49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3850 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3850  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  100 
 
 
319 aa  635    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183549  normal  0.803751 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7054  glycosyl hydrolase family 32 protein  56.78 
 
 
347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7035  glycosyl hydrolase family 32 protein  57.1 
 
 
338 aa  330  3e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1363  glycosyl hydrolase family 32 protein  43.12 
 
 
331 aa  223  3e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0630715  normal  0.119414 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0229  glycosyl hydrolase family 32 protein  34.92 
 
 
330 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22440  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  38.3 
 
 
210 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0551  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  29.28 
 
 
499 aa  63.9  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.129612  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1284  putative sucrose-6-phosphate hydrolase (Sucrase invertase) protein  25.48 
 
 
473 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.278208  normal  0.464398 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3966  glycosyl hydrolase family 32 protein  31.03 
 
 
505 aa  61.2  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.953512  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4094  Beta-fructofuranosidase  26.63 
 
 
740 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.481915  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0224  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  26.02 
 
 
485 aa  59.3  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.851243  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0916  beta-fructofuranosidase  24.35 
 
 
491 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3432  sucrose-6-phosphate hydrolase  27.9 
 
 
454 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.010028 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4206  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.81 
 
 
469 aa  55.8  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7710  hypothetical protein  29.41 
 
 
183 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2305  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.12 
 
 
491 aa  55.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3506  sucrose-6-phosphate hydrolase  30.7 
 
 
481 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0809  beta-fructofuranosidase  23.91 
 
 
491 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3758  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.52 
 
 
470 aa  49.7  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2488  glycoside hydrolase family 68  27.73 
 
 
471 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.266603  normal  0.590215 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0667  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.18 
 
 
491 aa  49.3  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0717  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.18 
 
 
491 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0753  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.18 
 
 
491 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1118  sucrose-6-phosphate hydrolase  26.74 
 
 
491 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1939  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.8 
 
 
705 aa  48.9  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.257645  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0403  glycosyl hydrolase family 32 protein  35.38 
 
 
523 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0404573  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0289  beta-fructofuranosidase  25.35 
 
 
421 aa  47.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2908  beta-fructofuranosidase  25.12 
 
 
467 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242255  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3793  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  32.56 
 
 
511 aa  46.6  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0054  levanase  27.02 
 
 
511 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3297  Beta-fructofuranosidase  30.05 
 
 
480 aa  46.2  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0392  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.55 
 
 
469 aa  46.2  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.147761  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3382  raffinose invertase  26.62 
 
 
476 aa  45.8  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3116  raffinose invertase  26.62 
 
 
476 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0587653 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2103  levansucrase  26.79 
 
 
415 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962759  decreased coverage  0.00209256 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0794  sucrose-6-phosphate hydrolase  24.06 
 
 
464 aa  45.8  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.656645  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2082  sucrose-6-phosphate hydrolase  29.38 
 
 
480 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2022  beta-fructofuranosidase  27.36 
 
 
469 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0425  levanase  27.06 
 
 
497 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51810  sucrose or/and sucrose-6-phosphate hydrolase  26.07 
 
 
492 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3405  Beta-fructofuranosidase  25.38 
 
 
473 aa  43.5  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.83791 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4624  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  25.32 
 
 
477 aa  43.5  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2305  levansucrase  25.89 
 
 
415 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.237725  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1453  levansucrase  25.89 
 
 
431 aa  43.5  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118885  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0032  levansucrase  25.89 
 
 
431 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.49796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0348  sucrose-6-phosphate hydrolase  25.25 
 
 
469 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4874  Glycosyl hydrolase family 32 domain protein  28.74 
 
 
566 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.963389  normal  0.66875 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0885  sucrose-6-phosphate hydrolase  28.49 
 
 
493 aa  42.7  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.229512  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1938  Levansucrase  25.19 
 
 
436 aa  42.4  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>