More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3196 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3196  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 
212 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000467207  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4001  lipoprotein signal peptidase  48.95 
 
 
195 aa  175  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.743504  normal  0.983815 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11572  lipoprotein signal peptidase  48.76 
 
 
224 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5747  lipoprotein signal peptidase  55.61 
 
 
254 aa  170  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3640  lipoprotein signal peptidase  47.87 
 
 
272 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27280  lipoprotein signal peptidase  56.38 
 
 
207 aa  169  4e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.097176  normal  0.384801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2996  lipoprotein signal peptidase  49.75 
 
 
219 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3249  lipoprotein signal peptidase  53.06 
 
 
238 aa  167  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.620504  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2773  lipoprotein signal peptidase  47.74 
 
 
234 aa  156  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.119467  normal  0.677006 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3113  lipoprotein signal peptidase  53.37 
 
 
230 aa  151  8e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.719311  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2912  peptidase A8 signal peptidase II  54.14 
 
 
193 aa  149  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000001174  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3428  lipoprotein signal peptidase  47.76 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.319038  decreased coverage  0.00618792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5736  lipoprotein signal peptidase  50.86 
 
 
291 aa  141  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3189  lipoprotein signal peptidase  43.68 
 
 
197 aa  141  9e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.317235 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3202  lipoprotein signal peptidase  48.69 
 
 
232 aa  139  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.863863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1425  lipoprotein signal peptidase  48.9 
 
 
201 aa  137  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.646743  normal  0.0381743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5087  lipoprotein signal peptidase  50.31 
 
 
243 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00915922  hitchhiker  0.000534801 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0911  lipoprotein signal peptidase  42.61 
 
 
204 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3093  lipoprotein signal peptidase  54.48 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.280943  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3153  lipoprotein signal peptidase  54.48 
 
 
230 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.296321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1419  lipoprotein signal peptidase  58.49 
 
 
165 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.137933 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1122  signal peptidase II  46.07 
 
 
182 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.186088  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2882  lipoprotein signal peptidase  50.9 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.859985  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1031  signal peptidase II  52.83 
 
 
182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0513962  normal  0.0206613 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3053  peptidase A8, signal peptidase II  42.95 
 
 
198 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.507002  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2402  lipoprotein signal peptidase  41.22 
 
 
213 aa  119  4.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.372724 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16470  lipoprotein signal peptidase  40.8 
 
 
207 aa  117  9e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.384825  normal  0.0671311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2628  lipoprotein signal peptidase  50.89 
 
 
182 aa  116  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.191199  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  45.45 
 
 
167 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2565  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 
150 aa  103  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.958403 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22710  lipoprotein signal peptidase  43.28 
 
 
227 aa  101  7e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.52944  normal  0.101415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 
169 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  44.22 
 
 
169 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1293  lipoprotein signal peptidase  40.61 
 
 
210 aa  99.8  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248018  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1580  lipoprotein signal peptidase  40.24 
 
 
190 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0140  lipoprotein signal peptidase  35.9 
 
 
182 aa  97.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0759445  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  44.29 
 
 
170 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1579  lipoprotein signal peptidase  40.83 
 
 
188 aa  95.5  5e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0479337  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  39.33 
 
 
169 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1287  lipoprotein signal peptidase  39.85 
 
 
149 aa  93.2  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0748457  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  41.88 
 
 
173 aa  92.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10890  lipoprotein signal peptidase  37.06 
 
 
204 aa  90.1  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0587746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  42.18 
 
 
168 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 
163 aa  89.4  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  38.96 
 
 
164 aa  89  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4229  lipoprotein signal peptidase  38.01 
 
 
168 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.266217  hitchhiker  0.00107188 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0482  lipoprotein signal peptidase  40.26 
 
 
181 aa  89  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  42.03 
 
 
155 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  43.57 
 
 
176 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  43.57 
 
 
171 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  43.88 
 
 
171 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13510  signal peptidase II  41.83 
 
 
156 aa  86.7  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.376411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  33.54 
 
 
171 aa  86.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  40.67 
 
 
178 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3045  lipoprotein signal peptidase  37.97 
 
 
159 aa  85.9  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  31.58 
 
 
182 aa  86.3  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  39.46 
 
 
169 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2886  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 
178 aa  85.5  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0556168  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  33.33 
 
 
162 aa  84.7  8e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  42.45 
 
 
171 aa  85.1  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  31.93 
 
 
176 aa  85.1  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1366  lipoprotein signal peptidase  42.22 
 
 
154 aa  84.7  9e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000537367  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  35.29 
 
 
164 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  31.07 
 
 
170 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  31.07 
 
 
170 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  31.07 
 
 
170 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  29.83 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1116  signal peptidase II  36.36 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  34.05 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 
171 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 
171 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0909  lipoprotein signal peptidase  34.23 
 
 
151 aa  82  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.184208  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  32.93 
 
 
171 aa  82  0.000000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2046  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
193 aa  81.6  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2615  signal peptidase II  35.67 
 
 
173 aa  81.6  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2538  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.544386  hitchhiker  0.00000408677 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1902  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0609  lipoprotein signal peptidase  39.86 
 
 
163 aa  80.9  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.242758  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2889  lipoprotein signal peptidase  30.91 
 
 
170 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0332011  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  32.32 
 
 
171 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2513  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142589  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1345  lipoprotein signal peptidase  33.93 
 
 
178 aa  80.1  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1267  lipoprotein signal peptidase  35.1 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131578  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.06 
 
 
157 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2431  lipoprotein signal peptidase  37.58 
 
 
166 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.470208  hitchhiker  0.00000000640597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2560  lipoprotein signal peptidase  38.26 
 
 
166 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  33.53 
 
 
161 aa  80.5  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  34.78 
 
 
160 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0782  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000363425 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1126  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 
174 aa  79  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1034  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2243  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.551645  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1121  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.458352  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0970  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2659  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.261426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  35.03 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  29.61 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2113  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0966  lipoprotein signal peptidase  36.91 
 
 
166 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4058  lipoprotein signal peptidase  40.96 
 
 
169 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.113935  normal  0.943732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>