116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3639 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3639  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  654    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0611686  normal  0.0223593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3648  nitroreductase  76.47 
 
 		 331 aa  450  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000896643  normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1906  nitroreductase  49.69 
 
 		 349 aa  276  4e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2549  hypothetical protein  50.94 
 
 		 318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  41.53 
 
 		 361 aa  189  5e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1527  hypothetical protein  42.76 
 
 		 324 aa  172  5.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113134  hitchhiker  0.00019128 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5600  nitroreductase  39.18 
 
 		 343 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  39.67 
 
 		 320 aa  165  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2315  hypothetical protein  38.96 
 
 		 343 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6194  hypothetical protein  39.62 
 
 		 335 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.325627  normal  0.125602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1576  hypothetical protein  42.76 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.723932 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3087  hypothetical protein  37.61 
 
 		 343 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1426  hypothetical protein  37.61 
 
 		 343 aa  159  7e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0286  nitroreductase  40 
 
 		 336 aa  159  8e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3213  hypothetical protein  37.61 
 
 		 343 aa  158  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1054  hypothetical protein  37.31 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.624063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1340  hypothetical protein  37.31 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2320  hypothetical protein  37.31 
 
 		 343 aa  157  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.151899  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5906  hypothetical protein  38.92 
 
 		 335 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.382454  normal  0.158726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  36.81 
 
 		 380 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2723  hypothetical protein  41.1 
 
 		 315 aa  149  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0949  hypothetical protein  37.69 
 
 		 346 aa  143  4e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.102443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1139  hypothetical protein  35.82 
 
 		 343 aa  143  5e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0762  hypothetical protein  40.32 
 
 		 343 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3528  hypothetical protein  36.96 
 
 		 330 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  36.22 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5585  hypothetical protein  36.07 
 
 		 343 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.582272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4061  hypothetical protein  32.4 
 
 		 367 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.187686 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  37.7 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1864  hypothetical protein  36.34 
 
 		 343 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3099  hypothetical protein  35.51 
 
 		 335 aa  132  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.058306  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0831  hypothetical protein  36.09 
 
 		 376 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.108974  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0827  hypothetical protein  36.09 
 
 		 377 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2414  nitroreductase  34.65 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000136256  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0779  hypothetical protein  37.42 
 
 		 375 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00353423  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1917  nitroreductase  38.25 
 
 		 328 aa  128  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1107  hypothetical protein  35.02 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1124  hypothetical protein  35.02 
 
 		 330 aa  124  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1972  hypothetical protein  34.51 
 
 		 349 aa  122  7e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.551311 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1530  hypothetical protein  34.12 
 
 		 380 aa  122  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248753 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1136  hypothetical protein  34.7 
 
 		 330 aa  122  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.772806  normal  0.853595 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1579  hypothetical protein  34.69 
 
 		 382 aa  120  3.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1078  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424079  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1094  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0508938  normal  0.0740318 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1105  hypothetical protein  34.11 
 
 		 330 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3848  hypothetical protein  32.52 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.572013  decreased coverage  0.00997799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13152  hypothetical protein  32.51 
 
 		 332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0727  hypothetical protein  32.51 
 
 		 344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.946422  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2547  hypothetical protein  30.79 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3747  hypothetical protein  34.29 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.333712 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3661  hypothetical protein  32.05 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0777265  normal  0.505633 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1474  hypothetical protein  27.49 
 
 		 377 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19000  nitroreductase family protein  33.44 
 
 		 336 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0843848 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0990  hypothetical protein  33.13 
 
 		 342 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0316  hypothetical protein  27.65 
 
 		 318 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2245  hypothetical protein  26.92 
 
 		 377 aa  100  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4304  hypothetical protein  30.46 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1003  hypothetical protein  26.6 
 
 		 330 aa  97.1  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4124  hypothetical protein  32.27 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4199  hypothetical protein  32.27 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0708158  normal  0.45001 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4355  hypothetical protein  32.27 
 
 		 318 aa  92  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.734887  normal  0.127472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1383  hypothetical protein  31.56 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684132  normal  0.626977 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13147  hypothetical protein  31.49 
 
 		 344 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.825621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2550  hypothetical protein  31.25 
 
 		 331 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.286311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22840  nitroreductase family protein  30.06 
 
 		 326 aa  90.1  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.747416 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1217  hypothetical protein  27.81 
 
 		 339 aa  88.6  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3410  hypothetical protein  30.65 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.386692  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3473  hypothetical protein  30.65 
 
 		 335 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0159149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3421  hypothetical protein  31.46 
 
 		 335 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.156919 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4994  hypothetical protein  31.76 
 
 		 327 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1487  hypothetical protein  29.97 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12069  hypothetical protein  28.12 
 
 		 331 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.919596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4128  hypothetical protein  31.48 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.58877  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4203  hypothetical protein  31.48 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.226468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4359  hypothetical protein  31.48 
 
 		 325 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2729  hypothetical protein  28.38 
 
 		 369 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.918385  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2412  hypothetical protein  29.28 
 
 		 238 aa  77.8  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623918  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2157  hypothetical protein  26.99 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.296122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0168  hypothetical protein  28.52 
 
 		 273 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.939861 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3845  hypothetical protein  28.44 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0731664  normal  0.0221038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  34.17 
 
 		 1006 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2579  hypothetical protein  29.08 
 
 		 279 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2624  hypothetical protein  29.08 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.130193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3174  hypothetical protein  31.53 
 
 		 359 aa  74.3  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3327  hypothetical protein  22.6 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000687269  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0884  hypothetical protein  30.79 
 
 		 402 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1075  hypothetical protein  30 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.617578  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1091  hypothetical protein  30 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.202469  normal  0.113609 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1102  hypothetical protein  30 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0127461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0489  hypothetical protein  26.78 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143021 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  27.02 
 
 		 351 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  23.66 
 
 		 771 aa  61.6  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  29.02 
 
 		 679 aa  61.6  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  25.61 
 
 		 770 aa  60.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2392  hypothetical protein  24.4 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5075  hypothetical protein  27.98 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3197  hypothetical protein  25.16 
 
 		 390 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.640272  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  30.81 
 
 		 968 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  32.24 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  33.12 
 
 		 989 aa  55.8  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>