19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3118 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  100 
 
 
594 aa  1102    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  50 
 
 
617 aa  458  1e-127  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  51.94 
 
 
616 aa  438  1e-121  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  50.2 
 
 
579 aa  375  1e-102  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  47.14 
 
 
598 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  36.68 
 
 
644 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  43.65 
 
 
534 aa  295  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  41.75 
 
 
628 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  35.11 
 
 
654 aa  274  4.0000000000000004e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  31.95 
 
 
644 aa  261  3e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  42.81 
 
 
676 aa  223  9.999999999999999e-57  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  30.94 
 
 
504 aa  199  1.0000000000000001e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  35.12 
 
 
286 aa  159  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.67 
 
 
537 aa  138  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  28.47 
 
 
460 aa  128  3e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  52.31 
 
 
592 aa  128  3e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  36.33 
 
 
762 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  41.21 
 
 
371 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  42.38 
 
 
742 aa  100  7e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>