More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3583 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3583  thioredoxin  100 
 
 		 149 aa  302  8.000000000000001e-82  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.029416  normal  0.0374075 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6432  thioredoxin  57.78 
 
 		 160 aa  177  4e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.432921 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4438  thioredoxin  54.93 
 
 		 150 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.102034  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5905  thioredoxin  54.68 
 
 		 144 aa  165  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00610  thioredoxin  55.63 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0500  thioredoxin  52.9 
 
 		 144 aa  158  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.874633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  50.37 
 
 		 150 aa  155  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1430  thioredoxin  57.04 
 
 		 140 aa  147  3e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000656365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4027  thioredoxin  49.29 
 
 		 148 aa  146  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0913338  normal  0.121576 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1420  thioredoxin  54.07 
 
 		 157 aa  145  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.669095  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0456  thioredoxin  47.59 
 
 		 165 aa  137  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2518  thioredoxin  46.04 
 
 		 141 aa  127  5.0000000000000004e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4107  thioredoxin  44.06 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000794835 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0888  thioredoxin  44.03 
 
 		 141 aa  120  5e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2645  thioredoxin  43.66 
 
 		 150 aa  120  5e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.154957  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3416  thioredoxin  40.69 
 
 		 146 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  55 
 
 		 107 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3491  thioredoxin 2  39.57 
 
 		 139 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0621  thioredoxin  49.04 
 
 		 108 aa  118  3e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000184635  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3335  thioredoxin 2  41.01 
 
 		 139 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1161  thioredoxin  40.43 
 
 		 146 aa  117  6e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.403386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1524  thioredoxin  35.71 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659124 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  44.12 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1452  thioredoxin  54.74 
 
 		 272 aa  116  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  52 
 
 		 107 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2304  thioredoxin  40.29 
 
 		 145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.258464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2347  thioredoxin  39.57 
 
 		 147 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0135047  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  51.85 
 
 		 281 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  51.85 
 
 		 281 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  36.36 
 
 		 146 aa  114  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  114  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3067  thioredoxin 2  40.71 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00110629 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  48.08 
 
 		 107 aa  114  5e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0854  thioredoxin 2  39.01 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2861  thioredoxin 2  41.91 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.350907  normal  0.503198 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2843  thioredoxin 2  41.91 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  114  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2865  thioredoxin 2  41.91 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0216262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2759  thioredoxin 2  41.91 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00143779  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2977  thioredoxin 2  41.91 
 
 		 139 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0978039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5839  thioredoxin  50.96 
 
 		 109 aa  113  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0443  thioredoxin-like  39.42 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.478708  normal  0.838572 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  51 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11511  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0556  thioredoxin  40.15 
 
 		 144 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127919 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11671  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3336  thioredoxin  52 
 
 		 259 aa  112  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4285  thioredoxin  50 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.395722  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1072  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0618  thioredoxin  39.72 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11661  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.113798  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02476  thioredoxin 2  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.953967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1086  thioredoxin  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0403998  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1995  thioredoxin  37.86 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0377  thioredoxin  39.57 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655114  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2739  thioredoxin 2  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.025352  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2869  thioredoxin 2  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.162737  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1095  thioredoxin 2  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0753217  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3819  thioredoxin 2  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00147303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3369  thioredoxin  39.44 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2954  thioredoxin 2  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0189312  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2362  thioredoxin  37.86 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2735  thioredoxin 2  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0139217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3746  thioredoxin 2  43.61 
 
 		 139 aa  111  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0426418  normal  0.35545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02440  hypothetical protein  40.29 
 
 		 139 aa  112  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.934703  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3463  thioredoxin 2  38.73 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.305081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3204  thioredoxin 2  38.73 
 
 		 145 aa  110  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3341  thioredoxin 2  38.73 
 
 		 145 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.142551  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  44.35 
 
 		 123 aa  111  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  49 
 
 		 107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  47.71 
 
 		 285 aa  111  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0156  thioredoxin  46 
 
 		 106 aa  110  5e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.534304 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2977  thioredoxin  39.57 
 
 		 146 aa  110  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000101834  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0180  thioredoxin  48.6 
 
 		 115 aa  110  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3241  thioredoxin  50 
 
 		 107 aa  110  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1945  thioredoxin  48 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45140  thioredoxin 2, TxrC  40.44 
 
 		 144 aa  110  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1625  thioredoxin  46.53 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  46.53 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0473  thioredoxin  46.53 
 
 		 107 aa  110  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.319728  normal  0.0128632 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2950  thioredoxin  49.51 
 
 		 106 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.184197  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2259  thioredoxin  39.72 
 
 		 148 aa  110  9e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2134  thioredoxin  43.38 
 
 		 139 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  50.93 
 
 		 280 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0691  thioredoxin  47 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0179  thioredoxin  48.54 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.292519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15251  thioredoxin  47 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1529  thioredoxin  48.54 
 
 		 106 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.643867  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0720  thioredoxin  48 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3378  thioredoxin  45.1 
 
 		 107 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  0.553993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3312  thioredoxin  47.06 
 
 		 109 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124332  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  49.53 
 
 		 302 aa  108  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0028  thioredoxin  48.48 
 
 		 106 aa  109  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3369  thioredoxin  50.49 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0365156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3958  thioredoxin  47.92 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0093  thioredoxin  45.63 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00548015 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2176  thioredoxin  45.63 
 
 		 106 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.275071 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2793  thioredoxin  48 
 
 		 107 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.526009  normal  0.619101 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3723  thioredoxin  39.72 
 
 		 146 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.122043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>