More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3318 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3318  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 252 aa  509  1e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000065866  hitchhiker  0.00380995 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 248 aa  172  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  35.47 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 249 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 256 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 243 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 248 aa  158  7e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 256 aa  158  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 256 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 225 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  35.83 
 
 		 243 aa  151  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  36.68 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  35 
 
 		 260 aa  149  4e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  34.44 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 255 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  33.89 
 
 		 247 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  33.2 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0239  transcriptional regulator, GntR family  37.86 
 
 		 242 aa  135  5e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3733  transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 245 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.502794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0283  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.696412  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2906  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0169787  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3916  GntR family regulatory protein  34.33 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3808  GntR family regulatory protein  34.33 
 
 		 239 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1804  GntR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.582068 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.76 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00689  DNA-binding transcriptional dual regulator, fatty-acyl-binding  33.19 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.829969  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0777  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.19 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2926  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.19 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.594583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00678  hypothetical protein  33.19 
 
 		 240 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  35.71 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0649  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.19 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3874  GntR family regulatory protein  33.91 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.87 
 
 		 266 aa  123  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3977  GntR family regulatory protein  33.91 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0756  DNA-binding transcriptional repressor MngR  33.19 
 
 		 240 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3796  GntR family regulatory protein  33.91 
 
 		 239 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 241 aa  122  5e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1192  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 245 aa  122  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  33.87 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 239 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3508  GntR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 248 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1898  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000197182  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 244 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4030  putative transcriptional regulator, GntR family  36.02 
 
 		 246 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000148337  normal  0.107748 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2745  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 240 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 242 aa  116  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  31.67 
 
 		 270 aa  115  5e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  35.42 
 
 		 241 aa  115  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2432  GntR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0129  UbiC transcription regulator-associated domain protein  33.48 
 
 		 579 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.625714 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29 
 
 		 244 aa  114  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3472  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 238 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00483129  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2418  putative transcriptional regulator, GntR family  33.62 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 243 aa  112  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  32.39 
 
 		 278 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  30.85 
 
 		 195 aa  112  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 264 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 248 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0953  transcriptional regulator, GntR family  32.62 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 260 aa  112  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 242 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5560  putative transcriptional regulator, GntR family  34.32 
 
 		 247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4060  transcriptional regulator, GntR family  33.47 
 
 		 245 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.533333 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0513  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 288 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0204845 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0283  GntR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  28.02 
 
 		 232 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 252 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 239 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  28.82 
 
 		 235 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1710  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 245 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2758  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  32.33 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.37249  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.65 
 
 		 242 aa  109  5e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1535  transcriptional regulator  28.88 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.178039  normal  0.468584 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0376  transcriptional regulator, GntR family  31.95 
 
 		 252 aa  108  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  32.07 
 
 		 301 aa  108  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2301  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  33.97 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>