173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3561 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3561  protein of unknown function DUF162  100 
 
 
212 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438326  normal  0.0115324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1032  protein of unknown function DUF162  85.31 
 
 
212 aa  340  1e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.453635  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5228  protein of unknown function DUF162  84.83 
 
 
212 aa  338  4e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3732  protein of unknown function DUF162  82.94 
 
 
212 aa  335  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0605222  normal  0.392276 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05110  hypothetical protein  47.51 
 
 
220 aa  174  6e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3102  protein of unknown function DUF162  49.76 
 
 
217 aa  170  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2595  protein of unknown function DUF162  49.54 
 
 
213 aa  168  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.252822  normal  0.0430329 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4817  protein of unknown function DUF162  48.23 
 
 
218 aa  165  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1999  protein of unknown function DUF162  50.7 
 
 
218 aa  160  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000429287  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2423  protein of unknown function DUF162  46.23 
 
 
213 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000270697  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37060  hypothetical protein  47.2 
 
 
203 aa  158  5e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.348377  normal  0.0200163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2900  protein of unknown function DUF162  47.25 
 
 
209 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.225002  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3702  hypothetical protein  47.95 
 
 
204 aa  157  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.984711  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1753  protein of unknown function DUF162  48.17 
 
 
207 aa  156  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.729924  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19820  hypothetical protein  44.34 
 
 
233 aa  152  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3245  hypothetical protein  51.43 
 
 
207 aa  148  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7368  hypothetical protein  71.57 
 
 
316 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277323  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1464  protein of unknown function DUF162  46.08 
 
 
214 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00626202  normal  0.905183 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2711  hypothetical protein  47.95 
 
 
206 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592555  normal  0.0542493 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04090  hypothetical protein  46.82 
 
 
219 aa  142  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0335432 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4387  hypothetical protein  67.96 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4474  hypothetical protein  67.96 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4768  hypothetical protein  67.96 
 
 
203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0889  protein of unknown function DUF162  48.2 
 
 
222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2450  hypothetical protein  42.65 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.553293  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3036  protein of unknown function DUF162  44.13 
 
 
203 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0336828  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12930  hypothetical protein  44.2 
 
 
251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.109611  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0069  hypothetical protein  25.23 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0110  hypothetical protein  28.49 
 
 
218 aa  67.4  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0084  hypothetical protein  27.91 
 
 
218 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5898  hypothetical protein  31.3 
 
 
236 aa  65.1  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.81355 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2804  hypothetical protein  38.83 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2671  hypothetical protein  38.83 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1844  hypothetical protein  30.74 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00498433  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6082  hypothetical protein  39.81 
 
 
244 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.369517 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0395  protein of unknown function DUF162  39.81 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.294344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2721  protein of unknown function DUF162  30.34 
 
 
231 aa  62.8  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2565  hypothetical protein  29.11 
 
 
233 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.4396  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1855  hypothetical protein  30.8 
 
 
234 aa  62.4  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180432  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0081  hypothetical protein  36.63 
 
 
142 aa  61.6  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  unclonable  0.0000107134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3166  protein of unknown function DUF162  35.71 
 
 
224 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2993  hypothetical protein  37.37 
 
 
221 aa  60.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.947199  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0886  hypothetical protein  25 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0465  protein of unknown function DUF162  30.91 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.988971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5377  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3261  hypothetical protein  32.35 
 
 
230 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3035  hypothetical protein  32.35 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2956  hypothetical protein  32.35 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5447  hypothetical protein  37.5 
 
 
235 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907418  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3268  hypothetical protein  32.35 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0369  hypothetical protein  26.5 
 
 
225 aa  58.9  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1395  hypothetical protein  31.05 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856856  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0697  protein of unknown function DUF162  35.29 
 
 
203 aa  58.9  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1767  hypothetical protein  35.64 
 
 
226 aa  58.2  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.403313  normal  0.0258937 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1621  hypothetical protein  42.86 
 
 
212 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1377  hypothetical protein  30.04 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05550  hypothetical protein  35.34 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1026  hypothetical protein  24.05 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1765  hypothetical protein  35.45 
 
 
222 aa  55.8  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4690  protein of unknown function DUF162  35.85 
 
 
174 aa  56.2  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0525  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0432  hypothetical protein  34.86 
 
 
342 aa  55.8  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.110787  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2280  hypothetical protein  33.67 
 
 
219 aa  55.8  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0200  hypothetical protein  30.7 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1232  protein of unknown function DUF162  30.13 
 
 
235 aa  55.5  0.0000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.2038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3261  protein of unknown function DUF162  36.27 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1419  hypothetical protein  24.66 
 
 
216 aa  55.5  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1218  protein of unknown function DUF162  31.91 
 
 
237 aa  55.1  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4687  hypothetical protein  24.57 
 
 
228 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0366  hypothetical protein  26.09 
 
 
223 aa  54.3  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.101177  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3922  hypothetical protein  35.4 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1173  YkgG family protein  29.91 
 
 
204 aa  53.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0558  hypothetical protein  26.67 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.432927  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2431  protein of unknown function DUF162  29.69 
 
 
220 aa  53.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0428557 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1747  protein of unknown function DUF162  34.34 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00264  predicted transporter  23.5 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3297  protein of unknown function DUF162  23.5 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0614  hypothetical protein  23.64 
 
 
215 aa  53.1  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5746  protein of unknown function DUF162  25.66 
 
 
195 aa  52.8  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.021165 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00268  hypothetical protein  23.5 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2770  protein of unknown function DUF162  34.34 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3314  hypothetical protein  23.5 
 
 
231 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2679  protein of unknown function DUF162  33.33 
 
 
231 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2977  hypothetical protein  32.71 
 
 
196 aa  52.8  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.123013  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0029  protein of unknown function DUF162  28.57 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  0.18947 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3880  protein of unknown function DUF162  36.13 
 
 
189 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.136905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0341  hypothetical protein  35.58 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.349947  normal  0.615412 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3175  protein of unknown function DUF162  32.71 
 
 
196 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.775002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4210  hypothetical protein  27.03 
 
 
195 aa  52.4  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.364052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3067  protein of unknown function DUF162  32.71 
 
 
196 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0673  hypothetical protein  32.69 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0711  hypothetical protein  28.38 
 
 
205 aa  51.6  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1435  hypothetical protein  35.58 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1032  putative transmembrane protein  29.87 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.635857  normal  0.76334 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2283  hypothetical protein  34.45 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00564388  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3603  hypothetical protein  41.3 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.355663  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2448  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.608615  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3587  protein of unknown function DUF162  27.07 
 
 
219 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3006  hypothetical protein  26.32 
 
 
189 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2998  hypothetical protein  33.63 
 
 
189 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1452  conserved hypothetical protein (DUF162 domain protein)  22.79 
 
 
216 aa  49.3  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000739876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>