More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3005 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3005  histidine kinase  100 
 
 		 386 aa  754    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188406  hitchhiker  0.0000457887 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1938  histidine kinase  37.71 
 
 		 363 aa  200  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4573  histidine kinase  39 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159455  normal  0.0817819 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0289  putative two-component system sensor kinase  47.42 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.159302  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4752  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.25 
 
 		 393 aa  157  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.251085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0194  putative signal transduction histidine kinase  38.99 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.141704 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1721  histidine kinase  45.7 
 
 		 399 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0184  putative signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709555  normal  0.941469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0287  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  45.61 
 
 		 370 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.260696  normal  0.144944 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1623  histidine kinase  46.45 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244207  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06330  signal transduction histidine kinase  45.41 
 
 		 399 aa  152  8e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0323  putative signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 359 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3817  putative signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 		 359 aa  150  3e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3620  putative signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 		 359 aa  150  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4837  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.17 
 
 		 420 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.264093  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0352  sensor histidine kinase, putative  29.64 
 
 		 359 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2958  histidine kinase  44.44 
 
 		 405 aa  144  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00418093  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0348  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 359 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0346  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.35429  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0353  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.68 
 
 		 359 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1587  histidine kinase  38.17 
 
 		 439 aa  144  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.230024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01000  signal transduction histidine kinase  34.49 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5480  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.33 
 
 		 404 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.500623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0356  histidine kinase  36.18 
 
 		 359 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143013  decreased coverage  0.0000000113905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.69 
 
 		 404 aa  140  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 363 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3474  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  34.26 
 
 		 354 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0906  histidine kinase  41.35 
 
 		 381 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.394153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2064  histidine kinase  38.16 
 
 		 400 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.673954 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0358  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  29.79 
 
 		 364 aa  132  9e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1265  histidine kinase  37.21 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.99067 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1896  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  34.21 
 
 		 391 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1640  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 		 369 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03850  signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 		 418 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147645  normal  0.231181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2769  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  34.08 
 
 		 786 aa  127  3e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0092  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.46 
 
 		 726 aa  125  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0504  histidine kinase  42.79 
 
 		 407 aa  125  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.991268 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11520  Histidine kinase  43.37 
 
 		 364 aa  123  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.10079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4056  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.23 
 
 		 351 aa  123  7e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.022218 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4590  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.85 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000214794 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3872  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 		 376 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0238476  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0762  histidine kinase  32.62 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.332583 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5483  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5151  histidine kinase  30.09 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5035  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5051  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5445  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5201  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5598  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3533  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  37.44 
 
 		 369 aa  115  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03390  signal transduction histidine kinase  40.68 
 
 		 388 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02860  signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5476  sensor histidine kinase  30.56 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.412372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1679  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.77 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal  0.594324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5532  sensor histidine kinase  29.63 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3821  sensor histidine kinase, putative  31.84 
 
 		 380 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5476  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 376 aa  113  5e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.324928  hitchhiker  0.0000000000347721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1667  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.96 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.572616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0117  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  29.02 
 
 		 382 aa  113  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0493339  normal  0.135679 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8145  Signal transduction histidine kinase-like protein  37 
 
 		 581 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.876501  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.38 
 
 		 389 aa  110  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.13648 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0654  histidine kinase  36.65 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0690  histidine kinase dimerisation and phosphoacceptor region  38.77 
 
 		 699 aa  107  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 		 425 aa  104  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 		 382 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02210  signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0589  histidine kinase  43.75 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.307449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16240  signal transduction histidine kinase  46.31 
 
 		 408 aa  100  3e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.429357  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0527  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 310 aa  100  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06610  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 404 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7438  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.74 
 
 		 744 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3655  histidine kinase  34.23 
 
 		 611 aa  99.8  7e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00917925 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5629  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 		 392 aa  99.4  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.948957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6050  histidine kinase  34.6 
 
 		 442 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01310  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 421 aa  96.3  7e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.192062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2544  putative signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 		 363 aa  95.9  1e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  37.14 
 
 		 401 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03364  sensor histidine kinase, putative  32.22 
 
 		 422 aa  95.5  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.43 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.254929 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0284  histidine kinase dimerization and phosphoacceptor region  35.93 
 
 		 443 aa  94.7  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2473  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 391 aa  94.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506045  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0522  histidine kinase  38.94 
 
 		 399 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1952  histidine kinase  33.48 
 
 		 442 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.107161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2803  histidine kinase  34.88 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.367455 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0888  sensor histidine kinase, putative  25.49 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000307966  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4434  histidine kinase  34.39 
 
 		 369 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.584475  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0111  histidine kinase  35.35 
 
 		 372 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04460  two-component system sensor protein  34.62 
 
 		 378 aa  91.7  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4365  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 		 468 aa  90.9  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.665132  normal  0.714097 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0646  histidine kinase  32.66 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.411945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.07 
 
 		 398 aa  90.9  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2036  histidine kinase  28.9 
 
 		 381 aa  90.9  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.103366 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20450  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 441 aa  90.5  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0107895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0682  histidine kinase  32.35 
 
 		 433 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.29384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1783  histidine kinase  35.24 
 
 		 430 aa  90.1  5e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000910041 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3600  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.242845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1551  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.538677  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4333  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.08 
 
 		 458 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.494897  normal  0.710238 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1291  sensor histidine kinase  23.95 
 
 		 364 aa  88.2  2e-16  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000227861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>