32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3467 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3742  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.165817  normal  0.166782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3700  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0438611  normal  0.0757476 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3605  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00438159  normal  0.043147 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3587  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00101859  hitchhiker  0.00420892 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3467  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000714931  normal  0.021988 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3042  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000211872  hitchhiker  0.00361328 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1217  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  301  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.471873  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0480  Tn554-related, transposase C  60.93 
 
 
147 aa  169  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170868  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3898  Tn554-related, transposase C  60.93 
 
 
147 aa  169  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.768404 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3902  Tn554-related, transposase C  60.93 
 
 
147 aa  169  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5933  Tn554-related, transposase C  60.93 
 
 
147 aa  169  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0694  Tn554-related, transposase C  59.6 
 
 
147 aa  168  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0041  hypothetical protein  25.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1345  Tn554, transposase C  25.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.48527  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1715  hypothetical protein  25.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0041  transposase C  25.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1749  transposase C  25.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0515142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2508  transposase C  25.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1222  Tn554, transposase C  25.2 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.406172  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5400  Tn554 transposase C  32.26 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.322304 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5420  Tn554 transposase C  32.26 
 
 
144 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.329815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4148  hypothetical protein  34 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.798173  normal  0.299443 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1706  Tn554 transposase C  38.38 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.428183  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4538  transposase C  32.95 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5982  Tn554 transposase C  38.38 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.100024 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5579  Tn554 transposase C  38.38 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.142757  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0002  Tn554-related, transposase C  25.83 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00851987  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3149  Tn554-related, transposase C  25.83 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0988  Tn554-related, transposase C  34.92 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.167776  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06610  hypothetical protein  30.83 
 
 
129 aa  44.7  0.0005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0352144  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20680  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1115  hypothetical protein  32.58 
 
 
99 aa  42.4  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.278395  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>