferase, putative  27.54 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4586  methyltransferase type 12  28.44 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.545494  normal  0.0935438 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1320  putative metallothionein SmtA  24.55 
 
 
260 aa  65.5  0.0000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000108011  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07260  SAM dependent methyltransferase  29.95 
 
 
252 aa  65.5  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.1 
 
 
229 aa  65.1  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63310  hypothetical protein  27.12 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.134236  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0740  methyltransferase type 11  29.11 
 
 
249 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01586  putative metallothionein SmtA  25.23 
 
 
263 aa  63.9  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0641  smtA protein  26.69 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  24.2 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1603  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.83 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.905646  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.75 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2330  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.58 
 
 
246 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.04 
 
 
232 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.05 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0736  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.59 
 
 
232 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421351  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0084  SmtA protein  26.34 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0872  methyltransferase type 11  25.43 
 
 
267 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00607117  hitchhiker  0.000000775855 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.09 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.09 
 
 
232 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36 
 
 
232 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.09 
 
 
232 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3117  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.76 
 
 
236 aa  59.3  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.930008  normal  0.012055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.21 
 
 
232 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003937  S-adenosylmethionine-dependent methyltransferase functionally coupled to the MukBEF chromosome partitioning mechanism  23.53 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000294838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  36.28 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0617  methyltransferase type 11  27.78 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0514794  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1859  gluconate transporter  28.02 
 
 
262 aa  58.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.660589 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.32 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.52 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2580  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.88 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1797  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.79 
 
 
235 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0461297  unclonable  0.00000318811 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2177  methyltransferase type 11  25.98 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0480419  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.14 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0578  methyltransferase, putative  27.78 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 
232 aa  57  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.78 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.78 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.98 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2165  methyltransferase type 12  29.55 
 
 
269 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.252103  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.48 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1622  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.78 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.89 
 
 
232 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3474  Methyltransferase type 12  41.74 
 
 
268 aa  56.2  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  36.04 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.3 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0440  methyltransferase type 12  22.03 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000034912  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.64 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0623  methyltransferase type 12  26.64 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  38.52 
 
 
232 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2201  putative metallothionein SmtA  27.52 
 
 
261 aa  55.8  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3523  methyltransferase type 12  22.22 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.538759  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>