More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3314 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3314  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 550 aa  1083    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000111517  normal  0.0618764 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1069  FAD dependent oxidoreductase  50.28 
 
 		 556 aa  468  9.999999999999999e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3913  FAD dependent oxidoreductase  49.24 
 
 		 543 aa  451  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.490959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0079  FAD dependent oxidoreductase  48.78 
 
 		 545 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.656011  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3436  FAD dependent oxidoreductase  46.9 
 
 		 536 aa  416  9.999999999999999e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0404922  hitchhiker  0.0000473208 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2412  FAD dependent oxidoreductase  47.14 
 
 		 552 aa  397  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1198  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  45.99 
 
 		 551 aa  385  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0471  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 		 547 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2437  FAD dependent oxidoreductase  38.33 
 
 		 573 aa  263  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00112879 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0493  FAD dependent oxidoreductase  37.76 
 
 		 574 aa  256  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5123  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1671  FAD dependent oxidoreductase  34.79 
 
 		 576 aa  254  4.0000000000000004e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.80628 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2918  FAD dependent oxidoreductase  35.05 
 
 		 566 aa  252  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4251  FAD dependent oxidoreductase  37 
 
 		 577 aa  251  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5801  FAD dependent oxidoreductase  36.4 
 
 		 567 aa  250  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5159  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  32.56 
 
 		 582 aa  250  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5316  Glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.09 
 
 		 581 aa  249  6e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0265  FAD dependent oxidoreductase  35.8 
 
 		 569 aa  246  8e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.339178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2221  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.07 
 
 		 514 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0185895 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0626  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.5 
 
 		 567 aa  243  7e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3077  FAD dependent oxidoreductase  31.61 
 
 		 582 aa  242  1e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.725388  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2593  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.81 
 
 		 605 aa  240  5e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3608  FAD dependent oxidoreductase  31.9 
 
 		 562 aa  240  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23030  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.89 
 
 		 591 aa  240  5.999999999999999e-62  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4611  FAD dependent oxidoreductase  37.85 
 
 		 574 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.497063 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4217  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.57 
 
 		 513 aa  239  1e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4019  FAD dependent oxidoreductase  36.9 
 
 		 573 aa  238  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.147958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0560  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 603 aa  237  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000358551 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3637  FAD dependent oxidoreductase  36.7 
 
 		 584 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.256736  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1173  FAD dependent oxidoreductase  35.69 
 
 		 578 aa  236  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.994563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0016  FAD dependent oxidoreductase  36.26 
 
 		 562 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29940  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.64 
 
 		 583 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1006  FAD dependent oxidoreductase  37.24 
 
 		 576 aa  235  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.194481  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3955  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.48 
 
 		 495 aa  232  1e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4069  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.76 
 
 		 513 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.961718  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0315  FAD dependent oxidoreductase  36.8 
 
 		 603 aa  230  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4895  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.6 
 
 		 511 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0938  FAD dependent oxidoreductase  35.81 
 
 		 595 aa  229  7e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00411841  normal  0.908691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5604  FAD dependent oxidoreductase  35.2 
 
 		 593 aa  229  7e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.969598  hitchhiker  0.0026989 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2327  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.35 
 
 		 516 aa  229  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0272  FAD dependent oxidoreductase  36.68 
 
 		 639 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.688812  normal  0.0156592 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0391  FAD dependent oxidoreductase  36.09 
 
 		 582 aa  227  4e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452734  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13331  glycerol-3-phosphate dehydrogenase glpD2  35.29 
 
 		 585 aa  227  4e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.819547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0812  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.1 
 
 		 502 aa  227  5.0000000000000005e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1387  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.38 
 
 		 507 aa  226  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5038  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 575 aa  226  7e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.991443  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1250  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 579 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1267  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 579 aa  226  9e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1277  FAD dependent oxidoreductase  36.93 
 
 		 579 aa  226  1e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1799  FAD dependent oxidoreductase  34.26 
 
 		 582 aa  226  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2910  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.97 
 
 		 502 aa  225  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0293172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21330  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.96 
 
 		 554 aa  224  2e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.609696  normal  0.519106 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2580  FAD dependent oxidoreductase  34.18 
 
 		 579 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000016538 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1459  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.38 
 
 		 507 aa  224  4e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3289  FAD dependent oxidoreductase  34.55 
 
 		 582 aa  224  4.9999999999999996e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.398024  normal  0.023153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1363  FAD dependent oxidoreductase  34.87 
 
 		 579 aa  223  7e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.890822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5301  FAD dependent oxidoreductase  35.64 
 
 		 572 aa  223  9e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1090  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.55 
 
 		 514 aa  222  9.999999999999999e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0527  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 557 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1486  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  31.61 
 
 		 525 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0679435  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0865  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.89 
 
 		 502 aa  221  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2135  FAD dependent oxidoreductase  32.77 
 
 		 519 aa  221  3e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1987  FAD dependent oxidoreductase  32.9 
 
 		 616 aa  220  5e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000135882 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1975  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.33 
 
 		 509 aa  220  7e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2873  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 583 aa  220  7e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.186763  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0192  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.25 
 
 		 514 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2179  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.27 
 
 		 510 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.873983  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4065  FAD dependent oxidoreductase  34.4 
 
 		 567 aa  219  1e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.783415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06820  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.08 
 
 		 585 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2903  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.51 
 
 		 503 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2699  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.1 
 
 		 511 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.842303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0269  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.25 
 
 		 503 aa  218  2.9999999999999998e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2333  FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 		 546 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.489388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3907  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.15 
 
 		 512 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00244  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.68 
 
 		 512 aa  216  7e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.887264  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2250  FAD dependent oxidoreductase  33.21 
 
 		 600 aa  216  8e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.035515  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0200  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.05 
 
 		 503 aa  216  9e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6470  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.15 
 
 		 504 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.389192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1361  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.84 
 
 		 516 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1659  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.89 
 
 		 491 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0674401  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2018  FAD dependent oxidoreductase  34.35 
 
 		 581 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.523268 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1009  FAD dependent oxidoreductase  33.77 
 
 		 568 aa  214  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611314 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6051  FAD dependent oxidoreductase  32.33 
 
 		 552 aa  213  5.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2156  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.61 
 
 		 517 aa  213  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3733  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  34.26 
 
 		 500 aa  213  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3670  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 566 aa  212  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.234288  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4821  FAD dependent oxidoreductase  36.69 
 
 		 581 aa  212  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.929207  normal  0.0366818 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1102  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  38.58 
 
 		 509 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.889292  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4170  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.66 
 
 		 512 aa  211  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.631546  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5983  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.45 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5335  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.2 
 
 		 504 aa  211  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2531  FAD dependent oxidoreductase  35.11 
 
 		 391 aa  211  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.58896  normal  0.0803699 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1620  FAD dependent oxidoreductase  35.79 
 
 		 585 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117086 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2106  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.37 
 
 		 501 aa  211  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2385  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  35.81 
 
 		 513 aa  211  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.462359  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2890  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  33.33 
 
 		 532 aa  211  3e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.152299 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1004  glycerol-3-phosphate dehydrogenase (aerobic)  31.62 
 
 		 543 aa  210  6e-53  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.100601  normal  0.109273 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5324  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  37.04 
 
 		 503 aa  210  7e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.575956  normal  0.50041 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3045  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.99 
 
 		 525 aa  209  9e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.399591 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1827  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  36.84 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.17112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>