More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3603 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1215  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0266422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3585  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0961554  normal  0.0104097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3044  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00169579  hitchhiker  0.00511814 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3469  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00208728  normal  0.0117425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3603  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185249  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3698  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0843425  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3740  integrase family protein  100 
 
 		 393 aa  790    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3904  phage integrase family protein  71.25 
 
 		 393 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3896  phage integrase family protein  71.25 
 
 		 393 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0478  phage integrase family protein  71.25 
 
 		 393 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5935  phage integrase family protein  71.25 
 
 		 393 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5398  phage integrase family protein  41.97 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.525123 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0512  phage integrase family protein  41.97 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5418  phage integrase family protein  41.97 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.135045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1426  phage integrase family protein  41.07 
 
 		 401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  34.54 
 
 		 395 aa  152  7e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  34.39 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  34.39 
 
 		 364 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4540  transposase A  29.81 
 
 		 361 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  34.64 
 
 		 344 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4150  integrase family protein  27.85 
 
 		 373 aa  135  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.333103 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3734  phage integrase-like SAM-like  35.14 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  35.38 
 
 		 312 aa  131  2.0000000000000002e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  34.66 
 
 		 367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0043  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1717  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1224  Tn554, transposase A  26.09 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0995985  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1347  Tn554, transposase A  26.09 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.444384  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2506  transposase A  26.09 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1751  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.252007  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0043  phage integrase family protein  26.09 
 
 		 361 aa  123  7e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  27.05 
 
 		 372 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0986  Tn554-related, transposase A  25 
 
 		 384 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.061254  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1466  Tn554-related, transposase A  24.34 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000354684  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3970  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1934  phage integrase  26.6 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3803  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 388 aa  95.9  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704516  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  26.47 
 
 		 519 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.34 
 
 		 295 aa  70.1  0.00000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0067  integrase family protein  23.48 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.952097  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.53 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  27.36 
 
 		 295 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  24.7 
 
 		 308 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  30.77 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  29.12 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  22.19 
 
 		 299 aa  60.5  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  25.4 
 
 		 385 aa  60.1  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4020  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  23.8 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  28.92 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.88 
 
 		 311 aa  59.3  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.08 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0415  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.12 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.611975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0427  prophage lambdaba04, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.12 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  26.29 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  29.52 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3928  integrase family protein  21.99 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.48 
 
 		 398 aa  58.2  0.0000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.16 
 
 		 302 aa  57  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  24.21 
 
 		 313 aa  57  0.0000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0517  integrase family protein  22.44 
 
 		 335 aa  56.2  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  22.63 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  30.37 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  25.21 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4062  tyrosine recombinase XerD  26.86 
 
 		 353 aa  55.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.159612  normal  0.47475 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1691  phage integrase family protein  31.43 
 
 		 402 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  24.28 
 
 		 299 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  26.87 
 
 		 391 aa  55.1  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  21.51 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  22.73 
 
 		 310 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.63 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  25.44 
 
 		 290 aa  54.7  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  27.11 
 
 		 313 aa  54.3  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.19 
 
 		 321 aa  54.3  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.71 
 
 		 313 aa  53.9  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0582  integrase family protein  22.99 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.132855 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  29.26 
 
 		 403 aa  53.9  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  22.74 
 
 		 313 aa  53.5  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2053  phage integrase-like SAM-like  31.39 
 
 		 141 aa  53.5  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.227287  normal  0.287411 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.2 
 
 		 311 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.27 
 
 		 324 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  23.39 
 
 		 293 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  22.12 
 
 		 298 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  28.16 
 
 		 435 aa  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.76 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  21.02 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2421  integrase family protein  25.53 
 
 		 323 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0129159 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  24.7 
 
 		 329 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  27.06 
 
 		 307 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  23.39 
 
 		 293 aa  52  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  24.6 
 
 		 310 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.79 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  23.15 
 
 		 299 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  23.01 
 
 		 296 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  23.88 
 
 		 302 aa  52  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0217  phage integrase family site specific recombinase  24.6 
 
 		 384 aa  51.2  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.35128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>