More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3297 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  42.84 
 
 
876 aa  651  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 
896 aa  748  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  56.19 
 
 
903 aa  910  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  60.35 
 
 
904 aa  1052  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 
876 aa  640  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  53.77 
 
 
886 aa  843  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
892 aa  881  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  66.06 
 
 
890 aa  1163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 
882 aa  650  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  53.84 
 
 
893 aa  838  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  53.85 
 
 
889 aa  908  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  59.57 
 
 
888 aa  1004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  41.6 
 
 
883 aa  652  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  42.08 
 
 
876 aa  670  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  56.17 
 
 
892 aa  960  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  48.94 
 
 
893 aa  766  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1433  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
863 aa  642  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
880 aa  664  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
892 aa  893  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  3.66282e-05 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  55.3 
 
 
892 aa  873  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  42.25 
 
 
892 aa  655  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.00247e-06  unclonable  3.09197e-08 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  58.43 
 
 
893 aa  960  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  53.95 
 
 
881 aa  856  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 
897 aa  1031  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  55.86 
 
 
898 aa  949  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.86953e-08 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1644  alanyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
881 aa  648  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.859756  normal  0.0937796 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 
902 aa  839  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  61.93 
 
 
898 aa  1049  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
878 aa  659  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  53.09 
 
 
890 aa  815  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  47.66 
 
 
894 aa  753  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  59.44 
 
 
897 aa  974  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  58.83 
 
 
885 aa  1004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  50.89 
 
 
897 aa  753  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  58.86 
 
 
890 aa  1020  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  54.15 
 
 
889 aa  884  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  53.16 
 
 
888 aa  857  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  61.32 
 
 
897 aa  1029  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  41.88 
 
 
880 aa  642  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  52.74 
 
 
895 aa  826  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  62.54 
 
 
898 aa  1046  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  42.17 
 
 
882 aa  638  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 
878 aa  652  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  1.49569e-05 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  55.03 
 
 
889 aa  885  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  54.46 
 
 
896 aa  850  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 
878 aa  650  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 
891 aa  1791  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  52.7 
 
 
895 aa  857  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  61.43 
 
 
897 aa  1031  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  60.09 
 
 
900 aa  1035  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  54.09 
 
 
889 aa  847  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  53.37 
 
 
895 aa  857  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
879 aa  660  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3180  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
876 aa  632  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  2.08446e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2820  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
876 aa  632  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  7.29274e-05  hitchhiker  2.729e-05 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1015  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
876 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00108503  hitchhiker  0.000252417 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  41.96 
 
 
876 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2980  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
876 aa  632  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  4.68314e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  42.02 
 
 
878 aa  631  1e-179  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2833  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
876 aa  631  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.53011e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02547  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
876 aa  631  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00107354  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 
867 aa  630  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0625  alanyl-tRNA synthetase  43.31 
 
 
868 aa  629  1e-179  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3944  alanyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 
876 aa  632  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000803556  normal  0.620679 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0992  alanyl-tRNA synthetase  41.79 
 
 
876 aa  631  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  7.77298e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02512  hypothetical protein  41.79 
 
 
876 aa  631  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00356315  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1590  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
864 aa  629  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.136396  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0951  alanyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 
854 aa  626  1e-178  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.197115  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
880 aa  628  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  40.07 
 
 
879 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0468  alanyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
880 aa  624  1e-177  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00473822  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
879 aa  623  1e-177  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  42.42 
 
 
880 aa  623  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1394  alanyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 
883 aa  624  1e-177  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  42.47 
 
 
875 aa  623  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3013  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
876 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.627309  decreased coverage  1.32365e-06 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3029  alanyl-tRNA synthetase  41.34 
 
 
876 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0315037  decreased coverage  3.67228e-05 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0222  alanyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
876 aa  625  1e-177  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3136  alanyl-tRNA synthetase  41.22 
 
 
876 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0299814  hitchhiker  0.000378627 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1387  alanyl-tRNA synthetase  40.74 
 
 
863 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1440  alanyl-tRNA synthetase  42.7 
 
 
874 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000329754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3565  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
875 aa  621  1e-176  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000341381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.14 
 
 
884 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1232  alanyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 
902 aa  619  1e-176  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.224866  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2978  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 
876 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.471212  decreased coverage  0.000181445 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
879 aa  622  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
876 aa  622  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
877 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 
877 aa  620  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3181  alanyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
879 aa  620  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  38.83 
 
 
886 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2946  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 
876 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00651312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2168  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 
884 aa  615  1e-174  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.176955  normal  0.0912251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
874 aa  613  1e-174  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2626  alanyl-tRNA synthetase  43.3 
 
 
891 aa  612  1e-174  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.643973  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 
886 aa  615  1e-174  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  39.46 
 
 
877 aa  612  1e-174  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.63922e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2598  alanyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
891 aa  613  1e-174  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.695693  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0620  alanyl-tRNA synthetase  38.2 
 
 
876 aa  615  1e-174  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  40.83 
 
 
874 aa  615  1e-174  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>