More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3662 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 150 aa  298  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  55.81 
 
 		 92 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  56.96 
 
 		 98 aa  95.9  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  51.65 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6946  transcriptional regulator, MerR family  48.42 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0526  putative transcriptional regulator, MerR family  50.53 
 
 		 115 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2118  MerR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 205 aa  87  8e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0893281  normal  0.0821233 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  57.58 
 
 		 138 aa  86.7  1e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12190  predicted transcriptional regulator  54.12 
 
 		 146 aa  83.6  0.000000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.745153  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 97 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00680  predicted transcriptional regulator  57.14 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 164 aa  81.3  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  47.31 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0097  transcriptional regulator, MerR family  53.52 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.377226 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0115  MerR family transcriptional regulator  56.34 
 
 		 146 aa  79  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05520  predicted transcriptional regulator  42.2 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0489  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0583228  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0244  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.448953 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3069  transcriptional regulator, MerR family  51.32 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0235  transcriptional regulator, MerR family  51.14 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4360  regulatory protein, MerR  46.15 
 
 		 144 aa  79  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0721888  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0637  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122325  normal  0.18825 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0465  MerR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0476  MerR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.952964 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1310  glutamine synthetase repressor  50 
 
 		 195 aa  78.2  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0787163  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  55.07 
 
 		 97 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0452  MerR family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 129 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4267  regulatory protein MerR  48.84 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10358  heat shock protein transcriptional repressor HspR  41.41 
 
 		 126 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0164673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0199  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000263681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0116  MerR family transcriptional regulator  54.93 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.608961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4355  MerR family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 201 aa  76.6  0.00000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0443  transcriptional regulator, MerR family  47.78 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0257  MerR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 120 aa  76.6  0.00000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0114749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01190  predicted transcriptional regulator  52.86 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0230  MerR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.279469 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5215  transcriptional regulator, MerR family  39.17 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0084  transcriptional regulator, MerR family  52 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4230  putative transcriptional regulator, MerR family  41.41 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0585976  normal  0.95064 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04450  predicted transcriptional regulator  49.38 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.139659 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5468  transcriptional regulator, MerR family  42.57 
 
 		 161 aa  73.2  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3618  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1412  HspR protein, putative  39.78 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.18212  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0382  transcriptional regulator, MerR family  43.24 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0503  MerR family transcriptional regulator  64.15 
 
 		 60 aa  70.1  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.564864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0787  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 136 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.877996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1193  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0554847  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1219  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.100212  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3805  MerR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 140 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18780  predicted transcriptional regulator  43.75 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4804  transcriptional regulator, MerR family  41.75 
 
 		 152 aa  64.7  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0914  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.976142  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1215  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1450  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.225656 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0204  transcriptional regulator, MerR family  34.19 
 
 		 152 aa  61.6  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00403323  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  42.86 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0352  transcriptional regulator, MerR family  54.17 
 
 		 180 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.638949 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2269  MerR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.220473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0024  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0360  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000341554  normal  0.726839 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3706  transcriptional regulator, MerR family  43.37 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.489837 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1244  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 124 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000592234  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1862  putative heat shock protein HspR  43.06 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000982592  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0975  putative heat shock protein HspR  41.67 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.933748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  43.66 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0766  putative heat shock protein HspR  43.66 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000861222  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1279  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 273 aa  58.2  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 292 aa  58.5  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  30.56 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  40.3 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 140 aa  57.8  0.00000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1381  regulatory protein MerR  37.11 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.361827  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 276 aa  57.4  0.00000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2382  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.492315  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3470  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.003509  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 245 aa  57  0.00000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0875  glutamine synthetase repressor  35.53 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3804  transcriptional repressor GlnR  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3755  transcriptional repressor GlnR  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0446973  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1501  transcriptional repressor GlnR  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0247107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3714  transcriptional repressor GlnR  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57009e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  33.78 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0555  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  32.06 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  37.35 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>