More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3436 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
536 aa  1072    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  49.16 
 
 
556 aa  487  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  47.92 
 
 
543 aa  455  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  45.64 
 
 
545 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  49.51 
 
 
552 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  50 
 
 
551 aa  436  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  46.9 
 
 
550 aa  433  1e-120  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  37.29 
 
 
547 aa  326  8.000000000000001e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  35.18 
 
 
576 aa  266  5.999999999999999e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.63 
 
 
532 aa  257  4e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32 
 
 
525 aa  251  2e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  35.54 
 
 
574 aa  248  2e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0408  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, FAD-dependent  33.64 
 
 
545 aa  247  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.51 
 
 
582 aa  247  4e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2088  FAD dependent oxidoreductase  31.79 
 
 
554 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0044542  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0254  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 
546 aa  243  5e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.626232  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  36.6 
 
 
582 aa  242  1e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  33.52 
 
 
562 aa  241  2e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  36.82 
 
 
578 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  34.73 
 
 
579 aa  240  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4885  FAD dependent oxidoreductase  31.74 
 
 
525 aa  239  1e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.53 
 
 
585 aa  237  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 
573 aa  237  4e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6411  FAD dependent oxidoreductase  34.81 
 
 
579 aa  237  5.0000000000000005e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  32.09 
 
 
582 aa  236  6e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
502 aa  236  8e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.65 
 
 
605 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0569  FAD dependent oxidoreductase  31.71 
 
 
536 aa  234  3e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  34.89 
 
 
568 aa  234  4.0000000000000004e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.56 
 
 
554 aa  233  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0811  FAD dependent oxidoreductase  33.7 
 
 
542 aa  233  5e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2819  FAD dependent oxidoreductase  33.97 
 
 
531 aa  233  6e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.158053  normal  0.100824 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
502 aa  233  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.98 
 
 
583 aa  233  9e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.44 
 
 
502 aa  232  1e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.59 
 
 
591 aa  231  2e-59  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 
582 aa  231  3e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
639 aa  230  6e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1508  FAD dependent oxidoreductase  35.26 
 
 
548 aa  229  7e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  36.33 
 
 
603 aa  229  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  32.71 
 
 
557 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31 
 
 
581 aa  228  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05790  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.31 
 
 
587 aa  228  2e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.837912  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 
562 aa  228  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  36.42 
 
 
575 aa  227  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0868  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.56 
 
 
557 aa  227  4e-58  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0953137  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 
573 aa  227  4e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.86 
 
 
513 aa  227  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0378  FAD dependent oxidoreductase  35.23 
 
 
539 aa  227  5.0000000000000005e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.47 
 
 
500 aa  226  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.45 
 
 
567 aa  226  7e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 
567 aa  226  8e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.783415 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01396  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial (AFU_orthologue; AFUA_1G08810)  31.91 
 
 
700 aa  225  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00220943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1126  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.24 
 
 
560 aa  226  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000204459  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4232  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.44 
 
 
560 aa  225  1e-57  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159546  hitchhiker  0.000000074562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  34.92 
 
 
569 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0728  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.13 
 
 
530 aa  225  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166291 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0939  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.24 
 
 
560 aa  224  2e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000453053  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0526  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 
543 aa  225  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1677  FAD dependent oxidoreductase  32.76 
 
 
516 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000164822  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  31.19 
 
 
566 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  34.68 
 
 
574 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.47 
 
 
584 aa  225  2e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1196  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.44 
 
 
560 aa  225  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000405869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1067  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.44 
 
 
560 aa  225  2e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000136753  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  34.54 
 
 
600 aa  224  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 
567 aa  224  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0961  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.24 
 
 
560 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00186325  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  34.34 
 
 
572 aa  224  4e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1027  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.24 
 
 
560 aa  224  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1107  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, aerobic  28.24 
 
 
560 aa  224  4e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.58319e-29 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2616  FAD dependent oxidoreductase  32.05 
 
 
527 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  31.02 
 
 
519 aa  223  6e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0948  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  28.24 
 
 
560 aa  223  7e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  7.99901e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0487  FAD dependent oxidoreductase  33.76 
 
 
582 aa  223  9e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0836475  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  36.55 
 
 
576 aa  223  9.999999999999999e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2429  FAD dependent oxidoreductase  31.93 
 
 
519 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.765246  hitchhiker  0.000212597 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.42 
 
 
511 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0808  FAD dependent oxidoreductase  29.2 
 
 
560 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000105669  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.4 
 
 
546 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.42 
 
 
513 aa  221  3e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3375  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 
537 aa  221  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.61 
 
 
516 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.1 
 
 
491 aa  220  5e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.13 
 
 
514 aa  219  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0949  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 
560 aa  219  8.999999999999998e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000427543  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.67 
 
 
495 aa  218  1e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1192  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
571 aa  219  1e-55  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.261243  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30486  predicted protein  34.81 
 
 
602 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.349562  normal  0.801939 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1360  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.55 
 
 
573 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000254105  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
579 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1031  FAD dependent oxidoreductase  33.46 
 
 
529 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.334153  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1386  aerobic glycerol-3-phosphate dehydrogenase  29.55 
 
 
557 aa  218  2e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.806879  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.28 
 
 
507 aa  218  2e-55  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.71 
 
 
507 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  33.59 
 
 
583 aa  217  4e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  34.76 
 
 
577 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.64 
 
 
512 aa  216  9e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  34.36 
 
 
582 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  35.39 
 
 
595 aa  216  9.999999999999999e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>