More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3820 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3820  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  100 
 
 
395 aa  744    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0284197  normal  0.135489 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1609  chromate transporter  69.37 
 
 
398 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.79904  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2341  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  63.64 
 
 
386 aa  348  9e-95  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0066  chromate transporter  36.73 
 
 
382 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2663  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  35.24 
 
 
386 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000000135911  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2855  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  34.52 
 
 
404 aa  164  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0390  chromate transporter  37.43 
 
 
383 aa  162  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.780475  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3378  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.45 
 
 
392 aa  159  6e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3574  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.52 
 
 
390 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.851055 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0555  chromate transporter  31.58 
 
 
401 aa  156  7e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0311274 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4148  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.23 
 
 
472 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.377842 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1321  chromate transporter  31.59 
 
 
379 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5590  chromate transporter  33.81 
 
 
390 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0842  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.26 
 
 
395 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.530668  normal  0.664708 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5954  chromate transporter  33.81 
 
 
390 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0766957 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2447  chromate transporter  30.99 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2826  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.78 
 
 
382 aa  153  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3251  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.39 
 
 
390 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6455  chromate transporter  33.81 
 
 
390 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1382  chromate transporter  34.95 
 
 
376 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.237324  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0728  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.58 
 
 
387 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.318998  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5139  chromate transporter  29.01 
 
 
394 aa  150  3e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.396318  normal  0.758776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2503  chromate transporter  31.73 
 
 
399 aa  150  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.124594 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4579  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.73 
 
 
379 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.294433 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0699  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  32.39 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3048  chromate transporter  31.9 
 
 
393 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2622  chromate transporter  28.95 
 
 
393 aa  147  3e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5053  chromate transporter  31.05 
 
 
392 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.568452  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0073  chromate resistance transport protein  30.03 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3865  chromate transporter  32.76 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6202  chromate transporter  31.73 
 
 
401 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0320947 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3198  chromate transporter  30.48 
 
 
392 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3947  chromate transporter, chromate ion transporter family  30.58 
 
 
389 aa  145  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1563  chromate resistance transport protein  30.84 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0084  chromate ion transporter protein ChrA  30.84 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0067  chromate ion transporter protein ChrA  30.84 
 
 
396 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1239  chromate transporter  26.08 
 
 
442 aa  143  5e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.132611  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1521  chromate transporter  30.9 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.404287  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2155  chromate transporter, permease component  27.22 
 
 
385 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3318  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.36 
 
 
393 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.966219 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1206  chromate transporter  29.85 
 
 
398 aa  139  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405124  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3349  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  24.63 
 
 
441 aa  136  7.000000000000001e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.102603 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3911  chromate transporter  31.15 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00929243  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_11551  chromate transporter  24.69 
 
 
412 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.0167365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1226  chromate transporter  32.77 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5828  chromate transport protein chrA  30 
 
 
463 aa  133  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.42625  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0443  chromate transporter  25 
 
 
412 aa  132  9e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0924  chromate transporter  33.23 
 
 
358 aa  132  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.376436 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1803  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.71 
 
 
400 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4416  chromate transporter  26.69 
 
 
376 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2327  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family protein  27.75 
 
 
420 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.999808 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2996  chromate transporter  25.71 
 
 
376 aa  129  7.000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000942409  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4665  putative chromate transporter  27.53 
 
 
463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154177  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1891  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  28.32 
 
 
469 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.861826 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2674  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  29.16 
 
 
441 aa  125  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1449  chromate transporter  31.01 
 
 
428 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.474038 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4100  chromate transporter  27.32 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.343432 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3191  chromate transporter  26.65 
 
 
483 aa  122  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0092  chromate transporter  28.42 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6162  chromate transporter  28.09 
 
 
466 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3384  chromate transporter  27.23 
 
 
456 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00295991 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1601  chromate transporter  28.18 
 
 
443 aa  119  9.999999999999999e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.646731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3638  chromate transporter  32.43 
 
 
431 aa  118  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46355  normal  0.675394 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2446  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  31.23 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.853251  decreased coverage  0.0000000439073 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5157  chromate transporter  26.4 
 
 
456 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3060  chromate transporter  28.61 
 
 
449 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.904181  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2674  chromate transporter  23.73 
 
 
416 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.249269  normal  0.430846 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2688  chromate transporter  30.46 
 
 
378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3583  chromate transporter  27.79 
 
 
460 aa  113  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.35339  normal  0.0786793 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2332  putative chromate transport protein  30.37 
 
 
417 aa  112  9e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00115086  normal  0.80205 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2203  chromate transporter  29.56 
 
 
397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4108  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  38.32 
 
 
472 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2533  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  33.65 
 
 
348 aa  109  9.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3775  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  26.89 
 
 
352 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.555488 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3023  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  30.77 
 
 
403 aa  107  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.363595 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3651  chromate transporter  26.48 
 
 
469 aa  106  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.947336 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0754  chromate transporter  32.64 
 
 
403 aa  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442695  normal  0.163948 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2566  chromate transporter  32.3 
 
 
403 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0420318  normal  0.101013 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1288  chromate transporter  35.42 
 
 
174 aa  105  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2707  chromate transporter, chromate ion transporter (CHR) family  25.94 
 
 
395 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2590  chromate transporter  30.05 
 
 
425 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.215414  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3482  Chromate transporter  39.23 
 
 
167 aa  103  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000162395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2731  chromate transporter  41.8 
 
 
174 aa  101  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2267  chromate transport protein  31.51 
 
 
401 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0937  chromate transporter  31.51 
 
 
401 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2144  chromate transporter  31.51 
 
 
401 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5873  chromate transporter  32.04 
 
 
403 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.201334  normal  0.305808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2460  chromate transporter  31.96 
 
 
388 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000403685 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1474  chromate transporter  26.44 
 
 
346 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0927755  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4664  chromate transporter  27.73 
 
 
407 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4771  chromate transporter  27.73 
 
 
407 aa  97.1  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1938  chromate transporter  29.77 
 
 
430 aa  97.1  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.275877  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1211  chromate transport protein  38.81 
 
 
187 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1494  chromate transport protein  38.81 
 
 
187 aa  95.5  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2228  chromate transporter  28.89 
 
 
401 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.505793  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5229  chromate transporter  30.95 
 
 
413 aa  94.7  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.744195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5633  chromate ion transporter  28.02 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3017  chromate transporter  27.81 
 
 
408 aa  94  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.986134  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11241  hypothetical protein  31.03 
 
 
394 aa  94  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43910  Chromate transporter  37.96 
 
 
453 aa  93.6  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>