33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2972 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2972  membrane protein-like protein  100 
 
 		 401 aa  774    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211258  normal  0.0161367 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2550  protein of unknown function DUF939  29.13 
 
 		 432 aa  109  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8385  protein of unknown function DUF939  28.67 
 
 		 415 aa  107  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.652898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2756  membrane protein-like protein  32.03 
 
 		 427 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2072  membrane protein-like protein  28.99 
 
 		 419 aa  89  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000107578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4888  membrane protein-like protein  30.73 
 
 		 497 aa  81.6  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05220  hypothetical protein  29.24 
 
 		 366 aa  80.1  0.00000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4561  membrane protein  30.13 
 
 		 391 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2089  membrane protein  28.7 
 
 		 409 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12591  hypothetical protein  25.26 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.168318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0274  membrane protein-like protein  27.46 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.024335 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1894  membrane protein-like protein  29.05 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2147  membrane protein-like protein  23.32 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0231192  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0515  hypothetical protein  29.41 
 
 		 388 aa  54.3  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0317  membrane protein-like protein  30.26 
 
 		 425 aa  53.9  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0942874  hitchhiker  0.000244181 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3085  membrane protein-like protein  25.67 
 
 		 373 aa  53.9  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000157468 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07150  predicted membrane protein  30.81 
 
 		 392 aa  52.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.269027 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0479  hypothetical protein  25.6 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0445  hypothetical protein  29.81 
 
 		 369 aa  51.2  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.379085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8716  membrane protein-like protein  28.83 
 
 		 365 aa  50.4  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3973  hypothetical protein  29.41 
 
 		 341 aa  50.4  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.215582  hitchhiker  0.00962889 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5891  membrane protein-like protein  26.99 
 
 		 371 aa  50.4  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5223  membrane protein-like protein  25.33 
 
 		 348 aa  50.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4060  membrane protein-like protein  30.23 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.270426  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0385  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0370  hypothetical protein  28.57 
 
 		 347 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.168954  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2813  hypothetical protein  28 
 
 		 431 aa  47.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01600  hypothetical protein  26.6 
 
 		 389 aa  46.6  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2373  membrane protein-like protein  30.07 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25710  predicted membrane protein  26.03 
 
 		 443 aa  44.7  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3171  hypothetical protein  29.41 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6914  hypothetical protein  31.97 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0118  hypothetical protein  30.32 
 
 		 367 aa  43.9  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>