218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3221 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3221  amidohydrolase  100 
 
 		 413 aa  814    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000000027233  hitchhiker  0.000156349 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2674  amidohydrolase  43.66 
 
 		 394 aa  252  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  38.71 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1522  amidohydrolase  35.14 
 
 		 429 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0533658 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10074  hypothetical protein  34.87 
 
 		 411 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0244263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  29.69 
 
 		 430 aa  146  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  29.67 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  29.88 
 
 		 441 aa  142  8e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  26.88 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  30.24 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  30.41 
 
 		 405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  28.64 
 
 		 431 aa  133  5e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.32 
 
 		 400 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0479  amidohydrolase  28.31 
 
 		 401 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  31.71 
 
 		 438 aa  122  9e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  30.54 
 
 		 459 aa  119  7.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  26.78 
 
 		 426 aa  116  7.999999999999999e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  28.04 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  30.98 
 
 		 440 aa  113  6e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  30.17 
 
 		 419 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  26.43 
 
 		 413 aa  112  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4125  amidohydrolase  27.98 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  27.67 
 
 		 431 aa  111  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  27.09 
 
 		 423 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2646  amidohydrolase  29.18 
 
 		 391 aa  109  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  29.24 
 
 		 430 aa  109  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  26.76 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  32 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  31.03 
 
 		 444 aa  107  3e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2115  amidohydrolase  29.57 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  28.37 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  29.88 
 
 		 423 aa  106  9e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2823  amidohydrolase  29.88 
 
 		 422 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.750141  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2609  amidohydrolase  28.14 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.36 
 
 		 433 aa  105  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.86 
 
 		 415 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  29.04 
 
 		 432 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  29.98 
 
 		 419 aa  103  4e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  28.07 
 
 		 432 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  29.88 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  29.88 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  29.88 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0331  Imidazolonepropionase  28.65 
 
 		 448 aa  102  9e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  29.14 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  29.74 
 
 		 419 aa  100  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.69 
 
 		 414 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  27.18 
 
 		 444 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1867  amidohydrolase  32.2 
 
 		 480 aa  100  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.445197  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  28.16 
 
 		 428 aa  98.6  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  28.95 
 
 		 440 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0935  amidohydrolase  27.51 
 
 		 428 aa  98.2  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.755972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  29.6 
 
 		 429 aa  97.4  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  30 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  28.39 
 
 		 455 aa  96.3  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  28.57 
 
 		 411 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  25.26 
 
 		 407 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  28.04 
 
 		 402 aa  95.5  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  27.96 
 
 		 421 aa  95.1  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  27.61 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  26.94 
 
 		 470 aa  94.4  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  26.41 
 
 		 437 aa  93.6  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  28.78 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  28.11 
 
 		 424 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  27.72 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3237  amidohydrolase  27.29 
 
 		 404 aa  91.7  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.136124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  27.96 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  28 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  28.15 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  28.15 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  28.15 
 
 		 417 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  30.73 
 
 		 397 aa  88.2  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  26.29 
 
 		 414 aa  89  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.33 
 
 		 410 aa  88.2  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  27.21 
 
 		 432 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  29.68 
 
 		 418 aa  86.7  7e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  25.8 
 
 		 478 aa  86.7  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  26.09 
 
 		 409 aa  86.7  8e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  27.74 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2139  amidohydrolase  29.89 
 
 		 408 aa  86.3  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.018924 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  25.59 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  27.79 
 
 		 421 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1060  amidohydrolase  28.38 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000132044 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1219  amidohydrolase  27.71 
 
 		 390 aa  84.7  0.000000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.82253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  28.3 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  27.75 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  25.3 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.32 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  28.68 
 
 		 425 aa  82.8  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4905  amidohydrolase  32.7 
 
 		 381 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0270368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  25.52 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  26.03 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  28.38 
 
 		 426 aa  81.3  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  28.25 
 
 		 413 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3036  amidohydrolase  26.4 
 
 		 407 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4855  amidohydrolase  27.46 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.165345  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  31.38 
 
 		 405 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4565  amidohydrolase  27.68 
 
 		 423 aa  79.7  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.244661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  26.3 
 
 		 411 aa  79.7  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23760  amidohydrolase, imidazolonepropionase  29.33 
 
 		 378 aa  79.7  0.00000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.318525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>