158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3267 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  100 
 
 		 538 aa  1071    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  49.8 
 
 		 521 aa  453  1.0000000000000001e-126  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  45.52 
 
 		 525 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  45.64 
 
 		 516 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  45.55 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  45.55 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  45.55 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  46.47 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  44.77 
 
 		 520 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  44.01 
 
 		 533 aa  372  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  44.03 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  44.03 
 
 		 508 aa  371  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  45.06 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  43.72 
 
 		 505 aa  362  9e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  44.35 
 
 		 505 aa  362  1e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  41.48 
 
 		 506 aa  320  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  39.26 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  38.24 
 
 		 541 aa  293  7e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  39.11 
 
 		 545 aa  292  1e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  39.12 
 
 		 508 aa  291  2e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  36.55 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  40.12 
 
 		 527 aa  285  2.0000000000000002e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  35.11 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  39.63 
 
 		 485 aa  280  6e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  38.79 
 
 		 515 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  35.86 
 
 		 522 aa  277  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  38.01 
 
 		 537 aa  274  4.0000000000000004e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  38.01 
 
 		 523 aa  272  1e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  36.84 
 
 		 507 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  34.35 
 
 		 524 aa  271  2e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  36.67 
 
 		 542 aa  271  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  39 
 
 		 540 aa  268  2e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  38.08 
 
 		 522 aa  267  4e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  35.21 
 
 		 546 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  37.4 
 
 		 495 aa  264  4e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  37.15 
 
 		 521 aa  261  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  36.69 
 
 		 542 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  39.16 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  35.88 
 
 		 500 aa  250  4e-65  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  35.47 
 
 		 525 aa  232  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  32.28 
 
 		 551 aa  226  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.73 
 
 		 535 aa  216  7e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  34.95 
 
 		 544 aa  211  3e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  31.84 
 
 		 476 aa  204  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  32.03 
 
 		 564 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2416  TAP domain-containing protein  31.1 
 
 		 505 aa  201  3.9999999999999996e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000258971  normal  0.152884 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  33.12 
 
 		 535 aa  200  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  30.84 
 
 		 504 aa  192  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  31.21 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1652  hypothetical protein  29.39 
 
 		 494 aa  191  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.916188  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  34.9 
 
 		 557 aa  189  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  33.54 
 
 		 571 aa  186  7e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  33.27 
 
 		 521 aa  186  8e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  31.98 
 
 		 547 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  30 
 
 		 532 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  29.63 
 
 		 499 aa  184  3e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  34.58 
 
 		 551 aa  182  9.000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  31.96 
 
 		 546 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  29.72 
 
 		 505 aa  181  4e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  31.06 
 
 		 506 aa  179  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  31.32 
 
 		 643 aa  178  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  28.43 
 
 		 504 aa  177  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  30.43 
 
 		 542 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  30.92 
 
 		 518 aa  169  9e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  28.49 
 
 		 515 aa  168  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  29.9 
 
 		 505 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  30.74 
 
 		 527 aa  161  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.01 
 
 		 478 aa  156  9e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  30 
 
 		 484 aa  155  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  29.57 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  29.47 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  29.79 
 
 		 504 aa  154  5e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  26.12 
 
 		 597 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  27.22 
 
 		 539 aa  150  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  28.45 
 
 		 555 aa  147  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  30.31 
 
 		 556 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  37.55 
 
 		 300 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  28.66 
 
 		 536 aa  140  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6090  TAP domain-containing protein  28.8 
 
 		 508 aa  140  7.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.305153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  33.01 
 
 		 597 aa  138  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  27.27 
 
 		 566 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  28.07 
 
 		 613 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  27.77 
 
 		 520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  29.25 
 
 		 499 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  28.19 
 
 		 486 aa  129  9.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  28.13 
 
 		 623 aa  127  5e-28  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  26.49 
 
 		 517 aa  126  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  28.16 
 
 		 493 aa  125  2e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  34.1 
 
 		 525 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 		 486 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  27.01 
 
 		 750 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2276  putative protease  29.89 
 
 		 524 aa  118  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.494839 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2750  TAP domain-containing protein  27.03 
 
 		 490 aa  115  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.51195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3650  TAP domain-containing protein  25.46 
 
 		 475 aa  113  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0804319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  27.36 
 
 		 559 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  31.25 
 
 		 542 aa  106  9e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05429  conserved hypothetical protein  28.53 
 
 		 600 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00467317  normal  0.0133715 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24000  alpha/beta hydrolase family protein  26.94 
 
 		 514 aa  104  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0638812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  26.5 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0265  TAP domain-containing protein  29.02 
 
 		 669 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0441544  normal  0.0338675 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>