More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3615 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3615  integrase family protein  100 
 
 		 638 aa  1293    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00140934  normal  0.0339314 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1114  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 637 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  30.37 
 
 		 647 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  30.37 
 
 		 647 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  30.37 
 
 		 647 aa  179  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 637 aa  167  4e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4727  integrase family protein  32.77 
 
 		 608 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2584  integrase family protein  32.77 
 
 		 608 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2671  integrase family protein  32.77 
 
 		 608 aa  145  2e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2521  integrase family protein  32.84 
 
 		 617 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000524212  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1238  integrase family protein  32.84 
 
 		 617 aa  136  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.375916 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  25.2 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  25.2 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  25.2 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  25.2 
 
 		 630 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4539  transposase B  25.27 
 
 		 637 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  29.01 
 
 		 663 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3148  Tn554-related, transposase B  23.35 
 
 		 701 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0001  Tn554-related, transposase B  23.35 
 
 		 684 aa  92  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.289716  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4149  integrase family protein  24.65 
 
 		 498 aa  92  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.353708 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06600  site-specific recombinase, integrase family  28.28 
 
 		 491 aa  87  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0101148  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.44 
 
 		 300 aa  84.3  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20690  site-specific recombinase, integrase family  28.77 
 
 		 426 aa  83.2  0.00000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1705  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 737 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5578  phage integrase  27.54 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5981  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.259227 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.86 
 
 		 301 aa  79.7  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  27.9 
 
 		 310 aa  78.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  24.37 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  32.13 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  24.37 
 
 		 295 aa  77.4  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  27.13 
 
 		 308 aa  77  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.55 
 
 		 295 aa  75.9  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0987  Tn554-related, transposase B  23.79 
 
 		 708 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.376449  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  29.03 
 
 		 304 aa  75.9  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  30.48 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 306 aa  74.3  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  26.72 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  26.42 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  22.69 
 
 		 675 aa  73.9  0.000000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  30.91 
 
 		 343 aa  73.9  0.000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  24.54 
 
 		 274 aa  73.6  0.00000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  29.52 
 
 		 302 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  25.55 
 
 		 307 aa  73.6  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  27.34 
 
 		 299 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  26.36 
 
 		 323 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  25.23 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  25.71 
 
 		 302 aa  73.2  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  27.91 
 
 		 298 aa  72.8  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  29.05 
 
 		 302 aa  72  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  27.33 
 
 		 311 aa  72  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  30.74 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  26.95 
 
 		 316 aa  72  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  27.08 
 
 		 298 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  25.33 
 
 		 307 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  29.05 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  23.75 
 
 		 270 aa  71.2  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  28.29 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1915  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.42 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.279776  hitchhiker  0.00138491 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  27.07 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.45 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.94 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  29.89 
 
 		 310 aa  70.5  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  30.24 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  25.33 
 
 		 307 aa  70.1  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  32.79 
 
 		 290 aa  70.5  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  27.99 
 
 		 301 aa  69.7  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.66 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  22.76 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.2 
 
 		 302 aa  69.7  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  26.65 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  22.07 
 
 		 282 aa  68.9  0.0000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 315 aa  68.6  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  30.77 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  26.36 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.52 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  26.29 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  27.17 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  26.36 
 
 		 295 aa  67  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  67  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 296 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  26.56 
 
 		 311 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  25.7 
 
 		 306 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 		 295 aa  67  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  25.24 
 
 		 301 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  27.42 
 
 		 302 aa  67  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  27.13 
 
 		 304 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.34 
 
 		 296 aa  67  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 		 313 aa  66.6  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  24.69 
 
 		 305 aa  65.9  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>