More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3144 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  100 
 
 
304 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  67.47 
 
 
324 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  65.12 
 
 
324 aa  375  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  67.94 
 
 
312 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  58.17 
 
 
300 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  56.36 
 
 
281 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.14 
 
 
286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50.34 
 
 
301 aa  260  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  49.83 
 
 
301 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  48.96 
 
 
280 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  51.39 
 
 
297 aa  239  4e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.97 
 
 
284 aa  238  9e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  49.13 
 
 
284 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  49.15 
 
 
301 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  49.49 
 
 
289 aa  231  9e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  47.46 
 
 
276 aa  227  2e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  45.67 
 
 
285 aa  227  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  46.6 
 
 
282 aa  225  9e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  47.4 
 
 
317 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  45.58 
 
 
290 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.45 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  48.26 
 
 
294 aa  212  5.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.37 
 
 
304 aa  188  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
308 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  44.81 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
299 aa  181  1e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.57 
 
 
308 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  46.93 
 
 
309 aa  179  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  39.42 
 
 
304 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  47.11 
 
 
314 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  47.37 
 
 
321 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  44.54 
 
 
312 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.97 
 
 
310 aa  176  3e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  45.18 
 
 
315 aa  175  7e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  45.78 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.18 
 
 
300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  33.33 
 
 
283 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  41.78 
 
 
305 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  43.83 
 
 
310 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  37.72 
 
 
353 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  43.83 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  43.83 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  44.26 
 
 
319 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  32.69 
 
 
300 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  46.22 
 
 
302 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  43.48 
 
 
302 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.11 
 
 
347 aa  170  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  34.09 
 
 
305 aa  170  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  43.1 
 
 
309 aa  170  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.56 
 
 
326 aa  170  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
314 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  43.67 
 
 
331 aa  169  4e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  36.1 
 
 
300 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  31.94 
 
 
300 aa  169  5e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  31.83 
 
 
308 aa  169  7e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.8 
 
 
322 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  31.41 
 
 
300 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  31.75 
 
 
300 aa  167  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
301 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  32.69 
 
 
300 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.3 
 
 
310 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  32.37 
 
 
300 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  31.83 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  31.73 
 
 
300 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  44.35 
 
 
308 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.11 
 
 
295 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  41.18 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
246 aa  166  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.15 
 
 
310 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.13 
 
 
324 aa  166  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  42.92 
 
 
322 aa  166  5e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  34.67 
 
 
305 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  44.39 
 
 
374 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  35.03 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.95 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
333 aa  163  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.08 
 
 
319 aa  163  3e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  34.33 
 
 
301 aa  163  3e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  39.83 
 
 
311 aa  163  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.32 
 
 
307 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  43.15 
 
 
313 aa  162  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  44.34 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  43.87 
 
 
322 aa  162  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  43.23 
 
 
319 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  42.99 
 
 
388 aa  162  5.0000000000000005e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  41.28 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
310 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.3 
 
 
362 aa  161  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  41.23 
 
 
253 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  32.05 
 
 
299 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.59 
 
 
321 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  35.08 
 
 
303 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.78 
 
 
327 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.84 
 
 
321 aa  159  6e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.26 
 
 
325 aa  159  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.51 
 
 
323 aa  159  7e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  35.64 
 
 
308 aa  158  8e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  42.49 
 
 
342 aa  158  9e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>