15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3036 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3036  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  248  3e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000373375  normal  0.010036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35910  hypothetical protein  47.78 
 
 
198 aa  77.8  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.469138 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3932  hypothetical protein  67.92 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.938886 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0763  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00564104  hitchhiker  0.0000763361 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3439  hypothetical protein  46 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000000342472  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4928  hypothetical protein  46 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000124086  normal  0.0470528 
 
 
 
NC_010515  Bcenmc03_5359  hypothetical protein  46 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000208864  normal  0.10332 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2800  Ankyrin  41.51 
 
 
457 aa  54.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0690  hypothetical protein  32.63 
 
 
173 aa  54.3  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00322285  hitchhiker  0.0000000380413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1984  hypothetical protein  45.24 
 
 
55 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0827  putative transmembrane protein  44.68 
 
 
68 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.179582  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0130  hypothetical protein  32.88 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.47868  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0898  hypothetical protein  42.55 
 
 
68 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318072  normal  0.671417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1582  Serine/threonine protein kinase-related protein  57.14 
 
 
527 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.278866  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0214  hypothetical protein  40.54 
 
 
80 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.508022 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>