238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3635 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3635  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 277 aa  553  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00150416  normal  0.0211816 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4358  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.3 
 
 		 112 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.437014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1661  hypothetical protein  65.45 
 
 		 110 aa  145  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3643  MarR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 169 aa  141  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4174  hypothetical protein  63.89 
 
 		 110 aa  135  9e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.257816  normal  0.271179 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21730  hypothetical protein, contains double-stranded beta-helix domain protein  63.3 
 
 		 109 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.769467 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4488  hypothetical protein  64.15 
 
 		 114 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4575  hypothetical protein  64.15 
 
 		 114 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.131851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4871  hypothetical protein  64.15 
 
 		 114 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.468339  normal  0.0822888 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3536  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70 
 
 		 114 aa  132  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.541629  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5574  MarR family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 151 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.23947  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4118  MarR family transcriptional regulator  52.76 
 
 		 137 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3929  MarR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 137 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000979996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3826  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 158 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4542  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 158 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  0.070316 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5762  MarR family transcriptional regulator  51.97 
 
 		 137 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3966  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 152 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0529361  normal  0.146935 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4428  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 137 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.400041  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3238  cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  60.91 
 
 		 110 aa  128  8.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2430  putative transcription regulator protein  49.64 
 
 		 139 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4485  MarR family transcriptional regulator  50.39 
 
 		 160 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.187713  normal  0.500577 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0160  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 141 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0438  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 141 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1139  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 141 aa  126  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1198  hypothetical protein  51.59 
 
 		 137 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240784  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0838  transcriptional regulator, MarR family  49.61 
 
 		 137 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1303  MarR family transcriptional regulator  51.18 
 
 		 137 aa  125  6e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0006  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 137 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862573  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1396  hypothetical protein  51.59 
 
 		 160 aa  125  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1487  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 151 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1402  MarR family transcriptional regulator  51.59 
 
 		 137 aa  125  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420686  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2089  hypothetical protein  55.66 
 
 		 130 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154794  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1022  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.55 
 
 		 111 aa  120  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2872  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 156 aa  120  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.924604  normal  0.788134 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0496  hypothetical protein  55.56 
 
 		 111 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.41249 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6376  transcriptional regulator, MarR family  45.11 
 
 		 138 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.981115  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2629  transcriptional regulator, MarR family  51.26 
 
 		 135 aa  118  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4856  cupin 2 domain-containing protein  55.14 
 
 		 110 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2051  hypothetical protein  52.83 
 
 		 110 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.889386  normal  0.46009 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6375  transcriptional regulator, MarR family  49.17 
 
 		 141 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3214  cupin 2 domain-containing protein  55.05 
 
 		 112 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1083  transcriptional regulator, MarR family  49.57 
 
 		 149 aa  113  3e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2308  transcriptional regulator, MarR family  44.6 
 
 		 145 aa  112  6e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.511627  hitchhiker  0.000000675191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2698  transcriptional regulator, MarR family  49.14 
 
 		 145 aa  112  9e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12638  hypothetical protein  52.78 
 
 		 117 aa  110  3e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0484137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0020  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.55 
 
 		 132 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2951  MarR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 162 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0927  cupin 2 domain-containing protein  64.2 
 
 		 113 aa  109  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.474041  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4297  hypothetical protein  55.88 
 
 		 110 aa  108  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5023  MarR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 139 aa  107  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0800254  normal  0.152298 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4133  MarR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 144 aa  106  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6567  MarR family transcriptional regulator  50 
 
 		 141 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0314  MarR family transcriptional regulator  45.38 
 
 		 153 aa  100  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2668  MarR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 139 aa  99  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2084  MarR family transcriptional regulator  45.97 
 
 		 155 aa  99  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0275  hypothetical protein  50 
 
 		 122 aa  96.7  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0235  hypothetical protein  48.08 
 
 		 127 aa  95.9  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3698  hypothetical protein  50.93 
 
 		 111 aa  95.1  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.12348  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3156  MarR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 141 aa  89.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.646258 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5413  transcriptional regulator, MarR family  40.98 
 
 		 146 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.173086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5962  transcriptional regulator, MarR family  45.79 
 
 		 155 aa  85.9  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5348  MarR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 142 aa  82.4  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2093  transcriptional regulator, MarR family  38.71 
 
 		 148 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6391  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.666517 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4535  transcriptional regulator, MarR family  38.33 
 
 		 145 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0652033 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3938  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 145 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.556639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5811  MarR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 155 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00283873 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0771  MarR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 138 aa  71.6  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.15812  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1759  hypothetical protein  45.54 
 
 		 113 aa  64.7  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.048485  hitchhiker  0.00577747 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0720  MarR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2756  hypothetical protein  41.67 
 
 		 110 aa  59.3  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.914306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5315  transcriptional regulator, MarR family  33.91 
 
 		 149 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.342614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3362  hypothetical protein  43.96 
 
 		 111 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.0980345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2641  hypothetical protein  41.18 
 
 		 107 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1200  cupin 2, barrel  50.67 
 
 		 115 aa  57  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 		 152 aa  57  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0285  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.742627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  39.74 
 
 		 167 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7901  transcriptional regulator, MarR family  40.74 
 
 		 161 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3100  transcriptional regulator, MarR family  35.37 
 
 		 170 aa  52.4  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000355326  hitchhiker  0.00000930656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3143  MarR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 161 aa  52.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1634  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0355019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28520  transcriptional regulator  36 
 
 		 166 aa  50.4  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.11244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0061  MarR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 171 aa  50.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.310818 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1387  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 		 142 aa  50.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 156 aa  50.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2289  transcriptional regulator, MarR family  29.86 
 
 		 155 aa  49.7  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000191049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  33.12 
 
 		 201 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  27.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  36.75 
 
 		 190 aa  49.3  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 138 aa  49.3  0.00008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 148 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 148 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0279  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 165 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159434  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 154 aa  48.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1489  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>