58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3882 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3882  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  100 
 
 
318 aa  629  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.264087  normal  0.0481664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0484  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  44.98 
 
 
310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3263  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  44.82 
 
 
311 aa  220  1.9999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0104  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  33.96 
 
 
325 aa  142  6e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0089  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  32.59 
 
 
307 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3802  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  32.17 
 
 
316 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0138  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  29.57 
 
 
315 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4272  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  27.02 
 
 
311 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.351964  hitchhiker  0.000234797 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0132  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.04 
 
 
308 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0423  hypothetical protein  28.7 
 
 
315 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0417  hypothetical protein  26.52 
 
 
308 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0101  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.66 
 
 
307 aa  80.5  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4278  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  25.74 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.533396  hitchhiker  0.00544084 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3809  3-oxoacyl-(ACP) synthase III  26.21 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0086  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  25.57 
 
 
316 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0089  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.91 
 
 
325 aa  61.6  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1748  hypothetical protein  25.41 
 
 
331 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1791  hypothetical protein  25.41 
 
 
331 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00930231  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1930  hypothetical protein  25.41 
 
 
331 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.877673  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1966  hypothetical protein  25.41 
 
 
331 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000549282 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0518  hypothetical protein  23.55 
 
 
342 aa  58.9  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.397624  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0074  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  23.55 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0395439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20950  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  26.47 
 
 
330 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0630  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.47 
 
 
339 aa  53.5  0.000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.707185  normal  0.207521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9238  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.77 
 
 
323 aa  53.5  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0005  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  21.75 
 
 
335 aa  53.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0823  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  21.59 
 
 
310 aa  52.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000245068  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0235  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  24.66 
 
 
303 aa  52  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000242773  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2017  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  22.82 
 
 
333 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0990  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.71 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6312  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  27.51 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2428  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  26.48 
 
 
330 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000247729  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6503  hypothetical protein  24.89 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.57028 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2560  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  29.28 
 
 
333 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5647  hypothetical protein  24.89 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.210784  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6012  hypothetical protein  24.89 
 
 
327 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0139074  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2158  hypothetical protein  26.17 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3414  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  22.42 
 
 
322 aa  47.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175733 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2185  hypothetical protein  25.39 
 
 
336 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01750  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.61 
 
 
342 aa  47.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.425442 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0914  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  24.81 
 
 
323 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2003  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.77 
 
 
321 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1082  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  28.18 
 
 
304 aa  45.8  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.912749  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1082  hypothetical protein  28.1 
 
 
350 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1803  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  32.65 
 
 
330 aa  44.3  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.780322  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0811  hypothetical protein  27.92 
 
 
350 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.836821  hitchhiker  0.000111453 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1645  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.27 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1607  hydroxymethylglutaryl-CoA synthase  24.55 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3097  3-Oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III  25.6 
 
 
308 aa  43.5  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0229  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  20.78 
 
 
330 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6140  hypothetical protein  24.14 
 
 
329 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0927717 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1414  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  27.05 
 
 
333 aa  43.1  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.662472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0639  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  32.46 
 
 
342 aa  43.1  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000296079  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1912  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  26.96 
 
 
323 aa  42.7  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2418  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  28.89 
 
 
333 aa  43.1  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1516  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  25.1 
 
 
342 aa  42.7  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.267569  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0877  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] synthase III  28.57 
 
 
334 aa  42.7  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.428521  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1229  putative 3-oxoacyl-ACP synthase III  26.38 
 
 
344 aa  42.7  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.577241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>